В Малую Шуру входят отличившиеся боевики нижнего звена.
Американский исследователь Сет Дж. Джонс поясняет функции Шуры: Большая Шура определяет политику движения и решает наиболее глобальные вопросы, Малая Шура отвечает за принятие стратегических решений и решение самых насущных проблем. Например, Шурой был принят Кодекс поведения Талибана (Лаиха), который содержит предписания не вступать в сепаратные переговоры, докладывать о взятии в плен и ожидать решения руководства [22, с. 253]. Сама Шура разделена на несколько функциональных комитетов: по военным вопросам, пропаганды, финансам, религиозным вопросам, политическим вопросам и административным вопросам. Во главе каждого комитета стоит глава. При мулле Омаре главными членами Шуры помимо него самого были: мулла Берадер (губернатор Герата), Ахтар Мохаммад Мансур (министр авиации), мулла Нуруддин Тураби (министр юстиции), мулла Абдул Джалил (министр иностранных дел) и Нур Мохаммад Сагиб (главный судья Верховного суда) [22, с. 253].
Кроме того, существуют и более мелкие шуры – регионального уровня, которые также включают в себя комитеты. Штаб-квартиры всех шур находятся сейчас на территории Пакистана, в частности, в Пешаваре и Вазиристане. Известны три таких шуры: Гердийская Шура (возглавляет мулла Абдул Каюм Закир), Мирамшахская Шура (руководит Сирай Хаккани), Пешаварская Шура (возглавляет Абдул Латиф Мансур).
Следует сказать, однако, что достоверной информации о руководителях никогда не существовало, что объясняется различной точной и ошибочной информацией о их гибели в результате боевых действий. Также в руководящей структуре Талибана постоянно происходит ротация.
Исполнительная власть Афганистана при талибах была представлена Попечительским Советом исламского государства (Ды ислами доулат сарпарасти шура), который возглавлял мулла Мохаммад Раббани. Все члены кабинета, начиная от председателя правительства и до заместителей министров, считаются “исполняющими обязанности” (“сарпараст”). Заместителями премьер-министра М. Раббани являлись мавлави Абдул Кадир и мулла Мохаммад Хасан Ахунд [41].
В 1998 г. кабинет министров был представлен следующими основными министерствами: Министерство иностранных дел, Министерство обороны, Министерство внутренних дел, Министерство информации и культуры, Министерство юстиции, Министерство общественных работ, Министерство высшего образования, Министерство просвещения, Министерство ориентации и вакфов, Министерство по делам погибших и беженцев, Министерство горных дел и промышленности, Министерство планирования, Министерство гражданской авиации, Министерство сельского хозяйства, Министерство торговли, Министерство энергетики и водных ресурсов, Министерство здравоохранения, Министерство связи, Министерство по предотвращению зла и обеспечению торжества добродетели.
Здесь перечислены 19 основных министерств талибов. Особый интерес вызывает Министерство по предотвращению зла и обеспечению торжества добродетели. Это своего рода религиозная полиция. Такие министерства существовали и до талибов. Например, такое министерство и сейчас работает в Саудовской Аравии. Полицейские этого министерства патрулируют улицы городов и следят за соблюдением мусульманами дресс-кода, правил приличия и молитвы и т. д. Полицейские отличаются своим внешним видом и до 2007 года при себе имели тонкую деревянную трость, которой били нарушителей. Они имеют довольно большие полномочия [4].
Также интересна деятельность Министерства ориентации и вакфов. Иными словами, это Министерство по делам религии, в чью компетенцию входил контроль за деятельностью религиозных лиц. Оно одобряло назначение имама в мечеть, знакомилось и утверждало тексты проповедей и др. [24, с. 57].
При министерствах были созданы департаменты. Например, Главное управление по радио, телевидению и кинематографии, Управление по изучению земель и картографии и др.
Все высшие должности Исламского Эмирата Афганистан занимали исключительно духовные лица. Это говорит о теократическом устройстве государства.
Для укрепления своей власти и реализации планов по всеобщей исламизации общественной жизни руководство талибов нуждалось в сильных религиозно-пропагандистских институтах и органах подавления. Талибы возродили “Совет улемов”, который стал официально называться “Всеобщим Советом улемов и духовенства”, и которому было вменено в обязанность “разъяснение населению целей и задач правительства Исламского Эмирата и наставление мусульман на путь истины” [41].