На императорской яхте достаточно места не только для царской семьи, но и для многочисленной придворной знати. На борту находятся также адъютанты, придворные, личная охрана (лейб-гвардия) и слуги. Экипаж судна откомандирован Императорским Российским Военно-Морским флотом.
В распоряжении Алексея, который впервые появляется на «Штандарте» в четырехлетием возрасте, своя собственная свита.
Помимо приемной, рабочего кабинета царя, столовой, бильярдной на верхней палубе и других официальных и личных помещений, плавучий дворец имеет также и небольшую церковь. На яхте нет недостатка в комфорте, но при всей элегантности в ее оснащении отказались от всякой роскоши в пользу функциональности.
В помещениях, занимаемых царской семьей, и в комнатах для гостей, такие же большие окна, как и в салонах. Большую часть столовой занимает стол на тридцать шесть персон, а приемы здесь можно устраивать для 80-ти гостей. Только это помещение и прилегающие к нему салоны своими золочеными лепными украшениями и тяжелыми бархатными шторами (в традициях Романовых пурпурового цвета) напоминают дворцовую обстановку. В остальном преобладает красное дерево. Рабочий кабинет царя выдержан в предпочитаемых им зеленых тонах.
Здесь царит непринужденная атмосфера. Редко можно увидеть царицу такой раскованной и в таком хорошем настроении, как на борту «Штандарта». Александру чаще всего можно встретить на верхней палубе, где она за шитьем или вышиванием беседует с фрейлинами или офицерами. Царевны весело шутят и танцуют с офицерами. Царь каждое утро наведывается на палубу, чтобы проверить навигационные приборы. На яхте уже есть радио — большая редкость в то время. Николай посещает также экипажи кораблей эскорта. Иногда Алексею разрешают сопровождать огца, и тогда он обедает в офицерской кают-компании. Престолонаследник наслаждается тем, что он на борту «Штандарта» бывает вместе со своим отцом больше обычного и тот всегда в хорошем настроении. Иногда по вечерам Николай заходит в комнату Алексея и читает ему книги.
В один из летних дней, когда «Штандарт» плавно скользит по воде, всех пугает внезапный скрип и вслед за ним резкий толчок — яхта наткнулась на риф!
Раздается сигнал тревоги, начинается паника. Первая мысль: «Где Алексей?» Не медля ни секунды, царь быстро обыскивает все помещения. Наконец облегчение: на верхней палубе, в носовой части Деревенько держит наследника на руках. Сразу же после первого шума он принес царевича в это самое безопасное место, опасаясь взрыва парового котла.
Поспешно спускаются спасательные лодки. Не теряя самообладания, царь лично руководит спасательной операцией, успокаивает других и регулярно проверяет осадку, крен судна и поступление воды. Тем временем дети и другие пассажиры покидают борт яхты, и только через некоторое время за ними следует царица; она поспешно собрала иконы и ценности и, завернув их в платок, забрала с собой. Семья сначала переходит на борт маленькой финской яхты, а оттуда — на более крупную «Азию». Алексей не обнаруживает никаких признаков страха — напротив, он просит рассказать о приборах незнакомого судна и задает бесконечное множество вопросов.
В боковой части корпуса «Штандарта» пробоина, но ее временно заделали, и яхту отбуксировали в док. Пока восстанавливаются его мореходные качества, дальнейшая программа визита продолжается на других плавучих средствах.
Авария не имела больших последствий. Как только завершилась спасательная операция, царь отправился на капитанский мостик, чтобы выяснить причину несчастного случая. В момент аварии яхтой управлял финский лоцман, известный «старый морской волк». Ответственность за безопасность с момента вступления царя со своей семьей на борт яхты нес флаг-капитан адмирал Нилов.
Когда царь вошел в его каюту, Нилов стоял, склонившись над картой, — в его правой руке был револьвер. Царь предпринял все усилия, чтобы успокоить адмирала. Разумеется, он допускал, что в силу закона Нилову неизбежно придется держать ответ перед созванным военно-морским судом, но, по всей вероятности, осужден он не будет.
Еще до разговора с адмиралом царь вместе с лоцманом проверил карты и установил, что роковая скала не отмечена ни на одной из них. Когда Николай наконец уходит от Нилова, он прихватывает с собой на всякий случай и револьвер адмирала. Случай этот на долгое время остается известен только им двоим, причем между обоими, несмотря на различия в общественном положении, возникает крепкая дружба. Царь обязывает всех, кто был свидетелем несчастного случая со «Штандартом», хранить строжайшее молчание, несоблюдение которого могло повлечь за собой санкции.