Разоблачение лжеучёных, прекращение финансирования не приносивших пользы обществу паранаучных структур снижали влияние, а иногда и вели к полной дезинтеграции паразитических мафиозных группировок.
Действенной мерой против представителей мафиозных групп было их моральное осуждение. Нередко из-за фактического бойкота со стороны подчинённых, им приходилось покидать высокие научно-административные посты, на которые их продвинули сообщники.
В послевоенное время существенно ослабило позиции клановых мафий в ряде областей культурной и научной жизни страны предоставление льгот и привилегий участникам боевых действий. Так, декан физического факультета Московского университета А. А. Соколов, при поддержке ряда видных учёных, организовал подготовительные курсы для бывших фронтовиков. В результате многие талантливые ребята, которым в 1941-45 гг. вместо обучения мирным профессиям пришлось защищать Родину, получили высококачественное образование. На курсах преподавали (без дополнительной оплаты) выдающиеся учёные-профессора Д. Д. Иваненко, А. А. Соколов, Н. С. Акулов, А. А. Власов, В. Ф. Ноздрев и другие.
На физ-факе МГУ велась борьба и с искусственным занижением оценок на вступительных экзаменах способным абитуриентам:
"А. Ф. Кононков столкнулся и с таким явлением: демобилизованные участники войны на экзаменах получали заниженные оценки и не проходили по конкурсу. Когда они приходили в деканат забирать документы, А. Ф. Кононков направлял их на повторные экзамены к другим, более объективным преподавателям, и многие из них набирали соответствующие баллы для приёма в МГУ. Позже многие из них не только успешно закончили факультет, но и защитили кандидатские и докторские диссертации. Некоторые из них работали над проблемами ядерной физики в Дубне и иногда, бывая в Москве, заходили и благодарили А. Ф. Кононкова за помощь при поступлении на учёбу в МГУ"[211]
Клановые мафии, чьи "интересы" оказались ущёмлёнными в результате приёма на физический факультет МГУ способных студентов из числа бывших фронтовиков, не позабыли участников и организаторов этого дела. Так, заместителю декана физ-фака по учебной работе А. Ф. Кононкову на протяжении нескольких лет чинились помехи в защите кандидатской диссертации. В конечном счёте, для рассмотрения его диссертации, основанной на нескольких опубликованных книгах по истории физики в России, пришлось создать специальный совет из докторов, профессоров, специалистов по истории естественных наук[212]. В 1954 г. клановые мафии добились снятия с поста декана физического факультета МГУ А. А. Соколова и увольнения из университета выдающихся учёных Н. С. Акулова и В. Ф. Ноздрева.
Во 2-й половине 1940 — начале 50-х гг. существенно ослабили клановые группировки проводившиеся по инициативе Сталина широкомасштабные дискуссии в физиологии, языкознании, обществоведении. Дискуссии освещались в прессе и способствовали выявлению реальной силы аргументов различных научных школ, раскрытию их общественно-политических позиций, а также созданию атмосферы нетерпимости к лженауке и групповщине. Они стали поддержкой для многих настоящих учёных, "задвинутых" клановыми кликами. В качестве экспертов в дискуссиях выступали не только специалисты, но и народ, здравым смыслом оценивавший качество аргументов, честность и методы участников, а затем выносивший им моральную оценку.
Летом 1950 г. в ходе дискуссий о положении в языкознании, материалы которых публиковались в центральных газетах, был раскритикован монополизм представителей школы академика Н. Я. Марра, высказывавших ряд ошибочных положений и при этом нетерпимо относившихся к другим научным направлениям.
28 июня ― 4 июля 1950 года на объединенной сессии АН и АМН СССР прошла дискуссия о положении в физиологии, в ходе которой академик Л. А. Орбели подвергся критике за монополизацию научных исследований, диктат и подавление других точек зрения. По указанию Сталина материалы обсуждений регулярно печатались в центральной прессе. По итогам дискуссий Орбели был снят с большинства из занимавшихся им двадцати административных постов.
Эффективность кампаний против клановых мафий и групповщины снижалась из-за действий ряда партийных функционеров, являвшихся либо скрытыми троцкистами/ их агентами влияния, либо представлявших собой полезных идиотов[213].
В первые послевоенные годы представители клановых мафий по большей части не решались высказывать свои истинные убеждения и мимикрировали: писали патриотические сочинения, осуждали "преклонение перед иностранщиной"; превозносили в публичных выступлениях советских и дореволюционных русских учёных; делали доклады о восстановлении исторической правды в отношении отечественной науки и пр. Прошло ещё много времени, прежде чем они решили, что могут открыто говорить, что они на самом деле думают об этой стране.
213
К числу последних можно было бы отнести аппаратчиков УПиА Шепилова и Ю. Жданова. Так, на протяжении всего 1948 г. Агитпроп, возглавлявшийся Шепиловым, не только игнорировал критику со стороны генерального секретаря ССП Фадеева клановости во Всероссийском театральном обществе, но и попустительствовал попыткам литературной мафии организовать смещение патриотической части руководства ССП. Жданов-младший, зав. отделом науки УПиА, печально прославился своей предвзятой и некомпетентной критикой в апреле 1948 г. академика Т. Д. Лысенко.