Быстро ввести самолеты в строй не удалось из-за отсутствия подготовленных пилотов. В июне и июле 1941 года на Яве сформировали две эскадрильи — Afdelingen — в составе V-й авиагруппы — Vliegtuig Groep. Это были 1 VLG-V и 2 VLG-V. Каждая эскадрилья располагала по 12 «Баффало». Командиром 1-й эскадрильи стал капитан К. Терлен, а 2-й эскадрильи — капитан Й.П. ван Гельсдинген. Несколько самолетов этого типа передали в местную летную школу. Остальные истребители оставили в резерве в ожидании новых пилотов.
Обе эскадрильи базировались на аэродроме Семплак на Яве.
Голландское командование лихорадочно перекраивало свои оборонительные планы. Имевшихся в распоряжении войск совершенно не хватало для того, чтобы прикрыть всю территорию колонии площадью в два с половиной миллиона квадратных километров. Некоторые удаленные гарнизоны на Борнео и Сулавеси не имели надежной связи с центром. Было решено прикрыть несколько наиболее угрожаемых направлений, а также обеспечить сопровождение имевшихся бомбардировщиков.
Во второй половине ноября 1941 года неизбежность войны в течение ближайших недель стала очевидной. 1-ю эскадрилью перебросили на Борнео, а летную школу закрыли, сформировав из ее инструкторов и курсантов еще две эскадрильи — 3 VLG-V и 3 VLG-IV. Эти эскадрильи также получили истребители «Баффало».
3 декабря 1941 года из резерва направили на остров Амбон. Командовал этим звеном лейтенант Ф.Э. Брурс из 1 VLG-IV. Уже на следующий день сержант ван Берс погиб в море из-за плохой погоды. На острове сформировали нечто наподобие службы раннего оповещения, но эффективность службы была ниже всякой критики. Вскоре разбился второй «Баффало». Его пилота — лейтенанта Брувера — отправили на Яву.
Когда 8 декабря японцы начали наступление, 9 машин из состава 2 VLG-V перебазировалась в Сингапур. Используя английские запасные части, техники эскадрильи оборудовали самолеты бронестеклами. Эскадрилья участвовала в обороне Сингапура до 18 января 1942 года, когда оставшиеся машины части эвакуировали на Яву. Затем эскадрилью перебросили на Борнео, где она действовала вместе с 1 VLG-V, пытаясь остановить приближавшийся японский флот вторжения.
Тем временем японцы провели серию массированных налетов на голландские базы, готовя почву для предстоящего десанта. На этом этапе войны стратегическая инициатива была полностью на стороне агрессора.
Самолет, представляющий собой гибрид двух или более планеров. Законцовки крыла и руль направления взяты от самолета, целиком окрашенного в светло-серый цвет. Правый элерон позаимствован от самолета с менее выгоревшей окраской. Задняя часть фонаря закрашена, чтобы кабина не перегревалась на солнце.
28 декабря 3-й кокутай нанес второй удар по Таракану. В этот раз голландцы успели поднять истребители в воздух. Против семи А6М2 вылетела 1 VLG-V. В ходе боя голландцы заявили две победы, потеряв три машины. Погибли лейтенант Й.Н. Дрог и фельдфебель Г. Ольсен, а фельдфебель К.А. Вонк выпрыгнул над морем с парашютом. Проведя в воде 12 часов, он все же был спасен местными рыбаками. Четвертый «Баффало» получил повреждения и совершил вынужденную посадку.
15 января 1942 года 18 А6М2 из 3-го кокутая, действуя с новой базы в Мена-до, появились над островом Амбон. Предварительно над островом покружил разведывательный С5М. Целью японцев была база на Амбоне, где базировались австралийские «Гудзоны», угрожавшие японскому десанту на Сулавеси. На их перехват взлетели два «Баффало», остававшиеся в звене лейтенанта Брурса. Сам Брурс был почти тут же сбит и выскочил с парашютом из горящего самолета. Обоженный пилот упал в море, откуда его выловили и отправили в госпиталь. Второй самолет, который пилотировал сержант Бланс, какое-то время продолжал бой. Но затем японцам удалось отстрелить самолету крыло, и Бланс также выпрыгнул с парашютом.
Следующий японский десант высаживался на Борнео. 23 января 1942 года базировавшиеся на аэродроме Самаринда II самолеты участвовали в попытке отразить десант. 2 бомбардировщика «Гленн Мартин 139WH-3» и 20 истребителей «Брюстер 339» из 1 VLG-V и 2 VLG-V, каждый оснащенный двумя 50-кг бомбами под крыльями атаковали в проливе Макассар японский конвой с десантными войсками, шедший на Баликпапан. Удалось добиться восьми попаданий по четырем кораблям, из которых транспорт «Нана-мару» водоизмещением 6764 тонны затонул. Один «Баффало» из 2 VLG-V был сбит, его пилот — фельдфебель Р.А. Роткранс — погиб. Несмотря на эту акцию, японцы следующим утром высадили десант.