После ликвидации большевиками Совета еврейских общин нужда в общественных организациях снова возросла: на них, как и при самодержавии, вновь легли функции, отнятые у демократической общины. В июле 1920 г. по инициативе Евкома образовался Еврейский общественный комитет (Евобщестком или Идгезком — идиш) для помощи пострадавшим от войны и погромов. Хотя Евобщестком с самого начала был поставлен под контроль еврейских коммунистических учреждений, представители ЕКОПО, ОЗЕ, ОРТа также были включены в его состав, так как их участия потребовали иностранные организации помощи. Присоединение к Евобщесткому позволило общественным организациям выйти из финансового тупика и расширить свою деятельность.
Комитеты общественных организаций были переведены в Москву, однако их петроградские отделения продолжали работу. Во второй половине 1920 г. в Петроградский Комитет ОЗЕ входили М.Гран, Я.Эйгер, Н.Гарвинт, В.Биншток, Г.Гольдберг, М.Эльяссон, Г.Дембо, Н.Шварц, а Петроградское Правление ОРТа состояло из Б.Бруцкуса, Д.Хазана, М.Гинзбурга, И.Каменецкого, Я.Цегельницкого, М.Матисона (Магидсон?). В Петрограде ОЗЕ имело амбулаторию и санаторий на 35 пациентов. По согласованию с Евобщесткомом ОЗЕ помогало как еврейским, так и латышским беженцам. Видимо, в немалой степени благодаря петроградским общественным организациям помощи, в особенности ОЗЕ и ЕКОПО, в тяжелейший период военного коммунизма заболеваемость и смертность петроградских евреев были значительно ниже, чем у остального населения. Усилия же ОРТа по оказанию помощи евреям в переходе к земледельческому труду приносили, очевидно, более чем скромные результаты даже на Украине и в Белоруссии, не говоря уж о самом Петрограде.
Работа общественных организаций в Евобщесткоме проходила в трудных условиях из-за непрерывного давления Наркомнаца и Евсекций. Политика Евсекции по отношению к ЕКОПО, ОЗЕ, ОРТ заключалась в установлении контроля над этими организациями через Евобщестком и, посредством большевизации их состава, в постепенном их поглощении соответствующими государственными учреждениями — Собесом, Наркомздравом, Наркомпросом. В руководстве Евсекции были и сторонники немедленной ликвидации этих организаций. Оставаясь в Евобщесткоме в меньшинстве, еврейские общественные организации были не в силах противостоять его идеологизированной и безответственной по отношению к нуждающимся политике. Однако ОРТ, ОЗЕ и ЕКОПО, учитывая масштабы катастрофы, обрушившейся на евреев, по мере сил продолжали сотрудничать с государственными учреждениями и с Евобщесткомом, несмотря на регулярные ущемления их прав и нападки коммунистов. Только когда в начале января 1921 г. руководству общественных организаций стало известно о планах Евотдела Наркомнаца заменить составы их комитетов на угодных Наркомнацу лиц, ЕКОПО, ОРТ и ОЗЕ вышли из Евобщесткома. Двумя-тремя месяцами позже ЕКОПО перестал существовать, так и не поддавшись советизации.
С марта 1921 г. продолжали работать только петроградский и московские комитеты ОЗЕ. Принципиальная позиция не склонного к советизации руководства обрекала ОЗЕ на судьбу ЕКОПО, хотя в его введении находилось множество нуждающихся, заниматься которыми, в случае закрытия Общества, пришлось бы государству. В июне или начале июля 1921 г. Петроградская Межведомственная комиссия по утверждению обществ и союзов постановила закрыть ОЗЕ. Постановление было принято в тот момент, когда в Гомельско-Мозырском районе работали летучие отряды ОЗЕ, организованные при содействии Наркомздрава и помогавшие жертвам только что прошедшей погромной волны. Однако 14 июля ликвидация ОЗЕ была неожиданно приостановлена властями «вплоть до особого распоряжения». Видимо, в момент подготовки декрета о создании общественного Комитета помощи голодающим под руководством Екатерины Кусковой (образован 21 июля) показалось неудобным распускать еврейскую организацию помощи. Правда, месяцем позже, когда соглашение между советским правительством, Комиссией Ф.Нансена и Американской организацией помощи (American Relief Administration, АРА) о поставке продовольствия голодающим было подписано, Комитет помощи голодающим был немедленно распущен, а его члены арестованы.
Подобная участь не постигла членов Комитета ОЗЕ потому, что власти испытывали нехватку высококвалифицированных врачей и не хотели ссориться с Джойнтом, участвовавшем в программе АРА. Однако в декабре, когда помощь голодающим уже поступала из-за границы, Комитет ОЗЕ получил распоряжение Наркомнаца о ликвидации всего своего имущества в течение двух недель.