Еще одной важной подсистемой организмов II-го поколения стала подсистема генозаписи, которая помимо кодирования структурного развертывания всей системы организма, а также состава всех его фщ. единиц стала генетически записывать еще и рефлекторные связи дуг, и соотвествующие аналитические фн. центры сигнальной подсистемы ЦНП. Именно таким путем начал складываться генотип организмов. Вновь образовывавшиеся впоследствии рефлекторные дуги и аналитические фн. центры при закреплении их в качестве условных рефлексов составляли фенотип организма, после чего генетически записывались и передавались по наследству, входя уже наряду с ранее записанными рефлексами в генотип последующих поколений, соответственно пополняя его и все более развивая его духовность .
Последней важной подсистемой организмов II-го поколения следует считать подсистему воспроизведения потомства, основанную на функциональном разделении всех организмов на два пола: мужские и женские особи. Каждый пол со временем приобретал все большую фн. специализацию, однако наибольшего отличия достигли органы подсистем, принимающие непосредственное участие в производстве потомства. Зарождение каждого организма начинается с момента соединения двух специализированных клеток - гамет, отдельно заимствованных от особей обоих полов. В каждой гамете имеется своя генетическая запись, заключенная в гаплоидном наборе нескольких десятков хромосом, при этом любое внутрихромосомное отклонение генома определенным образом отражается на формирующемся генофонде потомства. Развитие зародышей организмов млекопитающих первое время протекает в специальной подсистеме материнского организма под контролем его ЦНП, регулирующей прежде всего подвод соответствующих питательных элементов для заполнения фн. ячеек развертываемой структуры нового организма. После рождения детеныша и отделения его от материнской системы, снабжение нового организма питательными элементами материнским организмом осуществляется еще продолжительное время и они поступают в него в виде специального раствора (молока), вырабатываемого соответствующей фн. подсистемой организма женской особи. У организмов II-го поколения существуют также подсистемы воспроизведения потомства посредством выкладки яиц, представляющих собой зародыш в строго дозированной среде тщательно отобранных питательных элементов, которые он полностью использует в качестве фщ. единиц для фн. ячеек развертываемой структуры до определенного момента своего развития.
Таким образом, морфологическая и физиологическая дифференциация подсистем организмов II-го поколения, протекавшая многие миллионы лет, отвечала потребностям движения Материи по ординате качества-времени (), являясь в то же время прямым следствием этого движения. Следует отметить, что в Развитии Материи данный вид движения к этому моменту стал окончательно доминирующим для рассматриваемой области Вселенной, в то время как движение в пространстве-времени все больше стало играть второстепенную вспомогательную роль.
В процессе эволюции новые, высшие по своей организации группы организмов возникали путем ароморфозов, идиоадаптаций и дегенераций. На одном из этапов указанного процесса развития системной организации Материи появились представители организмов третьего поколения. К ним относятся организмы, использующие в качестве строительных полуфабрикатов при синтезировании своих фщ. единиц не неорганические вещества гумусового слоя и не органические соединения размельченных тканей отдельных органов растений, а значительно более сложные органические вещества тканей организмов II-го поколения. В результате этого, у плотоядных животных, как они впоследствии стали называться, отпала необходимость постоянно и в больших количествах потреблять отдельные органы разнообразных растений для того, чтобы заполнить фн. ячейки своих подсистем соответствующими фщ. единицами. Им стало достаточно овладеть одним из организмов II-го поколения, чтобы получить сразу в большом количестве разнообразие многих необходимых элементов, находящихся в фн. ячейках организма растительноядного животного и из которых они могли синтезировать фщ. единицы для подсистем своего организма. Начиная с этого времени необходимые элементы организм стал получать готовыми блоками (блок-питание), что вполне отвечало принципам построения материальных систем, предопределяющим использование в качестве фщ. единиц в структурах всех последующих ступеней организации устойчивых комплексов единиц предыдущих уровней.
В системной организации организмов III-го поколения произошло меньше изменений по отношению к организмам II-го поколения, чем это было между поколениями II-м и I-м. Прежде всего значительно изменилась подсистема пищеварения, приспосабливаясь под новый вид питания, а также еще большую фн. значимость получила нервная подсистема. Среди организмов III-го поколения по уровню своего развития все больше стали выделяться наземные животные. В конечном итоге, все дальнейшее развитие животного мира стало сводиться, в основном, именно к последовательному усложнению у наземных организмов III-го поколения ЦНП, повышению интенсивности и эффективности ее использования, увеличению разнообразия спектра ее функций. Главным образом, это сказалось на системной организации головного мозга, который все больше становился специализированной подсистемой умножающихся аналитических фн. центров, объединяющих анализаторы и инициаторы большинства процессов, протекавших внутри организма, и некоторых - вне его.
Несмотря на большое количество видов организмов всех трех поколений (а их только в настоящее время насчитывается на Земле около 0,5 млн. видов растений и 1,5 млн. - животных) и их фн. разнородность, на ординате качества-времени тем не менее все равно наступил момент, когда всего этого разнообразия стало недостаточно для обеспечения дальнейшего Развития Материи. Выход из этого мог быть, как и прежде, найден лишь в еще более сложной системной организации Материи путем создания очередного нового организационного уровня. Первые предпосылки перехода к нему начали возникать еще около 30 млн. лет назад, когда в лесах палеогена и неогена появились парапитеки - животные величиной с кошку, которые жили на деревьях и питались растениями и насекомыми. От парапитека произошли современные гиббоны и орангутаны и еще одна ветвь - вымершие древние обезьяны дриопитеки, которые дали три ветви, приведшие к шимпанзе, горилле и человеку. Чарльз Дарвин убедительно доказал, что человек представляет собой последнее, высокоорганизованное звено в цепи развития живых существ четырех поколений и имеет общих далеких предков с человекообразными обезьянами.
Итак, результатом движения Материи по организационному уровню И следует считать создание наиболее развитых организмов - организмов IV-го поколения, к коим мы причисляем только человека, система организма которого в целом к тому времени достигла стабильного совершенства. Будучи производной системой, вобравшей в себя все лучшее от организмов II-го и III-го поколений, человек получил в качестве генетического наследства набор всех тех подсистем, которые обеспечивали его существование и надежное функционирование в широком диапазоне окружающей среды. В качестве питания для заполнения фн. ячеек своих подсистем его организм все более приспосабливался к потреблению высокопитательных частей организмов I-го и II-го поколений. Так, в его рационе все большую долю стали занимать элементонасыщенные аккумулятивные подсистемы, формируемые вокруг семян у организмов I-го поколения (плоды, ягоды, фрукты) и различные части организмов II-го поколения. Части организмов III-го поколения, то есть плотоядных животных, человек в пищу практически не потреблял и не употребляет, как этого не делают и сами плотоядные животные, ввиду невозможности их использования для заполнения фн. ячеек подсистем его организма. Однако, опережающее развитие и специализацию в дальнейшем вплоть до наших дней в организме человека все более стала получать подсистема, регулирующая его высшую нервную деятельность, и в первую очередь, структура его головного мозга.