В начале мая он созвал в Париже собор епархии Санс, чтобы вынести решение о судьбе тамплиеров этой области, чьи епархиальные комиссии завершили слушания. Папа фактически указал, что индивидуальная судьба тамплиеров может быть решена провинциальными соборами, в то время как судьба ордена зависит от папской комиссии. Филипп де Мариньи намеренно играл на этой двойной юрисдикции: тамплиеры его провинции подтвердили свои признания перед епископальными комиссиями, и поэтому должны были быть помилованы. Но вскоре после этого они вызвались защищать орден перед папской комиссией. Архиепископ посчитал, что они рецидивисты, вернувшиеся к своим заблуждениям, и поэтому их следует казнить. Узнав о том, что собор в Сансе готовится вынести приговор, представители ордена 10 мая составили обращение к папской комиссии с просьбой вмешаться. Президент этой комиссии, архиепископ Нарбоннский Жиль Айселин, оказался в очень щекотливой ситуации. Относительно умеренный, в прошлом проявлявший определенную независимость в королевском Совете, он в то же время был человеком, очень близким к Филиппу Красивому, и не хотел рисковать, вступая с королем в противоборство. Король поддержал инициативу архиепископа Санса, если не приказал ему сам, потому что его раздражали задержки в этом деле: Папа только что отложил на год созыв Вьеннского собора, который должен был открыться только в октябре 1311 года. Жиль Айселин, понимая несправедливость процедуры, предпочел увернуться и уподобился Пилата: он отказался рассматривать просьбу об апелляции, заявив, что у него нет времени, "сказав, что он должен праздновать или слушать мессу".
На следующий день, 11 мая, он отсутствовал на заседании комиссии, которая возобновила слушания как ни в чем не бывало. Тогда стало известно, что 54 тамплиера собираются казнить. Комиссия послала двух человек, чтобы попросить архиепископа отложить казнь. Он отказался их выслушать, и 12 мая 54 тамплиера были заживо сожжены в поле у ворот Сент-Антуан. Впоследствии были сожжены еще четыре, а затем девять в Санлисе. Продолжатель Гийома де Нанжи пишет, что "никто из них — исключений не было — не признал ни одного из приписываемых им преступлений, напротив, они упорствовали в своих отрицаниях, всегда говоря, что их предают смерти без причины и несправедливо, что многие могли наблюдать не без большого восхищения и безмерного удивления".
Эффект от этой казни был мгновенным. Оборона ордена рухнула. Папская комиссия возобновила свою работу 13-го числа, но свидетели были в ужасе. Первым заговорил пятидесятилетний брат Аймери де Вилье-ле-Дюк, охваченный паникой: "Вчера, — сказал он, — я видел, как пятьдесят четыре моих брата везли в телегах, чтобы сжечь заживо, потому что они не признались в этих преступлениях; я слышал, что их сожгли. Ах, если бы решили сжечь меня, я слишком боюсь смерти, я не вынесу этого! Я бы признался под присягой, перед вами и перед кем-либо еще, во всех преступлениях, вменяемых ордену; я бы признался, что убил Бога, если бы меня спросили! Ах, я прошу вас, умоляю вас не раскрывать ничего из этого людям короля. Я слишком боюсь, что если они узнают об этом, то предадут меня тем же пыткам, что и моих братьев…".
Главный защитник тамплиеров, Пьер де Болонь, сбежал и скрылся. Его местонахождение было неизвестно. 19 мая 44 брата явились в комиссию и отказались от защиты ордена: "Да, мы предлагали себя перед вами для защиты нашего ордена. Но сейчас мы намерены выйти из игры. Мы уходим. Мы отказываемся от защиты ордена". В этих условиях комиссия могла только прекратить свою работу. 30 мая она приостановила производство по делу.
Оно возобновилось 3 ноября, но ситуация была уже другой: присутствовали только три члена комиссии. Айселин, назначенный новым хранителем печати, был слишком занят своими новыми обязанностями; епископ Байе уехал в Авиньон; Жан де Монтлор сказался больным; что касается епископа Лиможа, то ему дали понять, что "по определенным причинам не следует продвигаться вперед в этом деле до проведения большого совета короля". Новая попытка состоялась 17 декабря. На этот раз пропали защитники тамплиеров: Пьер де Болонь был в бегах, Рено де Прованс исчез; двое других, обескураженные, назвав себя "неграмотными мирянами", отказались от своих обязанностей. С тех пор комиссия не имела особого значения. Однако она продолжал слушания до начала июня 1311 года и заслушала 215 свидетелей, 198 из которых признали свою вину, и каждый из них говорил в свое оправдание, что он согрешил "из-за своей простоты", "по глупости и простодушию", из-за "плохого совета". В результате поисков в Тампле была найдена "голова", на самом деле реликварий, содержащий "кости головы маленькой женщины про которые некоторые говорили, что это голова одной из одиннадцати тысяч девственниц".