Советские еврейские учреждения вмешивались во все стороны общественной жизни евреев. В марте 1918 г. Евкомом было опубликовано обращение «ко всем, кто интересуется деятельностью еврейских общественных учреждений» с просьбой доносить «о всем ненормальном, что там происходит». Власти взяли под контроль финансы общественных организаций, которые уже и так лишились субсидий из правительственного и городского бюджетов. В феврале 1918 г. Евком назначил комиссара по делам ЕКОПО, инвалида войны Аренберга, который за две недели установил контроль над денежными операциями Комитета, скрепляя своей подписью все его ассигнования. В апреле Евком предложил петроградским банкам не выдавать денег по чекам еврейских общественных учреждений без подписи на них комиссара по еврейским делам. К 1 октября 1918 г. Губкомнац потребовал от еврейских обществ и благотворительных учреждений подробные отчеты об их деятельности. Так как еврейской общественности не удалось созвать Всероссийский еврейский съезд, вместо него в марте 1918 г. петроградские делегаты Съезда образовали Временный Национальный еврейский совет. Нечего и говорить, что Национальный совет подвергался ожесточенным нападкам евкомовской прессы, окрестившей его «новым оплотом еврейской реакции и мракобесия». Большинство оскорблений, за «соглашательство» с сионистами, доставалось лидерам социалистических партий, «господам Либерам, Заславским, Рафалькесам,» так как членов именно этих партий Евком старался перетянуть на свою сторону. В июле Национальный совет был заменен избранным в Москве Центральным Советом Союза еврейских общин (ЦЕВААД). Годом позже, 19 июня 1919 г. постановлением Евкома ЦЕВААД и местные общинные советы, включая петроградский, были закрыты «навсегда», а их имущество и денежные средства конфискованы.
Подобно тому, как типографии закрытых независимых русских газет передавались большевистской прессе, Евком прибирал к рукам оборудование конфискованных еврейских типографий Петрограда. Так, в августе 1918 г. заведующий Отделом пропаганды и агитации центрального Евкома Залман Хайкин добился реквизиции закрытой властями типографии сионистского Тогблата и перевода ее в Смоленск с целью издания там коммунистической газеты.
Политически правовой отдел Губкомнаца ведал регистрацией и ликвидацией старых обществ и организаций. Его еврейский подотдел поначалу ликвидировал только Комитет Еврейского общества поощрения высших знаний, и без того, видимо, прекратившего существование из-за отъезда за границу его председателя и патрона — Моисея Гинсбурга. Двенадцать других еврейских учреждений были до поры признаны и зарегистрированы комиссариатом. Еврейские коммунисты контролировали также работу ОРТа и ОЗЕ. 13 июня 1920 г. американская еврейская благотворительная организация Джойнт (тогдашнее название — Joint Distribution Committee of American Funds for the Relief of Jewish War Sufferers) заключила договор с Еврейским отделом Наркомнаца об оказании помощи погромленным российским евреям. Деньги, медикаменты, продовольствие, одежда, инструменты для ремесленников передавались в распоряжение специально созданного для этой цели Еврейского общественного комитета (Евобщестком, или на идише — Идгезком), куда помимо уполномоченных советских учреждений были приглашены, по настоянию американских евреев, представители ОЗЕ, ЕКОПО, ОРТа. Считаться с этими организациями приходилось и потому, что они уже имели собственную разветвленную сеть учреждений социальной помощи по всей стране. Так как к концу 1920 г. безоговорочная поддержка Джойнтом еврейских общественных организаций ослабла, еврейские коммунисты воспользовались этим и стали постепенно оттеснять общественность от дела помощи. В начале декабря Евотдел Наркомнаца приказал евподотделам на местах «всячески избегать положения, при котором удовлетворение потребностей еврейского населения возлагается на частные (курсив мой. — М.Б.) общественные организации». Этим организациям разрешалось существовать, «пока вопрос о них не пересмотрен в общероссийском масштабе»; но над их деятельностью предлагалось немедленно установить строгий контроль. Евотдел также обратился в Наркомпрос, Наркомздрав, НКВД и Госиздат с предложением не регистрировать вновь никаких еврейских организаций и учреждений и не печатать никаких еврейских изданий без его предварительной санкции. Усиление давления Евотдела вынудило некоммунистические организации выйти из Евобщесткома в январе 1921 г. Ответной мерой властей был роспуск ЕКОПО, а затем (в начале 1922 г.) и ОЗЕ. ОРТ был в значительной мере советизирован, а сфера его деятельности сужена. С прекращением существования в Петрограде главных организаций помощи ослабла и роль города в общественной жизни российского еврейства.