Лоайса и Эль-Кано продолжал путь на трехсоттонном флагмане «Санта Мария де ла Виктория» («Святая Мария Победоносная»), После смерти Лоайсы 30 июля Эль-Кано становится капитан-генералом, а кормчим назначает своего брата Мартина-Переса. Через неделю, 6 августа 1526 года, Эль-Кано умер на своем корабле, сохранив до конца жизни звание единственного флотоводца, обогнувшего Земной шар. Его похоронили в море, а «Санта Мария де ла Виктория» вскоре погибла у берегов Тидоре. Королевская пенсия не дождалась того, кому она была обещана. Его поглотило море.
История странно распорядилась именами людей великой эпохи. Именем более чем скромного морехода Веспуччи назван континент, открытый Колумбом. Именем Колумба назван более чем скромный клочок открытого им континента - клочок, на который даже не ступала его нога. Имя Нуньеса де Бальбоа как первооткрывателя Тихого океана затмило имена Алонсо Мартина и Антониу д`Абреу. Магеллана очень многие и сегодня считают первым кругосветным путешественником, хотя ему не удалось завершить начатое. А для Эль-Кано, совершившего то, чего не сумел довести до конца Магеллан, не нашлось места в Большой Советской Энциклопедии...
20 июня 1526 года, обеспокоенный отсутствием известий от Эль-Кано, Карл V посылает в Мексику предписание Эрнану Кортесу выслать поисковую экспедицию к Молуккским островам, чтобы заодно доставить оттуда рассаду пряностей, а если повезет - то и садовников. 31 октября 1527 года три корабля под началом его двоюродного брата Альваро де Сааведры покинули берега Америки.
Судьба двух кораблей - «Сантьяго» и «Эспириту Санто» - неизвестна по сей день, флагманская же каравелла - пятидесятитонная «Флорида» - в первых числах марта 1523 года подошла к острову Тидоре. Там испанцы обнаружили оставшихся в живых членов экипажа «Санта Марии де ла Виктории», отбивавшихся от наседавших на них португальцев. Оставив полсотни солдат и матросов в поддержку осажденным, Сааведра 3 июня на полных парусах устремился в Мексику за подкреплением, но был возвращен к Тидоре ветрами от островов, получивших впоследствии имя Марианских. Боевые действия с переменным успехом продолжались еще около года. В мае «Флорида» снова вышла в море, но Сааведра вскоре погиб, и испанцы во второй раз вернулись к Молуккским островам, но уже не к Тидоре, а к Хальмахере. Там к ним присоединились соотечественники с Тидоре, и все вместе они немного времени спустя попали в плен к португальцам.
Еще когда Сааведра отплывал в свой последний рейс, в южных морях произошло событие, коему тогда никто не придал особого значения: только что назначенный губернатором Молуккских островов Жоржи Минезиш, отбыв из Малакки к своему губернаторству, был отброшен бурей к юго-востоку от Хальмахеры и... открыл неизвестную землю, названную им островом Святого Георгия (Исла де Сан Хорхе). Это произошло в 1526 году. А двумя годами позже на эту землю наткнулся и Сааведра. Он окрестил ее островом Золота (Исла дель Оро). То была будущая Новая Гвинея.
Ветры, бури, течения, дикари, португальцы, без вести пропадающие экспедиции - и никаких дивидендов.
Владение Молукками после всего этого показалось Карлу V чересчур хлопотным, и 22 апреля 1529 года, получив предварительно от португальцев триста пятьдесят тысяч дукатов, он подписал в Сарагосе договор, устанавливавший линию раздела в семнадцати градусах к востоку от островов Пряностей. Лишь в 1534 году шестнадцать или семнадцать уцелевших испанцев сумели вырваться с Хальмахеры из рук утерявших к ним теперь интерес португальцев, и половина из них вернулась 26 июня 1536 года на родину, завершив вторую в истории кругосветку.
Перемирие с Португалией испанцы использовали как нельзя лучше. Они спешили закрепиться в Америке, сделать ее данницей Мадрида.
В 1532 году участник экспедиции Охеды и завоевания Панамы Франсиско Писарро начинает поход на юг, уничтожает государство инков и в 1535 году основывает город Лиму - столицу нынешнего Перу. Перу открыл сам Писарро в компании с Альмагро, добравшись до перуанских берегов в 1524 году на двух кораблях с сотней человек экипажа.
В 1526 году испанцы начинают завоевание северной области инкского государства - теперешний Эквадор - и строят там крепости, быстро превращающиеся в города, такие, например, как Гуаякиль и Кито.
26 июня 1541 года Писарро погиб при дележе награбленного. Его завоевания продолжает Педро де Вальдивия, участник перуанской кампании. В 1540 году он начинает поход в Чили. В этом же году уезжает в Испанию губернатор и капитан-генерал завоеванной им в 1519-1521 годах Новой Испании (Мексики) Эрнан Кортес.