В результате Т.Д. Лысенко 17 апреля 1948 года направил Сталину и А.А. Жданову письмо, в котором говорил, что он готов отказаться от президентства в ВАСХНИЛ и просил предоставить ему условия для продолжения работы по развитию мичуринской биологии для колхозно-совхозной практики. Министру сельского хозяйства СССР И.А. Бенедиктову он направил письмо с просьбой об освобождении его от поста президента ВАСХНИЛ. Однако И.В. Сталин вовсе не собирался передавать руководство сельским хозяйством в руки создателей тетраплоидных гречих и “специалистов мирового уровня по дрозофиле”.
31 мая 1948 года состоялось заседание Политбюро, на котором обсуждалось апрельское выступление Юрия Жданова. Сталин возмущенно заявил, что Жданов-младший поставил своей целью разгромить Лысенко, забыв, что на нём сегодня держится сельское хозяйство. 15 июля 1948 года Политбюро приняло постановление: “В связи с неправильным, не отражающим позиции ЦК ВКП(б) докладом Ю.А. Жданова по вопросам биологической науки, принять предложение министерства сельского хозяйства СССР, министерства совхозов СССР и академии сельскохозяйственных наук имени Ленина об обсуждении на июльской сессии академии сельскохозяйственных наук доклада академика Т.Д. Лысенко на тему “О положении в советской биологической науке”, имея в виду опубликование этого доклада в печати”.
Ю. Жданов направил в адрес Сталина упомянутое выше письмо, напечатанное в газете “Правда” 7 августа 1948 года. Хотя формально это письмо могло считаться признанием Ждановым-младшим ошибочности своей позиции, фактически оно было двусмысленным и лукавым. Ю. Жданов писал, что он излагал свою личную точку зрения, а её восприняли как точку зрения ЦК. Разумеется, он хорошо знал, что именно так её и воспримут слушатели. Проявил он лукавство и в воспоминаниях 1993 года, где утверждал, что “сказал о практических достижениях современных генетиков” - каких? тетраплоидных формах гречихи, которые он выращивал на своём дачном участке? Кроме того, он писал в этой статье, что “не уступил в самом главном; не согласился, что морганисты-менделисты люди купленные”. Эту оценку (“морганисты - купленные люди”) дал И.В. Сталин в разговоре с Ю. Ждановым 18 октября 1947 г.; она основывалась на том, что ряд советских генетиков (Левит, Агол, Добжанский, Карпеченко, Жебрак) получали гранты и стипендии от западных фондов, что было тогда (как и сейчас) формой подкупа. Ю. Жданов мог, конечно, и не разделять эту оценку, но вряд ли он посмел в 1948 году перечить Сталину, “не согласиться в главном” - как он это зачем-то пытался представить в статье 1993 года.
Фактически Ю. Жданов остался при своих, точнее, внушённых ему генетиками- вейсманистами, взглядах и после августовской сессии ВАСХНИЛ 1948 года занялся “подковёрной” борьбой с мичуринской биологией. Например, когда в 1951 году в изданиях Академии наук СССР появились статьи Н.В. Турбина против Т.Д. Лысенко, автор вскоре был назначен директором Института биологии АН Белорусской ССР, что в те времена могло происходить только с санкции отдела науки ЦК, то есть с участием Ю. Жданова. Затем снова пошел поток писем в ЦК КПСС с критикой Т.Д. Лысенко.
Дальнейшее развитие событий следующим образом описывает Ю. Жданов. “Где-то в июне <1952 года> мне позвонил заведующий сельхозотделом ЦК Алексей Иванович Козлов и просил срочно зайти. Я прибежал к нему в другой корпус и застал крайне возбуждённым. Он сразу выпалил: ″Я только что от товарища Маленкова. Он передал указания товарища Сталина: ликвидировать монополию Лысенко в биологической науке; создать коллегиальный президиум ВАСХНИЛ; ввести в состав президиума противников Лысенко, в первую очередь Цицина и Жебрака; создать комиссию ЦК по подготовке предложений”.
Что можно на это сказать? “Подковёрная” борьба Ю. Жданова сработала, поток писем ввел в заблуждение И.В. Сталина и в нарушение устава ВАСХНИЛ в состав президиума был введен А.Р. Жебрак, который не являлся не только академиком ВАСХНИЛ, но даже членом- корреспондентом этой академии.
Далее Ю.А. Жданов так описывает события тех лет. “Комиссия была создана. В неё Маленков, помимо Козлова и меня, ввёл президента Академии наук СССР А.Н. Несмеянова, министра сельского хозяйства И.А. Бенедиктова и ...Т.Д. Лысенко. Комиссия собиралась дважды, но ни к какому решению не пришла из-за обструктивной позиции, занятой Лысенко. Страсти накалялись... Но всё было напрасно. А затем началась подготовка к XIX съезду партии, сам съезд. Дело спустили на тормозах”.
Таким образом, аргументация Т.Д. Лысенко и поддержка министра сельского хозяйства И.А. Бенедиктова не позволили в тот раз Ю. Жданову с вейсманистами учинить разгром Т.Д. Лысенко.
В марте 1953 года после смерти И.В. Сталина три секретаря ЦК - Суслов, Поспелов и Шаталин - предложили Ю. Жданову покинуть работу в аппарате ЦК и вернуться в Московский университет. Однако через неделю решение изменили и предложили ему на два года уехать из Москвы для приобретения опыта личной партийной работы, то есть практически, как пишет сам Ю. Жданов, это была депортация. Ему были предложены на выбор челябинский или ростовский отдел науки обкомов партии, и он согласился на Ростов.
На партийной работе в отделе науки Ростовского обкома КПСС Ю.А. Жданов не задержался. Как номенклатурный работник, он через некоторое время перешёл на административную работу в вуз. За поддержку формальных генетиков Ю. Жданов получал определённые преференции в кругах “либеральной интеллигенции”. В 1957 году он защитил вторую кандидатскую диссертацию и в том же году, не будучи доктором наук, в возрасте 38 лет, был назначен ректором Ростовского государственного университета - одного из крупнейших вузов России.
Работая в Ростове, Ю. Жданов по-прежнему симпатизировал “формальным генетикам”. Интересовался творчеством Н.И. Вавилова. В своей статье Ю. Жданов писал: “Было совершенно естественным, что, приехав на работу в Ростов, я сразу же стал знакомиться с научным наследием Н.И. Вавилова” (стр. 90).
Во-первых, нет ничего “совершенно естественного” в том, что химик по специальности и партаппаратчик по основной работе “приехав на работу в Ростов, сразу же стал знакомиться с научным наследием Н.И. Вавилова”. Во-вторых, если вспомнить деятельность Жданова- старшего, боровшегося в 1946-1948 гг. с формализмом в советском искусстве, где в то время тоже распространялись бесплодные и декадентские извращения - своего рода аналоги “тетраплоидных форм гречихи” и изуродованных колхицином растений - если сравнить полезную деятельность Жданова-старшего и обструкционизм Жданова-младшего, то приходишь к выводу, что в данном случае природа “отдохнула на детях”.
Ю. Жданов фактически солидаризировался с той частью интеллигенции, которая требует государственного финансирования своих “тетраплоидных гречих” и “чёрных квадратов”, но поднимает возмущённый крик, когда её спрашивают: “а какая, собственно, польза народу от ваших творческих изысканий?” В упомянутой статье он писал: “Перед государством всегда стоят практические задачи: накормить, одеть, обуть, обустроить людей. Отсюда естественное желание получить помощь от науки в решении этих жгучих проблем. Но такое желание не должно оправдывать вторжение во внутреннюю логику, её теоретические искания и выводы. Воздействие на науку извне не продуктивно. Напротив, социальный успех возможен лишь тогда, когда в своих действиях государство всемерно опирается на данные рекомендации науки”.
Другими словами, государство должно (?!) выделять “науке” финансирование, но не смеет (?!) спрашивать, как потрачены эти средства и что сделано полезного для страны.
В завершающих разделах рассматриваемой статьи Ю. Жданов сетовал: “Отгремели ли битвы в биологической науке? Думаю, что нет. Не случайно в последние годы вновь замелькало имя Лысенко в зарубежных журналах во вполне благоприятном тоне”. Как видно, ему бы хотелось, чтобы клевета на Т.Д. Лысенко продолжалась по-прежнему, как это происходило в прежнее время, при его поддержке.
А в зарубежных научных журналах в настоящее время действительно появилось немало статей (см. напр. Лю Йоншень “Вклад Лысенко в науку” и ссылки там), в которых даётся высокая оценка работ Т.Д. Лысенко - и его практических достижений, и теоретических концепций, которые он отстаивал в дискуссиях с “формальными генетиками”: о влиянии внешней среды на наследственность, о внехромосомной передаче наследственных признаков, о вегетативной гибридизации и так далее. Это подтверждает пророческие слова Т.Д. Лысенко, написанные им в 1973 году, за 3 года до смерти: “Нужно иметь в виду, что всему миру известные ложь и клевета, возведенные на разработанную нами глубокую концепцию мичуринского направления, будут раньше или позже вскрыты и сняты”.