Эта цитадель имела большую длину ближе к диаметральной плоскости за счет сложной формы траверзов, включавших барбеты. Нижний главный пояс в носовой части поднимался уступом до батарейной палубы для защиты носового торпедного аппарата и в этом районе имел толщину 102 мм, а далее к форштевню опускался еще ниже (толщина 51 мм). Траверзы же только сохранили прежнее название, а фактически они имели сложную форму. Нижний броневой пояс, утоньшившись до 178 мм, заканчивался напротив осей барбетов, и броневая защита шла от него к наружным поверхностям барбетов, сопрягаясь с ними.
Толщина брони траверзов дифференцировалась: от 356 мм в районах барбетов до 305 мм в стыках с поясом (на высоте пояса), утоньшаясь до 152 мм на уровне нижней палубы. Как и на "Фудзи", 64-мм (по другим данным, 76 мм) карапасная броневая палуба шла от траверзов со снижением к оконечностям (утоньшаясь у них до 51 мм), где она опускалась уже значительно ниже ватерлинии. А вот с 64-мм броневой палубой, накрывавшей сверху главный пояс в районе цитадели, произошли серьезные изменения: она перестала быть плоской по всей ширине корпуса и на подходе к бортам получила скосы толщиной 102 мм, которые сопрягались с нижними кромками главного пояса. Кроме этого, по некоторым данным, броневая палуба в районе цитадели дополнительно покрывалась 25,4-мм стальными листами.
В средней части корабля броневая палуба возвышалась над ватерлинией на 0,8 м. Появление скосов у броневой палубы позволило уменьшить толщину главного пояса без снижения защитных свойств, с учетом и более высоких характеристик брони. Теперь с бортов защита стала как бы двухслойной, причем пояс и скосы имели разные углы наклона, поэтому снаряд, пробивший пояс по нормали и потерявший пробивную силу, мог срикошетировать от скоса, а падавший под большим углом должен был срикошетировать сразу от пояса.
Барбеты артиллерии главного калибра тоже радикально изменились. За счет рациональной конструкции подъемников они стали круглыми, диаметром всего 11,3 м, что дало существенную экономию в весе по сравнению с грушевидными на "Фудзи". Толщина их со стороны, обращенной к противнику, была 356 мм, а под защитой траверзов – 203 мм. Защиту орудий главного калибра значительно усилили: в лобовой части башни имели толщину 254, а сверху, с бортов и тыла – 203 мм. Боевая рубка имела толщину брони 356 мм, а запасная кормовая – 76.
Вся средняя артиллерия теперь получила казематы, но уже восьмигранные (с такой же, как на "Фудзи", толщиной брони – 152 мм) из гарвеированной никелевой стали в их трех лобовых частях, обращенных к противнику, и 51мм в остальных, включая крыши. Общий вес брони "Шикишима" составил 4526 т.
Броненосец "Шикишима".
(Наружный вид. 1901 г.)
Артиллерия состояла первоначально из 4 305-мм, 14 152-мм, 20 76-мм (12-фн), 8 47 мм (3-фн), 6 47-мм (2,5-фн) орудий (по другим данным, 4 47-мм) производства завода Армстронга и 8 пулеметов Максима. По своим характеристикам орудия были аналогичны тем, что устанавливались на "Фудзи". 305-мм орудия размещались попарно в двух круглых барбетах (имевших толщину бронирования 356 мм), установленных традиционно в носу и корме с углами обстрела по 270°.
На "Шикишима", первом среди броненосцев японского флота, стало возможно по-настоящему полное круговое (в горизонтальной плоскости) заряжание орудий главного калибра. Два подъёмника обеспечивали подачу снарядов и зарядов снизу из погребов к казенным частям орудий. Одновременно они же выполняли функции отделений, содержащих запасные снаряды. "Шикишима" и три его современника "Хатсусе", "Асахи" и "Микаса" имели тяжёлые установки эльсвикской конструкции.
Хотя подъёмники и механизмы горизонтального наведения были гидравлическими, все же предусмотрели и дублирующие их электрические приводы производства фирмы Армстронга, а также и резервное ручное управление. Скорость заряжания стала выше, чем у "Фудзи", что позволило обеспечить для каждого 305-мм орудия минутную готовность к выстрелу, и боевая скорострельность ожидалась не ниже одного выстрела за две минуты. 152-мм орудия располагались побортно в средней части между барбетами главного калибра в отдельных бронированных казематах. Их максимально разнесли по длине корабля и разместили в уже знакомом шахматном порядке для того, чтобы защитить остальные орудия от повреждений при попадании в один из казематов. С каждого борта находилось по четыре каземата в батарейной и по три – на верхней палубах.