На третий день, 25 октября, к вечеру сражение утихло. Русские потеряли в этом бою 107 человек, а сибирцы и того больше. С той и другой стороны было много раненых, все были измождены упорным сражением. Ермак отвел своих людей за реку и «обначеваша со стражею».
Кучум, видя бегство своего войска, удрученный ранением главнокомандующего — любимого племянника Магомета-Кули, — посчитал бой для себя проигранным и в мочь на 26 октября, «видев царства своего конечное лишение и разорение всем», оставил Кашлык. «И вси из града невозвратно бегаша на степь, в Казачью орду…», — говорит летопись. В эту ночь татары покинули и все близ лежащие городки: Сузгун, Бицик, Абалак и другие.
26 октября 1582 года Ермак без боя занял опустевшую столицу недавно еще грозного Сибирского ханства.
Проигранный бой и потеря столицы серьезно подорвали престиж хана Кучума. О захвате русскими Кашлыка и о том, что войско хана разбито, быстро узнала вся страна. «Промчеся слых о Ермаке и о казацех во всю Сибирскую страну».
Многие ханты и манси очень быстро признали власть русских, в которых они видели избавителей от татарского гнета. Уже на четвертый день после занятия Кашлыка к Ермаку пришел «остяцкий князь, именем Бояр, со многими остяки и привезоша с собою многие дары и запасы».
В числе изъявивших покорность Ермаку были и мансийские князьки Суклем и Ишбердей, оказавшие большие услуги казакам. Ишбердей, например, «яко первее многих взыска князков и приведя в ясак и ясак принесе, и пути многи сказа, и на немирных казаком вожь изрядной был и верен велми».
Казакам подчинились и некоторые татарские феодалы, недовольные Кучумом, видевшие в русских грозную силу.
Ермак радушно принимал всех приходивших с покорностью, облагал их небольшим ясаком и, не ломая сложившихся в стране порядков, отпускал «жить в домах своих по-прежнему».
Дружинники свободно ездили по окрестным селениям, не опасаясь нападения. Но, разумеется, борьба была еще далеко не кончена. Захват Кашлыка вовсе не означал полного разгрома сил Кучума, который, откочевав в недоступные для русских степи, постоянно тревожил их своими нападениями. Так, в декабре двадцать казаков, поехавших на рыбную ловлю на Абалацкое озеро, были поголовно перебиты отрядом Магомета-Кули. Ермак погнался за татарами и разгромил их отряд в урочище Шашминском, но сам Магомет-Кули сумел бежать.
С Кучумом предстояла еще долгая и тяжелая борьба, а малочисленному русскому отряду было не под силу длительное время продержаться даже в такой хорошей по тому времени крепости, как Кашлык. Строгановы не могли дать казакам серьезных подкреплений. Ермак прекрасно понимал, что размеры дела, которое начали казаки, уже давно переросли рамки одних лишь строгановских интересов. Это дело имело общегосударственное значение. Поэтому Ермак Тимофеевич решил донести о завоеваниях своего отряда непосредственно самому царю Ивану Грозному и просить московское правительство о крупной военной помощи.
22 декабря 1582 года Ермак послал в Москву атамана Ивана Кольца с собранным ясаком, «вестовой отпиской» о результатах похода и просьбой о помощи. Посольство повел Ишбердей со своими людьми «волчьей дорогой» — зимней тропой через Средний Урал. Послы ехали на оленьих и собачьих упряжках. В январе 1583 года они уже были в Москве и «били челом» Сибирским царством Ивану Грозному.
Посылка Кольца, осужденного ранее на смертную казнь за нападение на ногайцев и персидских послов на Волге, была очень рискованным шагом, но Ермак был твердо уверен, что результаты его экспедиции будут оценены правительством. И он не ошибся: Иван Грозный не только «простил» казаков, но и «посла денег и сукон, иных всяких товаров, вина и запаса со множественным удовольствием». Сам Ермак Тимофеевич был «пожалован» двумя панцирями (вероятнее всего кольчугой и панцирем), двумя кубками и шубой с царского плеча. Казакам было обещана военная помощь.
Посольство возвратилось из Москвы знакомой дорогой через Средний Урал и 1 марта было уже в Кашлыке.
Во время отсутствия Ивана Кольца 20 февраля 1583 года казаки получили сведения о том, что Магомет-Кули стоит на реке Вагае в ста верстах от Кашлыка. Ермак послал к Вагаю свой отряд, который ночью внезапно напал на татарский стан, разгромил его и захватил в плен самого Магомета-Кули. Пленение этого лучшего татарского военачальника было большой удачей для Ермака и тяжелым ударом для сибирского хана.
Были у хана и другие неприятности. На него из казахских степей пошел войной царевич Сеид-Ахмат, племянник убитого Кучумом хана Эдигера. Карача, имевший в стране большой авторитет, под влиянием раздоров между крупными татарскими феодалами покинул Кучума и откочевал в Барабинскую степь. Все это вызвало в лагере Кучума замешательство. Воспользовавшись им, Ермак всю весну и лето посвятил покорению татарских, хантских и мансийских городков и земель вниз по Иртышу, по Оби и Тавде.