В общих чертах внутренняя логика исследования Маркса, логическая структура «Экономическо-философских рукописей» может быть представлена теперь следующим образом. Все изложение развертывается в виде своеобразной триады. Маркс начинает с анализа экономических проблем, затем углубляется в философскую проблематику, а в конце снова возвращается к экономическим проблемам. Результат предшествующей работы Маркса, критики гегелевской философии права (определяющая роль гражданского общества), становится исходным пунктом его нового исследования. Маркс начинает «Экономическо-философские рукописи» с триединого анализа положения трех основных классов гражданского общества, выделенных Смитом и Рикардо, с параллельного анализа трех источников дохода этих классов: заработная плата, прибыль на капитал, земельная рента. Первая фаза исследования: сущность и чем определяется величина каждого. Результат: констатация борьбы между классами. Это анализ соотношения классов гражданского общества в статике. Вторая фаза исследования: в каком направлении развивается эта борьба классов, куда она ведет. Результат: все большее обнищание рабочего класса; крупные капиталисты и землевладельцы побивают мелких, концентрация собственности, оба класса постепенно сливаются в единый класс капиталистов; общество все больше поляризуется, раскалывается на два основных класса – пролетариев и капиталистов; отношение труда и капитала – это отношение частной собственности; развитие классовой борьбы ведет к революции. Это анализ соотношения, борьбы классов гражданского общества в динамике. Третья фаза исследования: частная собственность – основа буржуазного общества, но что стоит за частной собственностью, какова ее более глубокая основа? Результат: основа частной собственности – отчуждение труда, между ними – отношение взаимодействия, они – основа всех экономических категорий буржуазного общества. Это анализ экономической основы общества в статике. Четвертая фаза исследования: анализ отчуждения труда и частной собственности как исторических явлений, их историческое происхождение и «снятие» в предстоящем процессе коммунистического преобразования общества. Результат: доказательство исторической необходимости частной собственности и необходимости коммунистической революции, уничтожающей частную собственность и все виды отчуждения. Это анализ экономической основы общества в динамике. Пятая фаза исследования: начало систематического анализа основных экономических категорий буржуазного общества (разделение труда, деньги и т.д.). Маркс обращает здесь особое внимание на разделение труда. На следующем этапе становления его теории, в «Немецкой идеологии» эта категория будет играть особо важную роль, через анализ ее будет происходить переход к открытию диалектики производительных сил и производственных отношений. Таким образом, в полном соответствии с фундаментальными законами диалектического познания, в процессе исследования Маркса ясно наблюдаются чередования: внешнее – внутреннее, статика – динамика, исходный пункт – результат и т.д.
Результаты, достигнутые в работе над «Экономическо-философскими рукописями», нашли определенное отражение и некоторое дальнейшее развитие в Марксовой части первого совместного произведения основоположников марксизма «Святое семейство» (осень 1844 г.). Развивая мысль об определяющей роли производства, Маркс формулирует обобщающее положение о материальном производстве как материнском лоне истории. Рассматривая «предмет» как «общественное отношение человека к человеку», Маркс приближается к понятию производственных отношений. В это же время Энгельс в книге «Положение рабочего класса в Англии» (осень 1844 – весна 1845), анализируя связь между промышленной революцией и революцией в гражданском обществе, приближается к пониманию связи между производительными силами и производственными отношениями.