Но крайне неудачный для СССР начальный этап войны очень быстро начал сказываться и на положении флота. Уже 23 июня на развернутом до войны (21 июня 1941 года) у входа в Финский залив немецком минном заграждении "Апольда" погиб эсминец "Гневный" и был тяжело поврежден крейсер "Максим Горький". Обстановка на фронтах и особенно в Прибалтике быстро ухудшалась, где за первые две педели войны гитлеровская армия продвинулась на 500 километров. Продвижение её было настолько стремительно, что возникла реальная угроза захвата ряда ремонтируемых кораблей прямо в Либавской (Лиепайской) гавани.
Имея разобранные механизмы, эскадренный миноносец "Ленин" и шесть подводных лодок, находящихся в Лиепае на судоремонтном заводе "Тосмаре", не смогли выйти из гавани. В итоге в ночь на 24 июня эсминец вместе с другими кораблями был взорван у причалов. Но оборона Лиепаи продолжалась ещё неделю, и не было ли решение об уничтожении кораблей поспешным?
В период оккупации "Ленин" был поднят, но затонул в гавани при попытке буксировки. Остов его осенью 1953 года был поднят аварийно-спасательной службой Балтийского флота и разобран на металл.
А в это время четыре из шести остающихся в составе флота "новиков" в числе других сил флота прикрывали развертывание "центральной минной позиции" на входе в Финский залив. "Операция по развертыванию", с блеском проведенная царским Балтийским флотом под руководством адмирала Эссена в первые часы войны 1914- 1918 годов, теперь заняла целую педелю и, тем не менее, не была завершена окончательно в связи со стремительным продвижением немецких войск.
В конце июня в связи с продвижением противника на сухопутном фронте, создавшим угрозу на флангах центральной минно-артиллерийской позиции в устье Финского залива, было принято решение о быстрейшем образовании такой позиции в восточной части залива на линии о. Гогланд - Большой Тютерс - бухта Кунда. Для минных постановок сформировали специальный отряд кораблей под командой контр-адмирала Ю.Ф. Ралля. в состав которого вошел и эскадренный миноносец "Калинин".
27 нюня дивизион эсминцев в составе: "Яков Свердлов" 2*. "Артем", "Карл Маркс", "Володарский" выходят из Кронштадта в Таллин, куда прибывают 29 июня 1941 г. Уже 30 июня "Яков Свердлов", вместе с "Володарским", прикрывают минный заградитель "Марти". выходящий на минную постановку.
1-2 июля 1941 года "Яков Свердлов", "Артем" "Володарский", находясь в составе многочисленного боевого охранения, прикрывают переход в Кронштадт из Таллина линкора "Октябрьская революция".
Для боевых действий на Балтике бои надводных кораблей оказались не характерны, хотя первый такой бой произошел 6 июля 1941 года, в 13 ч 19 мин, когда вышедшие на минную постановку эсминцы "Сердитый", "Сильный", "Энгельс" и сторожевой корабль "Туча" в районе мыса Овиши вступили в перестрелку с двумя немецкими тральщиками и плавбазой. По её окончании советской стороной было заявлено о повреждении двух кораблей противника. (25). В свою очередь один из советских эсминцев получил попадание в кормовую часть "с возгоранием мин, приготовленных к постановке" и был спасен лишь "героическими действиями краснофлотцев"
Шли первые месяцы войны. Положение на фронтах продолжало ухудшаться. Флот нес потери. 7 августа на рейде Рогокюля в бухте Мухувейн тяжелые повреждения получил эскадренный миноносец "Энгельс". Авиационный налет застиг корабль в 18 ч 50 мин, в момент приемки топлива. На "Энгельсе" успели прекратить заправку, выбрать якорь, но не успели начать движение. Атаковав не набравший хода корабль с обоих бортов, авиация противника добилась одного попадания вблизи борта эсминца 250-кг бомбой, причинив ему тяжелые повреждения.
Набор корпуса между машинным и котельными отделениями был поврежден, правая турбина вышла из строя, сместились с фундаментов кормовые орудия, были выведены из строя машинный телеграф, привод рулевой машины, магнитные компасы. Тем не менее потери в личном составе отсутствовали.
Гораздо хуже обстояло дело с нефтеналивной баржой-заправщиком "Спиноза", получившей попадание такой же авиабомбой в кормовую часть. Она тонула, на ней было много раненых. Приняв пострадавших со "Спинозы", "Энгельс" своим ходом пришел на ремонт в Таллин и стал в док для предварительного ремонта перед уходом в Кронштадт.
Не прошло и суток, как в бухте Локса при авиационном налете был потоплен "Карл Маркс".
2*В ходе последнего перед войной ремонта со "Свердлова " сняли функции штабного корабля, и во многом размещение экипажа было приближено к первоначальному проекту.
Эсминец "Ленин" в Лиепае. 1941 г.
Эсминец "Калинин" в различные периоды службы
Эсминец "Карл Маркс". Август 1941 г.
Выйдя из Таллина в залив Харалахт 4 августа 1941 года, корабль под командованием Л.В. Дубровицкого получил приказ на оказание поддержки дозорных судов (Линия о. Вайдло – о. Кери) и поддержки огнем фланга отступающих сухопутных сил.
Около 13 ч дня 8 августа "Карл Маркс" был атакован у пирса, но успел сняться со швартовых. Личный состав занял боевые посты, но интенсивный зенитный огонь не смог помешать прицельному бомбометанию – две авиабомбы поразили корабль, в том числе машинное отделение. На корабле возник сильный пожар. Несмотря на самоотверженные действия экипажа, корабль лег на грунт, погрузившись в воду по верхнюю палубу. На следующий день подошедшее спасательное судно "Нептун" и два торпедных катера под стрелковым огнем немецких частей сняли остатки экипажа, и отступая, взорвали эсминец.
К 18 августа в Таллине был завершен предварительный ремонт эсминца "Энгельс", и 24-го корабль вышел в Кронштадт. Караван из семи кораблей конвоировали: "Энгельс", шесть тральщиков и два морских охотника.
В 17 ч 4 мин у мыса Юминда на поверхности прямо по курсу были обнаружены три плавающие гальваноударные мины. Шедший впереди "Энгельса" теплоход "Андрей Жданов" обогнул их благополучно, но когда, эсминец начал описывать циркуляцию вправо, под его кормой взорвалась мина.
Взрыв был настолько силен, что несколько человек были сброшены за борт, корабль потерял ход и управление. Ветром его начало сносить на плавающие мины с левого траверза. Дрейф удалось прекратить, срочно отдав левый якорь. Подошедший катер "МО -201" снял с корабля раненых и секретную документацию. Борьба за живучесть продолжалась, но "Энгельс", тем не менее, все же погружался кормой. Через 10 мин палуба ушла в воду до третьей пушки. Капитан 3 ранга В.П.Васильев приказал подготовить экипаж к эвакуации и заложить подрывные патроны.
Через 15 минут ледокол "Октябрь" взял аварийный корабль на буксир, но уже через 4 минуты, в 17 ч 35 мин последовал взрыв 2-й мины – на этот раз в районе кормового мостика. Почти одновременно последовала детонация боезапаса артиллерийского погреба. Сильнейшим взрывом подводная часть в районе кормы была, по всей видимости, практически уничтожена. За борт рухнула грот-мачта, высоко в воздух взлетела кормовая пушка и многочисленные обломки конструкции.