Молодой пилот подавал большие надежды, однако раскрыть свое дарование ему помешала трагическая гибель. В июле 1939 года он вылетел с учебного аэродрома под Борисоглебском на истребителе И-16 для выполнения зачетного задания по технике летного мастерства. Самолет потерпел катастрофу, упал в озеро Большой Ильмень и ушел в ил на несколько метров. Пилот, которому не исполнилось и двадцати пяти лет, погиб. Тело младшего сына Чапаева пришлось вырезать из искореженной кабины автогеном.
Существуют разные версии гибели Аркадия Чапаева. И-16 был, по свидетельствам многих летчиков, очень «строгим» самолетом, не прощавшим ошибок в пилотировании. Чапаев был талантливым летчиком, но привык к более сбалансированному тяжелому бомбардировщику. Исключить просчет в полете нельзя. По другой версии, Чапаев пытался увести неисправный самолет дальше от жилья, чтобы избежать жертв, и не успел выпрыгнуть с парашютом. Наконец, Евгения Чапаева не исключает версии самоубийства, причиной которого стала тяжелая семейная ссора: Аркадий был женат на очень ревнивой и неуравновешенной девушке и накануне вылета в очередной раз поругался с ней.
Дочь Чапаева Клавдия прожила трудную жизнь. После гибели отца она осталась в семье Ивана Чапаева. Как утверждает правнучка героя Евгения, после смерти родителей Чапаева от голода Клавдия оказалась среди беспризорников, жила в трущобах, после очередной облавы ее отправили в детский приют. И только много позже, в 1925 году, ее оттуда забрала мачеха, и то лишь для того, чтобы с ней поехать в Москву к Фурманову для оформления пенсии. Но получить пособие как вдове погибшего героя ей не удалось: брак не был зарегистрирован.
В 17 лет Клавдия уехала в Самару, где вышла замуж, родила сына, поступила в строительный институт. Как утверждают родственники, студентку отправили к наркому пищевой промышленности Анастасу Ивановичу Микояну, чтобы получить разрешение на присвоение учебному заведению его имени.
Поездка в Москву оказалась очень удачной и судьбоносной. Микоян ее принял и в течение четырех часов разговаривал с ней, расспрашивая об отце, о военном времени, о детских воспоминаниях… и перевел Чапаеву с третьего курса Самарского строительного института на первый курс Московского пищевого.
Во время Великой Отечественной войны Клавдия работала в Саратовском обкоме партии, затем — в Бауманском райкоме партии. После войны стала народным заседателем. Выйдя на пенсию, запросила разрешение для работы в архивах.
Клавдии хотелось знать все о своем отце: каким он был на фронте, каким на отдыхе, как складывались его взаимоотношения с руководством и многое другое. Иногда Клавдия Васильевна устраивала настоящий разбор полетов на встречах бывших чапаевцев, уточняя не слишком престижные места службы доживших до послевоенных лет — обоз, трофейная команда, санитарный околодок, артиллерийский склад. По версии Евгении Чапаевой, Клавдия работала в архивах около двадцати лет. «В открытых архивах документы копировала легально. В закрытых… Опись, дело и лист читались нарочито медленно. Затем она выходила в дамскую комнату, доставала спрятанную ручку и на коленках писала то, что запоминала с фотографической точностью. Именно таким образом Клавдия Васильевна собрала много тысяч документов. Теперь этот драгоценный архив хранится в моей семье». Дочь Чапаева ушла из жизни последней из его детей — в 1999 году.
Правда, неясно, о каких закрытых архивах идет речь: документы 25-й дивизии не были секретными и в 1970-е годы. Родство с начдивом позволяло ей смотреть и фонды, которые имели в советские годы ограниченный допуск: армии, фронта и Реввоенсовета. Наконец, Клавдия Чапаева дожила до «лихих 90-х», когда были рассекречены сотни тысяч архивных документов. Неясно и другое: где сенсационные документы из чемодана, которые подтверждают версию о «продаже» героического начдива. В книге «Мой неизвестный Чапаев» убедительных доказательств этого мы не увидели.
Сейчас читателям, интересующимся историей и черпающим информацию из Интернета, приходится сталкиваться с разными, диаметрально противоположными мифами о Чапаеве. В последние годы родственники Чапаева дополняют сформированный в прежние годы образ храброго солдата, решительного военачальника и умелого организатора чертами заботливого семьянина, требовательного, но внимательного и любящего отца, рисуют идеального героя, павшего жертвой интриг и предательства. Историки и публицисты-«антисоветчики», напротив, создают образ жестокого, мстительного и безнравственного красного ландскнехта, изменившего присяге и готового уничтожать людей, их дома и имущество во имя бесчеловечной идеи.