Всплеск уличных нападений на армян и убийств приходится на август-сентябрь 1989 г. Люди продолжали уезжать, и к январю 1990 года в Баку, по приблизительным данным, оставалось уже около 30-35 тысяч армян.
К 12-13 января 1990 года армянские погромы в Баку приобрели организованный характер. 13 января после 17 часов толпа из примерно 50 тысяч человек, вышедшая с митинга на площади Ленина, разделившись на группы, стала методично, дом за домом, "очищать" город от армян.
Погромы продолжались до 20 января, когда в город были введены войска. С 13 по 20 января город был полностью "освобождён" от "армянских элементов", за исключением нескольких сотен армян из числа смешанных семей. Их позже "выуживали" для обмена на азербайджанских военнопленных.
В дни погромов в Баку вооружённые отряды НФА и азербайджанской милиции совершили вооружённые нападения уже с применением бронетехники на армянские сёла северной части Нагорного Карабаха и Шаумянского района.
В 1992 году против армян Нагорного Карабаха была начата полномасштабная война. Она сопровождалась методическими бомбардировками армянских населённых пунктов с воздуха, обстрелами из артиллерийских установок массового поражения и другими военными преступлениями, расcчитанными на уничтожение армянской национальной группы как таковой."
Из азербайджанских источников:
"В феврале 1988 года армянское население Нагорного Карабаха потребовало отделения автономной области от Азербайджанской республики и присоединения её к Армянской ССР. Принимавшие решения депутаты областного Совета НКАО не приехали в Баку, не выступили в Верховном Совете республики со своими предложениями. Слишком велика была их вера в ультиматум, в лживый слух, пущенный ловкими политиканами, о том, что Москва дала согласие и присоединение к Армении — дело дней.
От Агдама до Степанакерта рукой подать. Выезжаешь из Агдама — и сразу НКАО: Аскеран, населённый преимущественно армянами, затем — азербайджанское село Ходжалы, и за ним — Степанакерт. Всего за два года дорога добрососедства превратилась в дорогу страданий и смерти. Здесь, в результате столкновения, в феврале 1988 года были убиты из охотничьих ружей два молодых азербайджанца — первые жертвы трагедии.
Первые беженцы появились в Азербайджане весной 1988 года. Их называли "временно покинувшие места постоянного проживания". Затем число беженцев из Армении превысило 160 тысяч. Люди хватали деньги, документы. Зачастую уходили пешком, без тёплой одежды, через заснеженные перевалы.
Политиканы опасались, что живущие компактно азербайджанцы в ответ на территориальные притязания к Азербайджану могут потребовать и для себя автономии на территории Армении. Вот и врывались в азербайджанские сёла боевики... Сегодня там нет азербайджанцев.
Появление в республике беженцев осложнило обстановку в Баку. У Дома правительства регулярно собирались многотысячные митинги. А в ноябре-декабре 1988 года митинг длился без перерыва 18 дней.
Решения, принятые в различное время Политбюро ЦК КПСС, Президиумом Верховного Совета СССР и сессией Верховного Совета СССР, подтвердили принадлежность автономной области Азербайджану.
Армянские националисты, не добившись своих целей, начали необъявленную войну против Азербайджана. Обстрелам подвергались сёла пограничных районов: Кубатлинского, Зангеланского, Лачинского, Келбаджарского, Казахского. Жители этих сёл вынуждены были покинуть свои дома и влиться в поток беженцев. Организованные банды боевиков, вооружённые автоматическим оружием, начали регулярные нападения на территорию Азербайджана. Настоящий десант высаживался с наёмных вертолётов в расположенные в глубине территории республики Ханларский и Шаумянский районы. Отрезанной от остального Азербайджана оказалась Нахичеванская АССР.
В начале января многотысячная толпа, собравшаяся у здания ЦК Компартии Азербайджана, потребовала отставки руководства республики, не сумевшего защитить целостность республики. По призыву НФА молодые люди поставили на дорогах, ведущих в Баку, кордоны из грузовиков, автобусов, автомашин, протестуя против угроз ввести в город войска. В ночь с 19 на 20 января Советская Армия вошла в советский город, легко смяв кордоны и расстреляв огнём из пулемётов и автоматов тех, кто стоял на дороге...