«Брат мой Михаил Васильевич Фрунзе, студент политехнического института, экономического отделения, 22 сентября этого года был, несмотря на его невиновность в предъявленном ему преступлении, вторично приговорен к смертной казни военным судом в городе Владимире. Теряя всякую надежду на его спасение, я решила обратиться к Вам, не откажите в Вашем ходатайстве перед главнокомандующим войсками Плеве о возможности смягчения его участи. Умоляю Вас дать Плеве от Совета профессоров возможно хорошую аттестацию брата, как студента. Это будет иметь значение при рассмотрении дела главнокомандующим, когда оно поступит к докладу. Не откажите ради бога в своем участии…»
Либеральная профессура того времени, едва ли не откровенно находившаяся в оппозиции официальной государственной власти, в России пользовалась огромным авторитетом. 29 сентября 1910 года профессор М.М. Ковалевский доложил содержание письма студентки Людмилы Фрунзе. Его коллеги решили поддержать ходатайство своего товарища и направить соответствующее письмо за восемью подписями командующему войсками Московского военного округа «об оказании милосердия и даровании жизни Михаилу Фрунзе». Аналогичное письмо было направлено в адрес премьер-министра П.А. Столыпина.
Людмила Фрунзе проявила высокую активность ради спасения брата. Заручившись письмами некоторых влиятельных людей, она лично записалась на прием к Плеве. Ее несчастный вид тронул каменное сердце высокого чиновника. Командующий Московским военным округом, пользуясь своим правом миловать, заменил М.В. Фрунзе смертную казнь шестью годами каторжных работ. После этого с осужденного сняли тяжелые ножные и ручные кандалы и отвели в общую камеру.
До лета 1912 года Михаил Васильевич сидел в знаменитом Владимирском каторжном централе. Владимирский централ представлял собой целый городок с большими мрачными корпусами, мастерскими, примитивной ткацкой фабрикой. В централе сидели и работали более тысячи человек. Обстановка заключения была очень жесткая.
Кроме того, длительное пребывание в камере смертников отрицательно сказалось на здоровье заключенного — он пережил ряд нервных стрессов, заболел язвой желудка. Этой болезнью он страдал всю свою последующую жизнь.
Павел Гусев, который вместе с М.В. Фрунзе проходил по делу подготовки покушения на должностное лицо, был также помилован. Но ему повезло значительно меньше. Нервная система не выдержала, и П.Д. Гусев умер в тюрьме 1915 году.
Находясь в тюрьме, М.В. Фрунзе очень много читал. Книга стала его непременным спутником. Пользуясь нахождением среди политзаключенных образованных людей, он вел с ними различные беседы, даже учил иностранные языки. Но системным образованием все это назвать было нельзя, хотя позже период заключения биографы М.В. Фрунзе будут называть тюремными «университетами».
В июне 1912 года М.В. Фрунзе был переведен в николаевскую тюрьму Иркутской губернии. Вскоре заключение в тюрьме было заменено ссылкой, во время которой М.В. Фрунзе не прекращал свою революционную деятельность.
Далее следует побег М.В. Фрунзе из ссылки. Об этом в книге «М.В. Фрунзе. Военная и политическая деятельность», изданной в 1984 году, пишется:
«За создание в селе Манзурке политической организации ссыльных, за чтение и распространение нелегальной литературы и революционную пропаганду М.В. Фрунзе и еще 13 ссыльных 31 июля 1915 г. были арестованы и направлены этапным порядком в Иркутскую губернскую тюрьму. На последней остановке, в селе Оек М.В. Фрунзе удалось бежать». Так Михаил Васильевич обрел свободу.
М.В. Фрунзе сумел добраться до Иркутска, а затем — до Читы. Он раздобыл документы на имя дворянина Владимира Григорьевича Василенко. Из Иркутска выехал в Читу и устроился разъездным агентом Забайкальского переселенческого управления. Читинский период жизни Фрунзе интересен двумя событиями. Главное — в Чите он познакомился с Софьей Алексеевной Поповой, ставшей его женой. Кроме того, там он начал серьезно интересоваться событиями, происходившими на фронтах Первой мировой войны, и начал писать статьи в газете «Забайкальское обозрение».