Являясь завполитотделом XI армии, товарищ Киров занимался политическим воспитанием и военных моряков Астрахано-Каспийской флотилии. В мае 1919 года по его указанию была создана школа политработников XI армии и флота. Приказом по армии и флоту за подписью Кирова было внесено изменение в руководство политического отдела флотилии. Сергей Миронович неоднократно выступал с общеполитическими докладами перед моряками. 18 июля на митинге моряков товарищ Киров рассказал о положении на других фронтах и призвал моряков к упорной борьбе с Деникиным. «Колчак, сунувшись к Волге, в этом наступлении нашел себе гибель. Та же участь ждет и Деникина».
Сергей Миронович воспитывал партийную организацию в духе непримиримой борьбы с врагами. Выступая на партийных собраниях, конференциях, в беседах, он учил коммунистов быть бдительными, не поддаваться на провокации. Следуя совету своего руководителя, моряки правильно разбирались в обстановке. В мае коммунисты флотилии и сочувствующие, узнав о распускаемых контрреволюционными элементами панических слухах, будто погибла вся флотилия, постановили:
«Мы, моряки, заявляем всем тем гадам, которые позволяют сеять сомнение в мощности Астрахано-Каспийской флотилии с целью произвести панику и сыграть наруку контрреволюции:
Мы, моряки, вышли не на прогулку, а на дело и ни перед чем не остановимся, дабы добиться цели дать пролетариату РСФСР жизнь. Это мы сделаем, хотя бы из нашей семьи пришлось погибнуть половине. Мы ни на минуту не сомневаемся в нашей победе, и когда эта победа стала близка, наши враги, чувствуя свою гибель, напрягают все усилия, чтобы оттянуть ее».
Когда Иуда-Троцкий отдал подлый приказ — сдать Астрахань, якобы, для выравнивания фронта, Сергей Миронович обратился с протестом к Ленину. Владимир Ильич поддержал Кирова, приказав защищать Астрахань до конца.
«Пока в Астраханском крае есть хоть один коммунист, устье р. Волги было, есть и будет советским», — заявил Сергей Миронович на партийной конференции. В резолюции военморы вооруженного парохода «Воля» прямо заявляли:
«Мы будем непоколебимо стоять на страже революции, отражая натиск золотопогонной своры на красную Астрахань».
Моряки десантного отряда не менее решительно говорили:
«Не сложим оружия и, не щадя своей жизни, будем уничтожать фронт за фронтом, пока не добьемся торжества социальной революции. Да здравствует Ленин!»
Моряки шли в бой, не щадя жизни. Их политическое воспитание велось непрерывно, и не только в партийной школе, но и в повседневной жизни. Оно проводилось и путем социалистических субботников, которые пользовались все большим успехом. На четвертом субботнике в Астрахани от моряков было 615 человек, на пятом — 836, на шестом — 1038, из них 142 беспартийных.
Еще в сентябре, в разгар острой борьбы на подступах к Астрахани, Сергей Миронович поставил перед защитниками города вопрос о том, что лучшие из них должны тесней сплотиться вокруг партии. Партийная организация флотилии, насчитывавшая летом 638 человек, стала быстро расти. На всех крупных кораблях работали партийные коллективы. На дивизионе сторожевых судов в течение одного месяца было подано 34 заявления, на миноносце «Деятельный» — 18, на «Спартаковце» — 10, в службе связи — 51. В десантных отрядах заявления подавались сотнями. Партийная организация пополнялась людьми, в боях доказавшими свою преданность делу партии Ленина — Сталина. В ноябре 1919 года части X и XI армий перешли в наступление по всему фронту. В январе XI армия с боем занимает Царицын и продвигается дальше на Северный Кавказ. Зимой 1920 года товарищ Киров готовит нефтеналивной флот к наступающей навигации для перевозки нефти из Гурьева. В это время он писал Ленину, что с началом навигации немедленно приступит к вывозу нефти и что для обеспечения безопасности нефтеперевозок «все военные суда и пловучие батареи будут готовы к началу навигации».
Весной 1920 года после занятия Баку Сергей Миронович немедленно организовал отправку жидкого топлива на север. Задание Ленина было выполнено. После дипломатической работы в Грузии Сергей Миронович в 1921 году вновь вернулся в Баку. Здесь он опять устанавливает прочную связь с партийной организацией Каспийского флота. На третьей партийной конференции флота товарищ Киров выступил с докладом о работе ЦК Азербайджанской компартии, в котором он дал такую характеристику революционным морякам:
«…Из всего прошлого флота мы можем сделать выводы, что в лице Красного флота мы имеем испытанных кормчих и зорких сигнальщиков, которые сумели дать твердые колонны революционеров».