Сат Токпакбаев — опять же, как и его предшественник, — входил в ближайшее окружение президента, что автоматически усиливало его роль и расширяло спектр полномочий. Отток кадров продолжился (в частности, начальник контрразведки Третьяков ушел начальником УФСБ Челябинской области); зато — плохо это или хорошо — кадровый состав КНБ стал соответствовать общереспубликанскому, вошел, так сказать, в резонанс с общим направлением развития страны. Летом 1995 года Пограничные войска были выведены из структуры КНБ и стали самостоятельным Государственным комитетом по охране государственной границы.
В конце 1995 года его назначили начальником Службы охраны президента, а председателем КНБ стал Дженисбек Джуманбеков (кстати, аккурат к собственному пятидесятилетию). В советское время он работал по линии 5-го управления КГБ и в ряде региональных структур госбезопасности. В 1992 году он возглавил Джамбульское управление, а в 1994 году стал первым заместителем председателя КНБ.
При нем особых изменений роли и места КНБ не произошло (если не считать принятие 21 декабря 1995 года нового закона — точнее Указа президента, имеющего силу закона, — «Об органах национальной безопасности»); были изменения и позитивного, и негативного плана в оперативной и кадровой работе, однако в историю органов Дженисбек Джуманбеков вошел прежде всего своей отставкой, вызванной конфронтацией генерала с рядом влиятельных политиков и основанной на почве активизации антикоррупционной составляющей в деятельности КНБ.
Генерал-лейтенант Дженисбек Джуманбеков был смещен 12 мая 1997 года с поста председателя, а его преемником был назначен 43-летний полковник Альнур Мусаев. Через неделю он стал генералом, а все заместители предыдущего председателя КНБ были отправлены в отставку. Экс-председатель в будущем так и не смог восстановить свои позиции и в 2002 году пребывал на посту советника посольства в Узбекистане. А вот его предшественники, Булат Баекенов и Сат Токпакбаев, относятся к числу «непотопляемых»: первый руководил КНБ, Совбезом, МВД, «Группой-4», Службой охраны президента; а второй — КНБ, СОПом, Республиканской гвардией, Министерством обороны, а в 2002 году — Комиссией по служебной этике и борьбе с коррупцией при президенте…
Альнур Мусаев — контрразведчик, успел поработать в МВД СССР. Он выдвинулся осенью 1994 года, когда назначенный на пост министра внутренних дел Булат Баекенов назначил его начальником Главного управления по борьбе с организованной преступностью и коррупцией. Через год он стал помощником президента; а в 1996 году он был переведен первым заместителем Сата Токпакбаева в Службу охраны президента.
Его амбиции и близость к фактическому руководителю налоговой полиции Рахату Алиеву привели к резкой политизации деятельности КНБ. Альнур Мусаев выступил с рядом обвинений в адрес премьер-министра Акежана Кажегельдина; иезуитски попытавшись дискредитировать последнего фактами сотрудничества с собственной же «конторой». Однако Акежан Кажегельдин, чьи врожденные способности к PR-акциям проявились к тому времени в полную силу, довел эти обвинения до абсурда и фактически выхолостил их суть. В бушевавшей весь 1997 год практически открытой войне администрации и парламента против правительства КНБ сыграл свою роль, додавив премьера расследованием фактов коррупции с его стороны.
Осенью 1997 года — после смены правительства — КНБ подвергся определенной реорганизации, которой столь противились все прежние руководители. Департамент разведки был преобразован в самостоятельную Службу «Барлау», подчиненную непосредственно президенту и формально уравненную с самим КНБ (шеф «Барлау» генерал-майор Женис Рыспаев, в прошлом военный контрразведчик, вошел в состав Совбеза наравне с руководителями прочих силовых структур).
1998 год вошел в историю КНБ как год многочисленных реформ. По количеству ежемесячных реорганизаций, оптимизаций и функционализаций лето 1998 года поставило до сих пор не преодоленный рекорд.
Для выхода из сложившейся ситуации и из-за ухудшения макроэкономической обстановки руководство республики приняло решение о проведении досрочных президентских выборов, призванных мобилизовать элиту и отчасти таким образом пресечь брожения и интриги внутри нее. В этих условиях было сменено руководство администрации президента и основной спецслужбы. В частности, первый помощник и ближайшее доверенное лицо президента Нуртай Абыкаев назначен председателем КНБ.
Нуртай Абыкаев первым делом приумножил свое «достояние»: через неделю после его назначения разведка вернулась к прежним хозяевам, став Службой «Барлау» КНБ. «Раскольник» Женис Рыспаев был смещен, а его место временно занял зампред КНБ Нуртай Дутбаев (к слову сказать, контрразведчик).