С. С. Юдин все же допускал мысль о возможности ареста, поскольку он в кругу знакомых как-то сказал, что в кратком курсе истории партии не было правды. И, проезжая мимо НКВД на Лубянке, всегда крестился и шептал «Пронеси Господи».
После смерти ведущего хирурга Шереметевской больницы В. А. Красинцева, Нарком здравоохранения Н. А. Семашко назначил С. С. Юдина главным хирургом этой больницы в 90 коек. Вскоре больница значительно увеличилась, на ее базе была организована кафедра неотложной хирургии, а С. С. Юдину присвоено звание профессора Honoris causa. Больница же была переименована в Институт скорой помощи им. Н. В. Склифосовского. Одновременно С. С. Юдин был назначен директором Института хирургии им. А. В. Вишневского РАМН и заведующим кафедрой военно-полевой хирургии ЦОЛИУВ.
Практическая и научная работа под руководством С. С. Юдина всегда отличалась чрезвычайной интенсивностью. Уже в 8.00 утра Сергей Сергеевич осматривал тяжелых больных, затем много оперировал, потом читал лекции. После обеда (он жил во дворе Института) спал 1 час, а затем занимался научной работой до 3-х часов ночи. Вечером проводился повторный осмотр оперированных и вновь поступивших больных.
С. С. Юдин не мыслил хирургическую деятельность без постоянной научной работы.
С. С. Юдин у входа в операционный блок Института им. Н. В. Склифосовского (1944)
В 1943 г. С. С. Юдин подводит 25-летний опыт хирургического лечения язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки. Количество наблюдений составило: 1372 операции по поводу хронических язв, 2020 операций по поводу прободений, 427 вмешательств по поводу кровотечений, т. е. 3824 операции, не считая 1496 операций, произведенных по поводу рака и других заболеваний желудка.
Впоследствии он написал монографию и назвал эту книгу «Этюды желудочной хирургии», которая стала настольной книгой не только для хирургов, но и врачей других специальностей. В основе книги использовано свыше 17 000 собственных клинических наблюдений. Однако опубликовать ее удалось только его ученикам в 1955 г. после его смерти.
Среди множества научных проблем С. С. Юдина особенно привлекала желудочная хирургия. Первые свои 42 резекции желудка он сделал еще работая в «Захарьино».
Имя С. С. Юдина как хирурга желудка и пищевода известно всему миру. О себе и своей роли в развитии желудочной хирургии он говорил очень скромно «… я давно встал на тот путь в желудочной хирургии, который стал общепризнанным и в развитие коего на мою роль выпала роль все же довольно заметная».
Роль Сергея Сергеевича в желудочной хирургии была столь велика, что ее трудно переоценить.
Главный хирург английского флота контр-адмирал Гордон-Тейлор в 1944 г. писал: «Никогда Королевский колледж хирургов, присвоивший звание Почетного члена колледжа Юдину, не давал своего диплома более достойному претенденту» (в бывшем СССР и по настоящее время дипломами Почетного члена английского Королевского колледжа хирургов были награждены только: С. С. Юдин, Б. В. Петровский, А. А. Бунатян).
Работая еще в «Захарьино», неоднократно и с большим сожалением, обидой и досадой, Сергей Сергеевич вспоминал поучительный пример двойной неудачи, которую ему довелось увидеть и запомнить на всю жизнь.
Дело касалось очень известного режиссера Евгения Вахтангова, чье имя ныне носит драматический театр в центре старого Арбата, где он работал. Одна из его актрис, побывавшая в «Захарьине», убедилась, что там все врачи великолепные специалисты.
Е. Вахтангов, приехав в «Захарьино». пришел в неописуемый восторг от роскошного здания больницы, дивного «Захарьинского» парка и, безусловно, от интеллигентного, а также высокопрофессионального общества врачей. Так как Е. Вахтангов уже давно страдал желудочной язвой и безуспешно лечился несколько лет подряд, то его нетрудно было уговорить лечь для операции в «Захарьино».
Он согласился и вскоре его оперировал Н. К. Холин в Старо-Екатерининской больнице при ассистенции Г. Л. Тара. Тогда была сделана задняя гастроэнтеростомия. Однако уже через месяц или два после операции, незажившая каллезная язва стала снова так мучить больного, что он вынужден был лечь вторично уже в «Захарьино», для повторной операции.
С. С. Юдин в мантии Почетного члена Королевскою колледжа хирургов Великобритании. В руках диплом Почетного члена в футляре, изготовленный на папирусе (1944)
Вторую операцию сделал теперь уже Г. Л. Гар при ассистенции Н. К. Холина. Было выполнено иссечение язвы малой кривизны клиновидным способом. На этот раз результат был лучше: боли практически исчезли и Е. Вахтангов смог существенно расширить свою диету.
В благодарность за две операции, вся трупа театра приехала в санаторий и поставила спектакль «Чудо святого Антония». Режиссером был сам Е. Вахтангов.
Однако и вторая операция не помогла окончательно, ибо через год или полтора Е. Вахтангов умер от рака желудка. «Итак, экономная клиновидная эксцизия не удалила уже проникших за пределы видимой язвы клеток ракового перерождения застарелой язвы. А более широкую резекцию желудка Г. Л. Гар не смог сделать потому, что этому мешала сделанная Н. К. Холиным задняя гастроэнтеротомия».
Эта двойная неудача, ставшая причиной трагической смерти, несмотря на весь профессионализм таких опытных хирургов, послужила уроком Сергею Сергеевичу, и он сделал для себя серьезные, обоснованные и аргументированные выводы (будучи еще совсем молодым врачом), что как паллиативные соустья, так и экономные иссечения не могут претендовать на то, чтобы стать методом выбора хирургического лечения язвенной болезни.
Впоследствии, неоднократно с большим сожалением, чувством горечи и досадой, Сергей Сергеевич вспоминал трагический пример неудачи с операцией у Е. Вахтангова, которую ему довелось увидеть в «Захарьине» и запомнить на всю оставшуюся жизнь.
Работы по желудочной хирургии принесли С. С. Юдину вполне заслуженное всемирное признание. Его блестящие доклады поражали и всегда восхищали неожиданностью суждений и выводов, а также вызывали живой интерес и горячие прения.
«С. С. Юдин, писал в „Британском союзнике“ Дж. Гордон-Тейлор, — один из величайших хирургов мира, это без всякого сомнения самый смелый новатор гастрической хирургии».
С. С. Юдин делал резекцию желудка (это неважно, будь то язва, рак, прободение, кровотечение и так далее) за 20–30 мин, что пока еще никем не воспроизведено в мире.
Явно и рано убедившись в бесполезности гастроэнтеростомии, равно как и других паллиативных операций, С. С. Юдин, неутомимо преодолевая все сопротивления, шел научным путем к намеченной цели.
У парадного входа в Институт им. Н. В. Склифосовского. В центре С.С.Юдин. Слева от него — главный хирург английского Королевского флота, контр-адмирал Гордон-Тейлор, справа — Элист К. Кетлер, профессор Гарвардского университета, главный хирург Питер Бенд Брукс Бригхам госпиталя (главный хирург США)
К концу 1934 г., в период нарастающей дискуссии, в Институте им. Н. В. Склифосовского был накоплен опыт 1000 операций по поводу прободения желудка и двенадцатиперстной кишки.
К 1938 г. С. С. Юдин выступил и сказал: «И если еще сторонники гастрэктомии насчитывались немногими единицами, а публикуемый материал был еще не велик, то ныне настало время для значительных итогов».
Дискуссии протекали в обстановке не всегда доброжелательной, однако сила убеждений, подкрепленная удивительным практическим опытом, позволяла преодолеть необычайные трудности которые стояли на пути радикального хирургического лечения язвенной болезни.
В довоенные годы ученик Сергея Сергеевича, профессор А. А. Бочаров делал эксперименты на трупах, пытаясь перевязать четыре желудочные артерии, с целью выяснить можно ли таким путем остановить желудочное кровотечение. Этот эксперимент показал, что перевязка желудочных сосудов не в состоянии достичь адекватного гемостаза, вследствие очень хорошего развития внутрижелудочных анастомозов и обширной связи селезеночной артерии через мелкие короткие ретродуоденальные артерии желудка и верхней брыжеечной артерией.