В послевоенные годы борьба трех пограничных территорий за выживание в качестве независимых государств вращалась вокруг трех вопросов. Во-первых, их взаимоотношения по-прежнему были сосредоточены на территориальных спорах, сопровождавшихся пограничными войнами. Во-вторых, их экономическая жизнеспособность продолжала ухудшаться, поскольку они не могли оправиться от шока, вызванного тем, что оказались отрезанными от интегрированного имперского рынка и системы коммуникаций. В-третьих, отсутствие адекватных средств самозащиты вынуждало их искать защиты у внешних сил, втягивая их все глубже в Гражданскую войну в России и осложняя их отношения с республиканской Турцией, Советской Россией и имперской Великобританией.
Главная, если не единственная, ссора между Арменией и Грузией разгорелась из-за Борчальского района в Тифлисской области. Как это часто бывало в притязаниях на приграничные территории, противоположные стороны апеллировали к двум непримиримым принципам суверенитета: этническому (армянский) и историческому (грузинский). Хотя армяне составляли большинство населения, район когда-то находился под властью грузинских царей и административно входил в состав Тифлисской губернии, которую грузины считали частью своей национальной родины в составе Российской империи. На закате Первой мировой войны Центральные державы не смогли разрешить территориальный спор вокруг этой территории. После их ухода грузинские войска заняли большую часть Тифлисской губернии. Армяне переместились в южную часть провинции, и все было готово к столкновению. В декабре 1918 года недовольство грузинскими оккупационными войсками переросло в восстание, и регулярные армянские войска присоединились к своим соотечественникам. Боевые действия быстро нарастали. Очевидно, что армяне рассчитывали на поддержку союзников, но были жестоко разочарованы британскими посредниками, которые вернули ситуацию к статус-кво ante bellum. Бои прекратились, но горечь осталась. Грузины использовали этот конфликт как предлог для ареста, изгнания и конфискации имущества сотен армян в Тифлисе, положив начало массовому исходу, который превратит город в грузинскую столицу, населенную грузинами. Для двух республик оказалось невозможным объединиться против надвигающейся с севера бури.
В центре конфликта между Арменией и Азербайджаном находились два горных района Елизаветпольской губернии - Карабахский и Зангезурский. Обе республики считали эти районы жизненно важными для безопасности своих границ, и обе выдвигали исторические претензии на этот регион. Население Карабаха делилось примерно на 165 000 человек.
, 59 000 мусульман и 7 000 русских. Этническая смесь еще более усложнялась расположением курдско-татарских деревень, разделявших армянское население горного Карабаха и низменности. Претензии мусульман основывались как на экономических, так и на стратегических факторах. Их пастушеская экономика зависела от контроля над горными землями. Армяне зависели от Баку в плане поставок по основным дорогам района. Тысячи армян были заняты сезонной или постоянной работой на бакинских нефтепромыслах. В Зангезуре армяне доминировали на центральных нагорьях, хотя в целом по округу мусульмане превосходили их численностью 120 000 человек против 101 000. Армяне и мусульмане района сохраняли осторожное сосуществование до тех пор, пока не появилась османская армия, направлявшаяся для захвата Баку. Ее командующий поддержал притязания Азербайджана. Армянские села оказали сопротивление, и к лету 1918 года началась междоусобная война.
Тупиковая ситуация в войне была нарушена после ухода османской армии и вмешательства англичан. Озабоченность по поводу отчуждения мусульманского населения Индии и заинтересованность в эксплуатации нефтяных запасов Баку склонили британцев в пользу притязаний Азербайджана. Армяне были вынуждены уступить контроль над Карабахом в соглашении, щедро сдобренном обещаниями местной автономии, но Зангезур устоял. Военное решение проблемы было впоследствии закреплено советским правительством при установлении границ южнокавказских социалистических республик. Но это не положило конец борьбе, которая усилилась, когда в 1989 году рухнула советская власть, и Карабах вновь стал объектом ожесточенного противостояния между двумя независимыми республиками - Арменией и Азербайджаном.