Решающим условием успешной деятельности органов государственной безопасности являлось руководство ими Коммунистической партией. Партийные организации повседневно контролировали работу чекистских органов и оказывали им необходимую помощь. Еще в феврале 1919 года в «Обращении ЦК РКП(б) ко всем коммунистам — работникам Чрезвычайных комиссий» Центральный Комитет партии особо отмечал, что «ЧК созданы, существуют и работают лишь как прямые органы партии, по ее директивам и под ее контролем».
Первый руководитель советских органов государственной безопасности, выдающийся революционер, ближайший соратник В. И. Ленина — Ф. Э. Дзержинский неоднократно подчеркивал, что основным принципом деятельности этих органов является принцип партийности и непосредственное руководство ими со стороны ЦК Коммунистической партии. «ЧК должна быть органом Центрального Комитета, иначе она вредна, тогда она выродится в охранку или в орган контрреволюции», — постоянно говорил Ф. Э. Дзержинский.
В. И. Ленин не допускал малейшего уклонения органов государственной безопасности от контроля со стороны партии и правительства. В. И. Ленин решительно пресекал любые, даже самые незначительные, попытки отдельных работников ВЧК, пытавшихся поставить себя вне контроля партии, мотивируя это необходимостью обеспечения условий для успешного расследования дела.
В начале декабря 1918 года для рассмотрения вопросов, связанных с деятельностью ВЧК, была создана специальная комиссия Совета Рабоче-Крестьянской Обороны под председательством В. И. Ленина. Внесенные В. И. Лениным на рассмотрение комиссии предложения являют собой еще один пример неустанной заботы вождя пролетарской революции об усилении партийного контроля за деятельностью органов государственной безопасности.
На всех этапах развития Советского государства Коммунистическая партия принимала необходимые меры по установлению правильных взаимоотношений и тесного взаимодействия органов государственной безопасности с партийными, советскими и общественными организациями, что имело исключительно важное значение для предохранения чекистских органов от замкнутости, профессиональной кастовости, оторванности от широких масс трудящихся.
Строительство и вся текущая деятельность органов государственной безопасности Узбекистана протекала под непосредственным руководством и контролем со стороны партийных органов. Еще летом 1919 года декретом ТуркЦИКа, с целью надзора за законностью и «революционной целесообразностью» действий органов ЧК Туркестана, а также контроля над повседневной деятельностью как членов, так и сотрудников Чрезвычайной Комиссии была учреждена контрольно-ревизионная коллегия. В состав коллегии входили два представителя от Крайкома Коммунистической партии Туркестана и один представитель от ТуркЦИКа. Указанные коллегии создавались как при ТуркЧК, так и при областных ЧК. Те или иные неправильные действия органов ЧК опротестовывались этими коллегиями в президиум областной или республиканской Чрезвычайной комиссии. Решения последней могли быть опротестованы центральной коллегией в ТуркЦИК. Подача протеста влекла за собой приостановление исполнения опротестованного постановления ЧК.
В целях укрепления организационных связей Чрезвычайных Комиссий с партийно-советскими органами Туркбюро ЦК РКП(б) и Исполбюро ЦК Компартии Туркестана, заслушав 26 ноября 1920 года доклад председателя ТуркЧК Домбровского, постановили:
«1. Признать необходимой самую тесную связь органов ЧК с органами советскими и партийными.
2. Предложить ЦК КПТ ввести председателей Облчека в члены обкомов и установить в дальнейшем, как правило, что председатель Облчека по должности входит в Обком».
На следующий день после принятия этого решения Полномочное представительство ВЧК на территории Туркестана обратилось со специальным циркулярным письмом ко всем работникам Чрезвычайных Комиссий.
В письме подчеркивалось, что органы ЧК «не должны отрываться от масс и партийных организаций», ибо «Комитеты Коммунистической партии на местах есть высший орган пролетарской диктатуры и штаб революционного фронта».
Органы государственной безопасности Туркестана, ведя напряженную борьбу с внутренней и внешней контрреволюцией, во всей своей деятельности руководствовались указаниями и волей Коммунистической партии, твердо и неуклонно проводили ее политику, и это явилось залогом успеха их работы.
Чекисты Туркестана были в первых рядах защитников свободы и независимости рабоче-крестьянского государства от посягательств интервентов и их агентуры. Они внесли достойный вклад в дело борьбы с контрреволюционным басмачеством.