В 1847 году Якоб Коллечка, профессор судебно-медицинской экспертизы, которым Земмельвейс очень восхищался, умер от пореза скальпелем, полученного во время вскрытия трупа. Когда было проведено вскрытие Коллечки, у него обнаружилось много патологических признаков, которые очень напоминали родовую лихорадку. Земмельвейс предположил, что какое-то вещество, выделяемое трупами, вызывает лихорадку во время родов. По предположению Земмельвейса, причина того, что женщины чаще заболевали лихорадкой во время родов в отделении, где работают студенты-медики, заключалась в том, что студенты-медики передавали болезнь от трупов беременным женщинам (стажеры-акушеры не участвовали во вскрытии трупов). Исходя из этой теории, Земмельвейс ввел практику мытья рук студентов-медиков хлорированной известью (гипохлоритом кальция) между вскрытием трупа и родами. После этого уровень смертности от лихорадки снизился на 90 % в отделении, в котором обучаются студенты-медики, и опустился до того же уровня, что и в отделении, где работают акушерки. В следующем году Земмельвейс ввел промывание инструментов, контактировавших с пациентами, и в этой австрийской больнице практически исчезла родовая лихорадка. Позже, когда студенты Земмельвейса распространили эту методику в других больницах, уровень смертности там упал примерно так же. По любым стандартам это было значительным достижением, которое не только спасло огромное количество жизней и предотвратило множество страданий, но и дало науке фундаментальное представление о причинах родовой лихорадки — по крайней мере, должно было. Хотя Нобелевская премия еще не была учреждена, можно предположить, что доктор Игнац Земмельвейс получит большое признание за свои достижения; однако, к сожалению, этого не произошло.
Медицинский истеблишмент категорически отверг выводы Земмельвейса. В этом отказе сошлось несколько причин, и ради справедливости следует признать, что Земмельвейс публиковал свои выводы крайне бессистемно. Он писал письма другим врачам, а его ученики публиковали отчеты, но сам он не публиковал никаких научных отчетов до 1858 года, а свою основную работу написал только в 1861 году. Тем не менее почти все его умозаключения были отвергнуты по ряду причин.
Во-первых, интерпретация Земмельвейса противоречила почти всем догмам, касающимся болезней, утверждавшим, что болезнь вызывается дисбалансом жидкостей человеческого тела и передается по воздуху с испарениями. Болезнь каждого человека была индивидуальной в зависимости от дисбаланса в организме. Было очень трудно, скорее даже невозможно вписать открытия Земмельвейса в эту догму. Поразительно, но главное возражение против его выводов заключалось в том, что поскольку у него не было теории, объясняющей механизм, посредством которого может передаваться болезнь от трупов, как можно считать правильными его наблюдения? Важно помнить, что теория микробов — идея о том, что болезнь обусловлена микроскопическими бактериями и вирусами — в то время не существовала. Как мог трупный материал передавать болезнь, если в исходном материале отсутствует сущность, способная вызвать болезнь? Это еще один пример того, как классическое и неправильно понятое применение «научного метода» не соответствует тому, что на самом деле делает наука. Наблюдение не является идеальным арбитром для наших утверждений о знании, так как наблюдение может быть ошибочным — значит, нужно оспаривать наблюдение. Гипотетико-дедуктивную согласованность можно восстановить, модифицируя теории или игнорируя данные. И то, и другое случается на каждом шагу. Также можно предположить, что в отказе признать выводы Земмельвейса присутствовал эмоциональный компонент, поскольку врачи не стремились признать, что их руки были грязными, что им нужно мыться чаще и что они убивали тысячи пациентов каждый год из-за собственного невежества и отсутствия гигиены.