Существовали и транспортные варианты В-25. Серийно их не строили, все они являлись переделками бомбардировщиков различных модификаций. Да и было их немного. Для первого транспортного «Митчелла» использовали планер головного серийного самолета. До ноября 1942 г. эта машина служила для различного рода испытаний, а затем ее решили превратить в транспортник. Все вооружение сняли, остекление носовой части зашили листами металла. Пассажирский салон на пять мест оборудовали в хвосте самолета, прорезав по бортам прямоугольные окна. Еще два кресла установили перед бомбоотсеком, за местами пилотов. Сам бомбоотсек приспособили под багаж. Эта машина осталась на заводе как служебный самолет «Норт Америкэн». 8 января 1945 г. она разбилась при посадке, когда одна из стоек шасси не встала на замок в выпущенном положении.
Подобным образом позднее переоборудовали еще несколько бомбардировщиков. Два из них сделали для начальника штаба ВВС генерала Эрнолда. Основой для первого послужил В-25, для второго — B-25J. В феврале 1944 г. еще один B-25J превратили в персональный самолет генерала Д. Эйзенхауэра, командовавшего тогда войсками союзников в Европе. На нем имелось спальное место в проходе над бомбоотсеком, который существенно уменьшили по высоте. Весь бывший бомбоотсек занял большой протестированный бензобак. В задней части фюзеляжа для генерала оборудовали туалет и даже предусмотрели установку складной ванны. Персональные самолеты имели улучшенное приборное и радиооборудование, неотъемлемой частью которого являлся узел специальной связи. Эти три машины числились в ВВС под обозначением RB-25.
Один из самолетов Эрнолда после войны списали по износу, второй летал до 1972 г., но уже как гражданский — обслуживал руководящих работников крупных компаний. «Лимузин» Эйзенхауэра использовался в ВВС как транспортный до 1959 г. Сейчас он стоит в музее.
Первые годы после войны некоторое количество разоруженных В-25 (под обозначением СВ-25) эксплуатировала военно-транспортная авиация. Никакому дополнительному переоборудованию, кроме демонтажа стрелкового и бомбового вооружения, они не подвергались.
В конце 1945 г. «Норт Америкэн» в рамках технического задания на учебно-тренировочный бомбардировщик и транспортный самолет на 10 мест предложила проект переделки для этих целей B-25J. Была подготовлена документация на три учебных варианта и один транспортный. У всех носовую часть фюзеляжа расширили, сдвинув пилотскую кабину вперед. От кабины бомбардира отказались. В варианте для обучения штурманов экипаж состоял из двух летчиков, инструктора и четырех курсантов. Каждое рабочее место у последних отличалось по оборудованию и предназначалось для освоения разных способов навигации. У машины для подготовки бомбардиров экипаж оставался таким же, но все четыре курсанта располагали одним и тем же оснащением. Самолет нес восемь бомб по 45 кг на наружной подвеске и еще девять — в бомбоотсеке. Вариант для тренировки летчиков предусматривал только четыре места: два пилотских, а за ними — кресла для инструктора и еще одного курсанта. У транспортной машины шесть пассажиров размещались в бывшем бомбоотсеке и четыре — ближе к хвосту.
Фирма выкупила стоявший на консервации B-25J и превратила его в опытный образец новой машины. Ее оснастили в транспортном варианте. 15 февраля 1950 г. она успешно совершила первый полет. А 25 марта, во время демонстрационного тура по США, самолет попал в шторм и разбился неподалеку от г. Феникс. Находившиеся на борту семь человек погибли. После этого продать военным свою переделку «Норт Америкэн» не удалось.
Использовали «Митчеллы» в послевоенный период и для учебных целей. Сразу после окончания боевых действий 60 бомбардировщиков без существенных переделок превратили в учебные АТ-24. Подварианты А, В, С и D означали, что взяты были машины модификаций D, G, С и J соответственно. В 1947 г. их переименовали в ТВ-25 (также с буквами D, G, С и J).
В апреле — декабре 1952 г. 72 самолета типа B-25J были доработаны фирмой «Хэйс эйркрафт» под названием TB-25L. С них сняли все вооружение и броню, модернизировали приборное оснащение, кислородное и радиооборудование, несколько изменили остекление пилотской кабины, поставили семь пассажирских кресел, вновь ввели аварийный механический выпуск шасси. Эти машины служили в летных школах как учебные и легкие транспортные. С ноября 1953 по декабрь 1954 г. «Хэйс» переделала еще 380 машин в TB-25N, практически аналогичных типу L. Позднее их число довели до 627.
Этому же заводу в 1950 г. заказали 12 самолетов ТВ-25К для подготовки операторов РЛС, отслеживающих полеты ракет. Антенну РЛС разместили в носовой части самолета, а всю электронику — в бывшем бомбоотсеке. Над кабиной штурмана сделали большой наблюдательный блистер. Переделка оказалась удачной, и в общей сложности выпустили 117 самолетов ТВ-25К. Существовал также аналогичный по назначению ТВ-25М. 35 таких машин, отличавшихся только более совершенным оборудованием, переделали из ТВ-25К. После окончания Второй мировой войны большое количество В-25 выставили на свободную продажу — в ВВС их сочли лишними. Исправный B-25J стоил всего 8250 долларов. Их покупали в основном для переделки в служебные самолеты. На них перевозили специалистов и оборудование. Некоторые «Митчеллы» превратили в летающие испытательные лаборатории. Например, фирма «Хьюз» опробовала в воздухе новые авиационные радиолокаторы, а «Бендикс» — приборы. В 1951 г. на бывшем В-25Н испытывали носовую стойку шасси для реактивного истребителя F-101 «Буду». Несколько машин переделали в противопожарные самолеты. Они получили баки для воды и специальных химикатов, а также устройства для их разбрызгивания. Такие самолеты тушили лесные пожары в штатах Орегон и Аризона.