В нем говорилось, что парламент сошелся в миролюбивом настроении: «Мы желали только мира, мы думали только о единстве». Его целью было положить конец давно существовавшему среди духовенства разногласию и сохранить единообразие путем отказа от «немногих маловажных обрядов», устранения некоторых церковных злоупотреблений и организации хорошей подготовки для проповедников. В последние годы правления Елизаветы парламент отказался от своего права заниматься этими вопросами; теперь он снова подтвердил его. «Да будет угодно Вашему Величеству принять от ваших общин в парламенте публичный отчет о злоупотреблениях как в церкви, так и в гражданском устройстве и правлении». Притязание на неограниченную власть были встречены словами, служившими как бы предисловием к «Петиции о праве». «Ваше величество были бы плохо осведомлены, — говорилось в послании, — если бы кто-нибудь стал утверждать, что королям Англии принадлежит неограниченная власть изменять религию или без согласия парламента издавать законы касательно духовных и светских дел». Яков I встретил послание с грубым пренебрежением и отсрочил заседание палат. Поддержка короны позволила епископам ответить смелым вызовом на требование пуритан. Закон Елизаветы, утверждавший 39 статей, обязывал духовенство подчиняться только тем из них, которые касались веры и таинств; правила конвокации 1604 года потребовали подписи статей, касавшихся богослужения и обрядов. Новый архиепископ Бэнкрофт присоединил еще требование строгого соблюдения служебника со стороны штатного духовенства. За отказ от соблюдения этих требований следующей весной триста пуританских священников были изгнаны из своих приходов.
За разрывом с пуританами последовал разрыв с католиками. Увеличение их числа вследствие отмены штрафов вызвало общий страх, и парламент восстановил законы против них. Слух об обращении в католичество самого короля так раздражал Якова I, что он стал применять законы с еще большей строгостью, чем прежде. Отчаяние католиков ускорило развитие давно уже задуманного ими заговора. Они не надеялись на помощь извне или на успех открытого восстания внутри страны, и небольшая кучка отчаянных людей во главе с Робертом Кэтсби, участником восстания в Эссексе, решила покончить с королем и парламентом одним ударом. В погребе под зданием парламента были помещены бочонки с порохом, и в ожидании 5 ноября, когда назначено было собрание парламента, планы небольшой кучки превратились в грозный заговор. К участию в нем были допущены более состоятельные католики вроде сэра Эверарда Дигби и Фрэнсиса Трешэма; они-то и предоставили деньги для задуманных заговорщиками широких планов. Во Фландрии было закуплено оружие, заготовлены лошади, а для начала восстания был устроен съезд католических дворян под предлогом охоты. После умерщвления короля предполагалось захватить его детей и начать открытое восстание, при котором можно было рассчитывать на помощь испанцев из Фландрии.
Заговор хранили в величайшей тайне, но в последнюю минуту его выдала фамильная связь Трешэма. В письме к своему родственнику лорду Моунтиглю он посоветовал ему не являться в роковой день; это и другие сведения привели к обнаружению погреба и некоего авантюриста Гая Фокса, которому было поручено стеречь его. Компания охотников в отчаянии рассеялась, заговорщиков преследовали; некоторые из них были перебиты, другие — казнены. Глава иезуитов Англии Гарнет был привлечен к суду и казнен. Он уклонился от всякого участия в заговоре, но был осведомлен о нем другим иезуитом, Гринуэем, и пораженный, по его словам, ужасом, сохранил тайну и предоставил парламент его судьбе.
Избавление от общей опасности сблизило парламент с королем, и когда палаты собрались в 1606 году, общины были согласны дать сумму, достаточную для уплаты долгов, оставленных Елизаветой после войны. Но Яков I был так расточителен, что его расходы в мирное время держались на уровне расходов Елизаветы во время войны; нужда в деньгах и желание избавиться от контроля парламента заставили его искать новые источники дохода. Первым крупным его нововведением было установление таможенных пошлин. Давно было установлено, что корона не имеет права без согласия парламента налагать пошлины, кроме как на шерсть, кожи и олово. Однако в одном или двух случаях были обложены пошлиной ввозные товары при Марии I, Елизавета распространила пошлину на коринку и вино; но эти случаи были слишком мелкими и исключительными, чтобы опровергнуть общее правило. Более опасный пример представляли пошлины, взимавшиеся с отдельных купцов крупными торговыми компаниями, вроде Левантийской или Индейской, в обмен за защиту, какую они оказывали им в дальних морях. Теперь Левантийская компания была распущена, и Яков I присвоил себе взимавшиеся ею пошлины как выморочное имущество.