Начало следующего этапа служебной и партийной деятельности М.С. Кедрова совпало с трагическим событием в жизни Коммунистической партии, Советского государства, всех трудящихся — кончиной В.И. Ленина, воплощению идей и указаний которого Михаил Сергеевич посвятил многие годы своего неустанного напряженного труда. Смерть В.И. Ленина потрясла Кедрова. В те дни Михаил Сергеевич писал: «Ленин будет жить — такова воля пролетариата. Он и раненый оставался незримым вождем Красной Армии, который и в донских степях, и в Кавказских горах и в архангельской тундре, и в сибирской тайге, через пески и дебри, через огонь и воду вел красные полки в бой к верной и славной победе. И даже смерть в бессилии отступила перед гением Ильича». М.С. Кедров продолжал дело великого вождя до конца своей жизни, всегда оставался целеустремленным солдатом ленинской гвардии.
В трудных условиях нэпа, когда в решении вопроса: кто кого? — Советское государство должно было противопоставить частному сектору более высокий уровень организации производства и торговли, партия использует М.С. Кедрова, его многосторонние знания, прежде всего высокую правовую квалификацию, а также некоторый опыт организации торговли, приобретенный в дореволюционный период в издательстве «Зерно», для решения коммерческих задач. С конца 1923 года М.С. Кедров — председатель правления организации Снабтранс, занимавшейся улучшением централизованного снабжения железных дорог. В этот же период он включился в решение проблемы государственного регулирования товарооборота, возглавляя по линии ВСНХ организацию Госпосредник, главной задачей которой было расширять позиции государства в промышленности и оптовой торговле, вытеснять из них частного посредника. Кедров состоял также членом торговой комиссии ВСНХ.
Убедившись в рациональности проводимых М.С. Кедровым мероприятий, Ф.Э. Дзержинский поручает ему возглавить оргбюро по созданию первого в советских условиях акционерного общества. В записке Феликса Эдмундовича от 2 марта 1924 года, адресованной заместителю председателя ВСНХ Н.Б. Эйсмонту, по этому поводу было сказано: «Сейчас тов. Кедров работает по моему заданию в торговой области для создания комиссионно-посреднического аппарата… путем объединения Госпосредника с Трансснабом…» Чуть позже в записке Кедрову от 31 марта 1924 года Дзержинский дал ему указание составить циркулярное письмо от имени председателя ВСНХ о проекте организации Акционерного общества по обслуживанию госпромышленности и транспорта (АПТО) и тех задачах, которые ему могут быть поставлены.
В течение двух лет Михаил Сергеевич руководил правлением АПТО. Он прилагал немалые усилия к тому, чтобы эта организация оказывала действенную помощь укреплению государственной промышленности и транспорта. В своей работе он старался опираться на помощь общественности. С этой целью был образован печатный орган АПТО — газета с названием «Кто кого?». Ее первый номер вышел 23 июня 1924 года.
В 1926 году партия направляет М.С. Кедрова, опытного юриста, в Верховный суд СССР помощником прокурора. На этом поприще он основное внимание уделял укреплению социалистической законности в уголовной практике. Работник Верховного суда СССР полковник юстиции в отставке А.Н. Чуватин рассказывал:
«В 1926 году Михаил Сергеевич Кедров был помощником прокурора Верховного суда СССР. Одно время он был секретарем партийной организации Верховного суда СССР.
Это был обаятельный человек. Простой и скромный. Он все время ходил в гимнастерке и в сапогах. Никогда не кичился своими заслугами. При разборе персональных дел в партийной организации никогда не повышал голоса, был всегда ровный, внимательный и отзывчивый».
В 1928 году М.С. Кедрову было поручено возглавить организационный комитет Всемирной спартакиады в Москве, а затем в течение четырех лет он руководил президиумом Красного Спортивного Интернационала. На этом посту проявил себя как талантливый организатор массовой спортивней работы в стране, как убежденный интернационалист в борьбе за единство международного спортивного рабочего движения. И сегодня звучат вполне актуально многие мысли Михаила Сергеевича, высказанные им тогда в статьях и брошюрах о спорте. В частности, в статье, опубликованной в журнале «Теория и практика физической культуры» (№ 6, 1929 г.), Кедров писал, определяя задачи и роль физической культуры; «Основа её, как известно, заключается в физическом оздоровлении трудящихся масс, в оздоровлении их быта, в укреплении их классового сознания, солидарности, в выработке определенных качеств, необходимых для строительства социализма, для обороны пролетарского государства…».
Опытный партийный работник, владеющий несколькими иностранными языками, М.С. Кедров привлекался в эти годы и к работе в Исполкоме Коминтерна.
Около пяти лет, начиная с 1932 года, М.С. Кедров работал в Госплане РСФСР. Он был членом президиума Госплана, возглавлял в нем сектор обороны, а затем отдел науки и техники.
С 1936 года Михаил Сергеевич, всю жизнь хранивший преданность медицине, начинает работу в Научно-исследовательском институте нейрохирургии Наркомздрава СССР. Под руководством известного ученого Н.Н. Бурденко он занимался вопросами борьбы со злокачественными опухолями, в частности решением проблемы ранней диагностики раковых заболеваний.
Независимо от занятости по службе коммунист-ленинец М.С. Кедров постоянно выполнял различные поручения партийных организаций, вел большую агитационно-пропагандистскую работу, сотрудничал в партийных изданиях. Им написан ряд трудов по истории революционного движения в России, иностранной военной интервенции и гражданской войны.
Немало сил Михаил Сергеевич отдавал публицистике, отражая в ней роль В.И. Ленина в истории российского революционного движения и Коммунистической партии, в организации первого в мире пролетарского государства, его укреплении, защите, создании Красной Армии. Из-под пера Кедрова вышли такие положительно воспринятые в партии брошюры, как «Из красной тетради об Ильиче», «Повсюду Ильич», «Вождь Красной Армии»,
Жизненный путь Кедрова оборвался трагически. Он был арестован по ложному обвинению 16 апреля 1939 года, а осенью 1941 года по указанию Берия расстрелян.
Труден, полон предельного напряжения, но и почетен был революционный путь М.С. Кедрова. Как солдат партии он без колебаний, с энтузиазмом принимался за каждое поручение Коммунистической партии.
Важнейшее из выполненных М.С. Кедровым заданий Центрального Комитета партии — его плодотворная деятельность на посту начальника Особого отдела ВЧК. Опираясь на богатый опыт партийной и военной работы как в подполье, так и после победы Великого Октября Кедров сумел в сложной военно-политической обстановке идя непроторенным путем и преодолевая противоречивые мнения военных авторитетов, выбрать и предложить Ф.Э. Дзержинскому, коллегии ВЧК единственно правильное решение в организации военной контрразведки Красной Армии. Немногим более полугода возглавлял он советскую военную контрразведку, но за это короткое время она превратилась в четко функционирующий боевой орган пролетарского государства. В успешном выполнении задач ограждения Красной Армии и Флота от происков контрреволюции и иностранных шпионов в годы гражданской войны, которое обеспечили особые отделы, есть несомненная заслуга их первого руководителя.
За мужество и отвагу, за огромную плодотворную государственную и общественную деятельность Михаил Сергеевич Кедров в год 10-летия Великой Октябрьской социалистической революции был награжден орденом Красного Знамени. Еще раньше за активную борьбу с контрреволюцией он был удостоен знака «Почетный чекист», удостоверение к которому подписал лично Ф.Э. Дзержинский. Михаил Сергеевич был великим тружеником, надежным и несгибаемым борцом за прогресс и подлинную социалистическую справедливость. В наши дни память М.С. Кедрова увековечена в названии его именем улиц в районах новостроек Москвы, Ленинграда, Архангельска, Вологды и некоторых других городов.