1. Виссарион Сартов (род. 1828 г.) — чтец, 1863–74 гг. (скончался в Японии в 1874 г.); служил в Хакодате в консульской церкви, впоследствии в приходе о. Анатолия Тихая.
2. Григорий Воронцев (род. 1838 г.) — священник; служил в Хакодате в течение 3 месяцев в 1871 г.
3. Анатолий Тихай (род. 1838 г.) — иеромонах, 1871–90 гг.; сначала служил настоятелем прихода в Хакодате, затем в 1879 г. назначен настоятелем посольской церкви в Токио.
4. Яков Тихай — регент, 1874–86 гг. (младший брат иеромонаха Анатолия).
5. Моисей Костылев (род. 1848 г.) — иеромонах, 1874–75 гг.
6. Евфимий Четыркин (род. 1846 г.) — иеромонах, 1874–78 гг.
7. Гавриил Чаев — священник, 1878–82 гг.; вернулся в Россию вместе с японским семинаристом Александром Мацуи, позднее скончавшимся в Санкт–Петербурге.
8. Владимир Соколовский — иеромонах, 1879–86 гг.; позднее стал епископом Острогожским и инспектором Холмской семинарии, затем архиепископом Сан–Францискским (1888–91 гг.).
9. Мария Черкасова — диаконисса, 1879–82 гг.; позднее трудилась в Православной Миссии в Палестине, написала воспоминания о своем пребывании в Японии.
10. Дмитрий Смирнов — иеромонах, 1880–82 гг.; временно служил в качестве приходского священника в Хакодате.
11. Дмитрий Львовский — диакон и регент, 1880–1921 гг. (приехал в Японию с епископом Николаем, скончался в Японии в 1921 г.).
12. Дмитрий Крыжановский — диакон, 1880–82 гг.
13. Георгий Чудновский — иеромонах, 1884–86 гг.; приехал с горы Афон и вернулся туда же.
14. Ольга Путятина — диаконисса, 1884–87 гг. (дочь графа Е. В. Путятина).
15. Митрофан — диакон, 1885 г.
16. Арсений — диакон, 1885 г.
17. Гедеон Покровский — иеромонах; служил в Токио в течение 8 месяцев в 1885 г.
18. Сергий Глебов (род. 1862 г.) — священник, 1888–1904 гг. Назначен настоятелем посольской церкви в 1890 г.
19. Сергий Страгородский — иеромонах, 1890–93 гг., 1897–98 гг.; сопровождал епископа Николая в объезде приходов на Хоккайдо в 1898 г. и выпустил две книги о своем пребывании в Японии (собрание писем «На Дальнем Востоке» и миссионерские путевые заметки «По Японии»), впоследствии архиепископ Финляндский, затем Патриарх (1943–44 гг.).
20. Арсений Тимофеев — иеромонах, 1890–93 (приехал в Японию с Сергием Страгородским).
21. Андроник Никольский — архимандрит, впоследствии епископ, 189798 гг., 1907 г.; наречен епископом Киотосским в 1906 г., однако прослужил лишь 3 месяца по прибытии в Японию (позднее стал епископом Пермским и скончался мученической смертью в 1918 г.), также написал несколько статей о Японии.
22. Вениамин Галузеев — иеромонах, 1901–1903; позже написал книгу о Японии.
23. Евгений — иеромонах, начало 1900–х гг.
24. Сергий Тихомиров — епископ, 1908–40 гг.; служил в качестве епископа Киотосского (1908–12 гг.), затем стал преемником св. Николая (1912–40 гг.) (смещен с должности в 1940 г., скончался в Японии в 1945 г.).
25. Петр Булгаков — священник, 1906–24 гг.; сначала служил настоятелем посольской церкви в Токио, затем библиотекарем в Миссии (также писал статьи о Японии).
Вышеприведенный список был первоначально составлен профессором Кэнноскэ Накамурой (Университет Оцума) и пересмотрен и дополнен профессором Евгением Штейнером (Нью–Йоркский Университет).
Донесение епископа Киотосского Сергия (Тихомирова) Святейшему Синоду о дневниках св. Николая, архиепископа Японского
В 1979 году нами было установлено, что дневники св. Николая, архиепископа Японского (1836–1912), находятся на хранении в ленинградском Центральном государственном историческом архиве (ЦГИА СССР), нынешнем Российском государственном историческом архиве (РГИА). С этого времени началась работа над расшифровкой и опубликованием дневников. В 1994 году издательством Университета Хоккайдо была издана часть дневников, охватывавшая в основном период с 1903 по 1905 год, под заглавием «Дневники святого Николая Японского».
Сначала, однако, мы не знали, каков общий объем дневников, хранящихся в РГИА. Неизвестно было также, с какого по какой год вел дневник св. Николай.
Сотрудница ЦГИА Марина Данилушкина в своей статье «Святитель Николай Японский и его „Дневники”», опубликованной в «Московском журнале» (№ 8 за 1992 год), пишет следующее об общем объеме дневников: «„Дневники” представляют собой 35 рукописных томов, в среднем по 200–300 страниц каждый, исписанных мелким аккуратным почерком, и охватывают огромный период жизни Святого — с 1870 по 1912 год. После кончины Святителя эти бесценные рукописи были перевезены из Токио в Санкт–Петербург и переданы на хранение в Архив Святейшего Синода, где находятся по сей день (в составе ЦГИА СССР. Фонд 834, опись 4, ед. хранения 1137–1172)».