Четыре канонерские лодки ГВИУ № 1, 2, 5 и 9 в мае были приняты из Военного ведомства и отправлены по железной дороге в Череповец. Там эти канлодки были включены в состав Череповецкого отряда Селигерской флотилии. Оттуда их предполагалось перебросить на Селигер. Все 4 канонерки имели по две 3-дюймовые горные пушки обр. 1909 г. и по два пулемета в башнях.
До ледостава 1918 г. эти канонерки находились без дела в Череповце. Возможно, их даже не спускали на воду. Во всяком случае, они зимовали на берегу, установленные на деревянных клетках.
13 августа 1918 г. четыре канлодки были перечислены из состава Селигерской флотилии в Волхово-Ильменскую флотилию. 10 февраля 1919 г. Волхово-Ильменская флотилия была расформирована. 2 апреля 1919 г. четыре канлодки были переданы в Онежскую флотилию. Разумеется, все эти «передвижения» происходили только на бумаге, а канонерки мирно стояли на клетках.
К июню 1919 г. канонерки ГВИУ оказались на Ладожском озере. С 4 апреля 1919 г. их переклассифицировали в сторожевые суда и присвоили номера: № 1 (бывшая № 1), № 2 (бывшая № 2), № 3 (бывшая № 5) и № 4 (бывшая № 9).
Сторожевые суда № 1, 2 и 4 принимали участие в высадке красного десанта на берегу Ладоги в районе Видлицы 27 июня 1919 г. Они поддерживали десант своим артиллерийским и Пулеметным огнем. Причем сторожевое судно № 2 вошло в реку Видлица и поднялось вверх по течению на одну милю, несмотря на интенсивный пулеметный огонь с берега. Вслед за сторожевым судном № 2 в реку вошли десантные суда.
Сторожевые суда № 1 и М 4 вместе с другими кораблями вели обстрел устья реки Тулоксы, причем суда № 1 и № 4 вели огонь с 12 кабельтов (2,2 км), а другие суда — с 25 кабельтов (4,6 км). Сторожевым судам удалось подавить батарею. финнов. А затем сторожевые суда № 1 и № 4 подошли к берегу на 2 кабельтова и шрапнельным и пулеметным огнем поддерживали высадку десанта.
В конце июля 1919 г. из Лодейного поля в Петрозаводск перешел дивизион сторожевых судов, в составе которых были суда № 1, 2, 3 и 4.
1 июня 1919 г. из Архангельска в Медвежью Гору, самый северный пункт Онежского озера, было отправлено 7 моторных катеров — истребителей, каждый из которых был вооружен одним 47-мм или 57-мм орудием.
29 июня белые катера впервые вышли в Повенецкий залив Онежского озера,
С 1 августа корабли красной Онежской флотилии блокировали Повенецкий залив у острова Сал. 3 августа красные канонерки № 2 (бывший буксир «Сильный»; два 75/50-мм орудия, один 37-мм пулемет «Максим») и № 6 (бывший буксир «Восток»; одно 75/50-мм, одно 47-мм орудие, одна 76-мм зенитная пушка Лендера), а также сторожевое судно № 3 (бывшая канонерка № 5 «Пролетарий») и сторожевой катер № 6 (одна 47-мм пушка) в 7 час 05 мин были атакованы тремя катерами-истребителями белых. Артиллерия красных была почти на порядок сильнее трех мелкокалиберных пушек белых. Тем не менее белые подошли на 20 кабельтов (3660 м) и открыли огонь.
К 8 час 15 мин канонерка № 2 («Сильный») выбросилась на берег, команда разбежалась, через 5 минут сторожевое судно № 3 («Пролетарий») также выбросилось на берег, команда тоже спустилась на берег. Канонерка № 6 и сторожевой катер № 6 сумели уйти на юг.
Оба выбросившихся корабля были захвачены белыми, сняты с мели и введены в состав белой флотилии. Так закончилось самое крупное сражение на Онежском озере.
25 сентября 1919 г. сторожевые суда № 2 и № 4 вместе с другими кораблями флотилии вышли из Петрозаводска и участвовали в обстреле деревни Лижма.
В октябре 1919 г. сторожевые суда № 2 и № 4 обстреливали остров Меч. 17 октября в ходе боевых действий в Повенецком заливе на сторожевое судно № 4 был установлен катерный трал, но траление не удалось из-за свежей погоды.
22 и 23 октября сторожевое судно № 4 дважды обстреливало пристань у города Повенец.
6 ноября красная флотилия попыталась высадить десант в Медвежьей Горе. В этой операции участвовали и сторожевые суда. Корабли флотилии у Сухого Наволока были обстреляны белой полевой артиллерией. Канонерка № 7 была потоплена, канонерка № 3 повреждена, десант был возвращен в Петрозаводск.
На этом боевые действия красной Онежской флотилии закончились, озеро вскоре покрылось льдом. А в феврале 1920 г. сам по себе развалился фронт белых: англичане удрали, офицеры частично удрали, частично были перебиты, солдаты разбежались или перешли к красным.
За кампанию 1919 г. на Онеге сторожевые суда (бывшие канонерки ГВИУ) в среднем имели ходовых часов 300 и прошли в среднем по 1500 миль.