Пройдет время, но об этом таинственном убийстве не забудут. Выдвинут различные предположения. Одним из наиболее правдоподобных кажется то, по которому в убийстве обвиняется бывший муж Барбары Эрколе Бентивольо — молодая женщина сбежала от него из-за грубого отношения. Разъяренный тем, что он лишался приданого Барбары и имущества, полагавшегося его детям, Эрколе мог бы подтолкнуть к мести Джана Галеаццо Сфорца — супруга одной из его дочерей. Вполне вероятно, что они решили наказать Барбару через ее любовника. Исполнителя мог указать Алессандро Пио — муж Анджелы Борджиа. Пио был связан с Мазино дель Форно — шпионом, который до этого пытался заманить Гонзагу в ловушку и вполне мог быть убийцей Строцци. Но нельзя было выдвинуть обвинение против этого человека, не раскрыв особые услуги, которые он оказывал герцогу. Альфонс знал о намерениях Бентивольо и Сфорца. Ему оставалось только дать свое согласие. Убийство Строцци очень своевременно избавляло его от шпиона маркиза Мантуанского, и в то же время со смертью посредника прекращалась любовная переписка между Лукрецией и Франциском де Гонзагой. Через несколько лет Поль Жов напишет, что было совершенно ясно, что «судья не захотел знать виновных». Ужас сковал уста.
Лукреция была очень опечалена убийством своего доверенного человека, однако она достаточно быстро приходит в себя. Она осмеливается снова завязать отношения с Гонзагой, но теперь посредником становится Лоренцо — один из братьев Эрколе Строцци. И снова переписка ведется на особом языке: «сокол» означает любовь, а «сокольничий» — это Лукреция. Лукреция пытается развеять свое горе в путешествиях. На лето она отправляется в Реджо, где встречается с поэтом Бернардо Акколти, или Аретино, — когда-то она покровительствовала ему в Риме во времена своего брака с герцогом де Бисельи. В сентябре возвращается в Феррару, так и не увидевшись с Гонзагой. Маркиз, как и его шурин Альфонс, захвачен вихрем войны. 10 декабря 1508 года в Камбре образовалась лига, направленная против Венеции. В нее входят Франция, Англия и император Максимилиан. Юлий II, не сумевший заставить венецианцев вернуть города Романьи, которые они заняли после падения Чезаре Борджиа, примкнул к этой лиге 23 марта 1509 года. В нее уже вступил Альфонс д’Эсте. Он надеется, что сможет отбить у Венеции Полезину — область Ровиго, на которую претендует Феррара. Франциск де Гонзага тоже присоединился к союзу. Он рассчитывает вернуть земли, расположенные вокруг озера Ла Гарда.
Начало кампании оказывается благоприятным. Чтобы иметь возможность использовать лучшую в Италии артиллерию Феррары, Юлий II назначает Альфонса д’Эсте знаменосцем Церкви. Когда герцог уезжает на войну, Лукреция берет на себя бразды правления, ей помогает совет из десяти граждан. Она увлеченно следит за продвижением войск. Огромное венецианское войско в 50 000 человек разбито после четырехдневного сражения при Аньяделе 14 мая 1509 года. Но Франциск де Гонзага, уже после победы захвативший земли Венеции, взят в плен 9 августа, закован в цепи и отправлен в Венецию. Толпа встречает его насмешками: «Крыса в клетке! Турко (военный клич Гонзагов) схвачен! Повесить предателя!»
Огорченная этой неприятностью Лукреция, очень слабая из-за новой беременности, старается помочь пленнику насколько это в ее силах.
Следующие месяцы оказались более удачными. 25 августа герцогиня родила красивого мальчика, который впоследствии станет Ипполитом II д’Эсте. В декабре она радуется, что ее муж и деверь кардинал смогли остановить на реке По венецианский флот, который, двигаясь по течению, опустошал все на своем пути. В качестве трофеев были захвачены 18 галер и 5 кораблей с 28 большими пушками и 140 маленькими орудиями. Этот успех помогает Изабелле Мантуанской в переговорах в Венеции. Она пытается освободить своего мужа, отдав своего сына Фредерика папе в качестве заложника. Юлий II хочет быть уверен, что маркиз не выступит против него, оказавшись на свободе.
Два породнившихся княжества — Мантуанское и Феррарское — еще никогда не оказывались в ситуации, навязанной железной волей папы Юлия II. Отдавая себе отчет в том, что уничтожение Венеции неблагоприятно скажется на судьбах Италии, понтифик организует Святую Лигу, разрушая, таким образом, все союзы, существовавшие до этого. Теперь его врагом становится уже не Венеция, а Франция, которую нужно выдворить из Италии. Альфонс д’Эсте, отказывающийся предать Людовика XII, лишен звания знаменосца Церкви, которое папа передает его шурину Франциску де Гонзаге! Кроме того, маркиз Мантуанский снова получает должность главного капитана венецианской армии, которую он исполнял во времена битвы при Форново с Карлом VIII.