Внутреннее убранство собора уникально, так же как и его внешний вид. Три больших нефа разделены стрельчатой аркадой с пучками круглых колонн, сгруппированных вокруг центрального опорного столба. Колонны поддерживают поперечные арки стрельчатого свода, от них веером поднимаются вверх нервюры, пересекаясь в форме звезды. Замковые камни украшены каменной резьбой и позолочены. Верх собора по периметру нефа занят трифорием с галереей стрельчатых арок, над которым проходит ряд четырехчастных витражных окон с розеткой наверху. В алтарной части установлены резные деревянные хоры с епископской кафедрой. На алтарной преграде, отделяющей хоры от нефа (что довольно редко встречается в католических соборах), вырезаны статуи 15 королей Англии из норманнских династий – от Вильгельма I до Генриха VI.
В интерьере дома каноников всегда много света благодаря большим окнам в стрельчатых нишах в восьми стенах зала. Свет падает на круглый потолок с красочным орнаментом, создавая теплую атмосферу.
Собор окружает большой живописный сад, создающий яркое пятно в городском пейзаже. Романтическую атмосферу в саду создают руины заброшенного романского аббатства св. Марии 11 в., от которого осталась галерея стрельчатых четырехлепестковых арок.
С собором соседствует древнейшее учебное заведение города, действующее и поныне – колледж св. Вильгельма, основанный в 15 в. и имеющий богатую историю. Деятельность колледжа связана с именами двух известных личностей английской истории – Гаем Фоксом и Карлом II.
Гай Фокс, учившийся здесь, был организатором едва не удавшегося Порохового заговора против короля Якова I, который можно назвать одним из первых террористических актов в истории. Это произошло в 1605 г., когда под зданием парламента было заложено несколько бочек с порохом, они должны были взорваться во время произнесения там тронной речи короля. Заговор был раскрыт благодаря измене одного из соратников Фокса, сам Фокс был казнен.
Карл II после восстановления на английском престоле династии Стюартов стал расправляться с заговорщиками, причастными к казни его отца. Те собрали войско и укрылись в Шотландии. Тогда король со своими войсками проследовал в Шотландию, где разбил противника. Его путь лежал через Йорк, здесь он заезжал в колледж св. Вильгельма и встречался с его учениками.
Живописное здание колледжа под высокой двухскатной черепичной крышей дает представление о средневековой застройке не только Йорка, но и многих других городов Англии. Это двухэтажное здание, первый этаж которого каменный, а второй фахверковый. На первом этаже обычно помещались хозяйственные службы, а второй был жилым. Второй этаж уступом нависает над первым, поэтому узкая средневековая улочка, застроенная такими домами, снизу становилась шире, давая возможность свободного прохода. Каркас фахверкового этажа составлен из вертикальных черных балок, каменные стены между которыми побелены. Фасад здания оживляют многочисленные деревянные эркеры, придавая ему особую живописность.
С небольшой белокаменной трехнефной церковью св. Троицы, построенной в 12 в. связана зловещая история о привидениях. Во время Реформации Генриха VIII, когда он насаждал в Англии протестантизм, лично разъезжая по городам, два католических священника этой церкви отказались приносить королю присягу как главе церкви. Генрих VIII велел их казнить, но они спрятались в доме соседской девушки. Несмотря на это священников разыскали и казнили, а девушку, как их сообщницу, заживо погребли под могильной плитой небольшого кладбища, расположенного во дворе церкви. С тех пор в алтаре появляется ее привидение.
Внутри церкви можно проследить одну интересную традицию, характерную для небольших английских церквей. Богатые прихожане покупали молельные места в церкви для себя, которые по наследству передавались детям. Эти места были закреплены за конкретными семьями, поэтому скамьи окружались высокими деревянными оградами.