Рука об руку с частями Красной Армии героически сражались с басмачами славные чекисты-пограничники, пресекавшие попытки ухода за кордон разгромленных шаек и отражавшие вылазки на нашу территорию ранее бежавших за границу остатков басмаческих банд. Особенно отличалась в боях с басмачами 37-я пограничная бригада под командованием Василия Степановича Сахно.
В конце декабря 1921 года банда басмачей в количестве 750 человек внезапно напала и захватила имевший стратегическое значение г. Ширабад. Нужно было в кратчайшие сроки выбить басмачей из города и уничтожить банду. Такую задачу командование поставило перед 37-й бригадой.
Для выполнения поставленной задачи пришлось сформировать отряд из вспомогательных подразделений, так как основные силы бригады в этот период вели упорные бои с другими бандами. Взяв на себя лично руководство этим отрядом, командир бригады тщательно разработал план разгрома банды. В бою за город Ширабад пограничники наголову разгромили басмачей.
37-я пограничная бригада под командованием В. С. Сахно в последующих боях с бандами басмачей нанесла им ряд поражений, захватив только пленными около двух тысяч бандитов.
За умелое руководство бригадой, личное мужество и отвагу Коллегия ОГПУ наградила командира бригады В. С. Сахно именным маузером с надписью «За успешную борьбу с басмачеством в Средней Азии».
23 декабря 1923 года 200 басмачей, перейдя государственную границу, напали на кишлак Бага-Чакал, разграбили его и угнали с собой часть жителей. Получив сообщение об этом, командир подразделения Климов, имея в своем распоряжении всего 15 конных пограничников, организовал преследование банды и, настигнув ее, повел свое подразделение в атаку. Бой был упорным и тяжелым. Каждый пограничник вел бой больше, чем с десятью басмачами, но никто из пограничников не дрогнул. В самый критический момент боя рядовой Донских с ручным пулеметом бросился в контратаку, расстреливая басмачей в упор. Этот героический поступок воина-чекиста решил исход сражения: растерявшиеся басмачи в замешательстве бежали, оставив на месте боя несколько десятков убитых и раненых.
Маленький отряд пограничников в этой неравной схватке вышел победителем. Воины-чекисты освободили всех людей, захваченных басмачами.
За умелое руководство боем и личную храбрость Советское правительство наградило командира эскадрона Климова орденом Красного Знамени, а пограничники Кравченко, Донских, Черевенко, Кравцов и другие за проявленное в бою мужество и героизм приказом ОГПУ были награждены именными серебряными часами.
Велика роль органов государственной безопасности в ликвидации басмачества. Раскрывая замыслы и планы басмаческих курбашей, чекисты оказывали большую помощь партийно-советским органам в разработке мер по искоренению басмачества, а также содействовали командованию Красной Армии в успешном осуществлении операций против шаек. Обезвреживая басмаческую агентуру, закрывая каналы снабжения банд оружием, боеприпасами и военным снаряжением и, наконец, участвуя непосредственно в боевых операциях, сотрудники и войска органов государственной безопасности были верными исполнителями воли Коммунистической партии и трудящихся в ликвидации басмачества.
По докладу В. И. Ленина IX Всероссийский съезд Советов 28 декабря 1921 года принял резолюцию, в которой, отметив героическую работу органов ВЧК, постановил: «...Ныне укрепление Советской власти вовне и внутри позволяет сузить круг деятельности Всероссийской Чрезвычайной Комиссии и ее органов, возложив борьбу с нарушением законов советских республик на судебные органы. Исходя из этого, Съезд Советов поручает Президиуму Всероссийского Центрального Исполнительного Комитета в кратчайший срок пересмотреть положение о Всероссийской Чрезвычайной Комиссии и ее органах в направлении их реорганизации, сужения их компетенции и усиления начал революционной законности».
Во исполнение постановления IX съезда Советов РСФСР, Президиум ВЦИК 6 февраля 1922 года издал декрет об упразднении ВЧК и ее местных органов. Подавление открытых контрреволюционных выступлений, в том числе бандитизма, принятие мер борьбы со шпионажем, охрана границ РСФСР, борьба с контрабандой, а также выполнение специальных поручений Советского правительства по охране революционного порядка — все это было возложено на Народный комиссариат внутренних дел. Для осуществления этих новых для НКВД функций при нем образовывалось Государственное Политическое Управление (ГПУ) под руководством наркома внутренних дел, а на местах при ЦИК автономных республик и губисполкомах — политические отделы.