В 1781 году отец Макарий был назначен казначеем Николо-Пешношской обители, а позднее стал её настоятелем. Число богомольцев в монастыре с каждым годом умножалось, а вместе с ними появились и средства для его благоукрашения. Уже в первые годы правления отца Макария Николо-Пешношская обитель стала образцом для других пустынных обителей. Её называли училищем благочестия, примером монашеской жизни.
В 1795 году обитель посетил митрополит Московский Платон (Левшин). Он был так изумлен порядком и чиноположением, чистотой и хозяйственностью, что сказал: «Пешноша в моей епархии — вторая Лавра». Митрополит Платон поручал ведению отца Макария многие обители, в которых тот должен был заводить общежитие по образцу своего монастыря и назначать в них настоятелей из числа своей братии.
Скончался архимандрит Макарий в 1811 году, на шестьдесят первом году жизни.
Летописец Николо-Пешношской обители иеромонах Иероним (Суханов) написал об архимандрите Макарии: «Истинное достоинство жизни состоит в добродетели, а не в явлении чудес, и по сему многие, хотя и не творят чудес, однако равны чудотворцам бывают. Но и во всяком веке были люди ангельской чистоты, а иначе мир не мог бы стоять... Из таковых был и сей муж».
Симонов и Новоспасский московские монастыри
В Москве главными средоточиями Паисиевского движения были Симонов и Новоспасский монастыри.
Симонов Успенский мужской монастырь основал преподобный Феодор, ученик и племянник преподобного Сергия Радонежского, в 1370 году. В этой обители в разное время жили многие известные подвижники и церковные деятели: преподобный Кирилл Белозерский, преподобный Ферапонт Можайский, преподобный Максим Грек; святитель Иона Московский, митрополит Геронтий, Патриарх Иосиф и святой Патриарх Московский и всея Руси Иов.
Симонов монастырь был одним из богатейших на Руси, но в 1771 году, когда правительство Российской империи отбирало имущество у многих обителей, Симонов монастырь был вообще упразднён, а вновь открыт только почти через четверть века, в 1795 году по ходатайству Московского городского головы Афанасия Ивановича Долгова и других крупных купцов.
Настоятелем его тогда же был назначен архимандрит Игнатий (Ушаков), ученик преподобного Клеопы Островского, перемещённый из Большого Тихвинского монастыря Новгородской епархии в Симонов монастырь для учреждения в нём общежития.
В Симоновом монастыре подвизался ученик старца Паисия монах Павел. В 1812 году он много пострадал от французов, которые били его так жестоко, что все остальное время своей жизни он от этого болел. Там же, в Симоновом монастыре жил другой ученик старца Паисия, монах Арсений. Учеником отца Павла был иеромонах Иосиф, настоятель Симонова монастыря.
В московском Новоспасском монастыре замечательными старцами были иеромонахи Филарет и Александр, ученики Паисиева ученика Афанасия, проживавшего одно время во Флорищевой пустыни Владимирской епархии. Схимонах Афанасий (его нужно отличать от Афанасия (Охлопова), принёсшего «Добротолюбие» митрополиту Гавриилу), бывший ротмистр гусарского полка, по фамилии Захаров, жил при старце Паисии более семи лет и принял от него монашеский постриг.
Приезжая из Флорищевой пустыни в Москву, старец Афанасий вёл с отцами Александром и Филаретом беседы об умном молитвенном делании по учению старца Паисия. Оба эти иеромонаха заочно знали старца Паисия, любили и почитали его и пользовались переведёнными им отеческими книгами, а отец Александр даже переписывался с ним. Таким образом, оба эти Новоспасских инока очень близко стояли к старцу Паисию и много пользовались его духовным богатством.
Иеромонах Филарет (Пуляшкин), старец Новоспасского монастыря
Знаменитый московский старец, иеромонах Филарет родился в 1758 году в городе Вязьме, в благочестивой купеческой семье Пуляшкиных и в крещении был наречён Феодором. Его отец был любителем душеполезного чтения и имел много духовных книг. В родительском доме Феодор был обучен грамоте и Закону Божию.
После смерти отца он, будучи 13 лет от роду, упросил свою мать отпустить его для постоянного жительства в Александро-Невский монастырь в Санкт-Петербурге. Впоследствии и мать приняла монашеский постриг в московском Новодевичьем монастыре. Она умерла через много лет, во время богомолья в Ростов Великий, где настоятелем Спасо-Яковлевского Димитриева монастыря был тогда её старший сын архимандрит Аполлинарий.