Что касается мощей святых, то этот вопрос менее исследован и менее известен широкой публике. Поэтому напомним, что наиболее раннее свидетельство благоговейного отношения христиан к мощам — это 156 год — повествование о костях епископа Поликарпа Смирнского. Оно описано в «Окружном послании Смирнской церкви о мученичестве Поликарпа», и цитируется также Евсевием Кесарийским в «Церковной истории». В «Окружном Послании Смирнской Церкви» о мученичестве святого Поликарпа (II век) даются свидетельства о почитании мучеников «как учеников и подражателей Господа» и благоговейном отношении к их останкам. Причём ежегодно праздновались дни кончины мучеников как «дни рождения их для будущей жизни». Обычай выкапывать мощи святых из земли и переносить их в приходские церкви городов возник не позднее начала второй половины IV века. Наиболее ранний описанный случай выкапывания и перенесения мощей - 356 год, когда император Констанций перенёс в Константинополь и положил в храме апостолов мощи апостола Тимофея; в 357 год тот же император перенёс в Константинополь и положил в храме апостолов мощи апостолов Андрея и Луки.
Первое соборное решение в отношении почитания мощей вынес Карфагенский собор (393—419 гг). В века гонений, когда мученичество было для христиан свидетельством их убеждений в истинности Воскресения Христа из мёртвых и произошедшей после этого победы над смертью, верующие употребляли все средства для того, чтобы заполучить в своё обладание тела мучеников, а места их погребения становились святилищами, где отправлялось христианское богослужение. Здесь совершалось главное церковное таинство – святая Евхаристия, а также происходили агапы – братские трапезы, которые в древней Церкви воспринимались как своего рода продолжение литургического служения. Характерно, что в период иконоборчества преследованию и осуждению подвергалось не только почитание святых икон, но также и мощей святых. Такую политику проводил, в частности, император-иконоборец Константин V Копроним.
С победой Церкви над иконоборчеством связано и окончательное утверждение почитания мощей святых, по поводу чего имеется полнейшее согласие всех наиболее авторитетных Отцов Церкви. Тот же Седьмой вселенский собор постановил, что епископ, который освятит храм без мощей, подлежит извержению из сана (7-е правило). Также Собор сделал распоряжение положить мощи во все существующие храмы, в которых их ранее не было: «Да будет совершено в них положение мощей с обычною молитвою». Ныне в Православной Церкви, помимо помещения под Престолом и в специальные раки и ковчежцы (как правило, сделанные из драгоценных металлов и богато украшенные) частицы мощей святых в обязательном порядке зашиваются в специальный большой плат - антиминс, на котором служится Литургия, для чего он раскладывается на Престоле. На антиминсе имеется также подпись епископа, что означает, что данный епископ позволяет подчиненному ему священнику служить Литургию. Без антиминса священник на это не имеет права. Ни один епископ не распишется на антиминсе, если в него предварительно не зашита частица мощей какого-либо святого, чье молитвенное почитание соборно утверждено Церковью. У римокатоликов мощи также полагаются под престол (в латинском обряде он называется просто алтарём), как это имеет место и в Бари, при освящении храма. В латинском обряде не предусматривается использование антиминса для Евхаристии, в византийском (то есть греко-католическом) обряде антиминс используется, так же, как у православных.