Вторая конфликтная ситуация возникла в 1047 году, когда Свейн Эстридсен, король Дании, племянник Годвине, попросил у английского короля помощи в войне против покушавшегося на его королевство Магнуса Норвежского134. Годвине посоветовал королю отправить Свейну 50 кораблей, но Леофрик, эрл Мерсии, и другие советники выступили против, так что король в итоге решил отказать в этой просьбе. Вообще говоря, в интересах Эдуарда было отвлечь внимание Магнуса от планов вторжения в Англию; но он, видимо, боялся мести со стороны норвежского короля, если Свейн Эстридсен, несмотря на оказанную помощь, потерпит поражение. Свейн и правда вскоре проиграл Магнусу и лишился своего королевства, — возможно, именно из-за того, что король Эдуард отказался ему помочь. Годвине было неприятно, что он не только допустил изгнание сына, но также не сумел помочь племяннику; в результате отношения между ним и королем стали еще более прохладными. Не исключено, что эрл решил поддержать племянника собственными силами, поскольку Свейн, сын Годвине, в 1048 году отправился в Данию, быть может, приведя с собой какое-то количество кораблей. Известно, по крайней мере, что в 1049 году он вернулся в Англию с семью или восемью кораблями; но если отец действительно посылал его в Данию с флотилией на помощь двоюродному брату, датчан не обрадовала такая поддержка.
Тем временем второй сын Годвине, эрл Гарольд, был поглощен заботами о безопасности своей провинции; вероятно, он находился среди капитанов, предводительствовавших в 1048 году английским флотом, вышедшим из Сандуича, чтобы дать отпор пиратам из германских земель. Хотя в этом случае его имя не упоминается, известно, что он командовал кораблем в королевской флотилии на следующий год. В 1048 году германские пираты беспрепятственно разорили Эссекс, захватив добычу и пленников, так что, скорее всего, эрла в это время не было на месте; вероятно, он находился при флоте.
Балдуин V, граф Фландрии, постоянно привечал у себя пиратов и английских изгнанников и предоставлял им укомплектованные командами корабли, на которых они грабили английские побережья; его действия со временем стали все больше досаждать королю Эдуарду. В 1048 году король наконец почувствовал себя свободным от скандинавской угрозы (Магнус внезапно умер в 1047-м, а его преемник Харальд Суровый немедленно начал войну с вернувшимся на датский трон Свейном Эстридсеном) и решил, что пора заняться Балдуином. Возможность для этого представилась в 1049 году, когда император Священной Римской империи Генрих III попросил помощи английского флота в войне с Балдуином, поднявшим против него бунт. Эдуард, как было условлено, привел корабли в Сандуич (в том числе один или несколько кораблей под командованием Гарольда), и они оставались там, пока Балдуин не подчинился императору135.
Во время этой кампании блудный сын Годвине Свейн вернулся из Дании, где он определенно успел всем надоесть, поскольку в Англосаксонской хронике обтекаемо сказано, что он «разрушил себя у данов»136. Теперь он захотел примириться с королем Эдуардом, рассчитывая, что тот вернет ему земли и статус эрла, но такому решению воспротивились его брат Гарольд и двоюродный брат Беорн. Они отказались передавать земли и права, дарованные им королем, в том числе на территориях, которыми прежде управлял Свейн. Здесь мы впервые видим, что Гарольд действует независимо от отца. Годвине, судя по всему, хотел, чтобы его старший сын вернулся и восстановил свое положение в королевстве, но Гарольд не собирался поступаться своими интересами в угоду желаниям отца и брата. Когда между членами семейства Годвине вспыхнул раздор, король Эдуард счел себя в полном праве отказать Свейну. Он дал ему четыре дня на то, чтобы покинуть Англию, и Свейн, не видя другого выхода, отправился в Бошем, где стояли его корабли.
Тем временем Эдуарду сообщили, что корабли Балдуина вышли в море, и он повелел Годвине двигаться с флотилией вдоль побережья на запад, чтобы перекрыть путь через Ла-Манш. Годвине с сорока двумя кораблями, одним из которых командовал эрл Беорн и двумя другими — Гарольд и его младший брат Тости, переместился из Сандуича в Певенси, и там они застряли из-за непогоды. Вскоре появился Свейн — возможно, его корабли не могли покинуть Бошем из-за шторма (как и флотилия Годвине оказалась заперта в Певенси), но скорее всего, он не хотел покидать Англию, не попытавшись еще раз вернуть себе прежнее положение. Свейн уговорил своего двоюродного брата Беорна изменить решение и выступить ходатаем за него перед королем. Они вместе поехали в Бошем, намереваясь, вероятно, отправиться оттуда морем в Сандуич к королю Эдуарду. Однако как только они оказались в Бошеме, Свейн связал Беорна (с которым было лишь трое воинов), силой затащил его на свой корабль и вышел в море. По-видимому, изначально он собирался использовать Беорна в качестве заложника при дальнейших переговорах, но по непонятным причинам убил своего беззащитного пленника в Дартмуте и закопал его тело в первом попавшемся месте137. Скорее всего, Беорн отказался заступаться за Свейна или возвращать ему его земли — что не удивительно после подобного обращения.