Остановившаяся дагестанская экономика уже не нуждалась в услугах международного порта, а Россия была не в состоянии его использовать.
Сама экономика республики представляла из себя довольно жалкое зрелище. Все семь заводов, расположенных в Махачкале, уникальные заводы Каспийска стояли без дела и без заказов. Не выплачивалась зарплата, люди в массовом порядке уходили с заводов и фабрик, старались уехать из Дагестана хоть куда-нибудь в Россию. Республика, где уровень жизни оказался на втором месте по России снизу, постепенно теряла население. Все, у кого была родня в России или за рубежом, стремились уехать из республики.
В изолированной со всех сторон стране замирали все признаки жизни. Грузооборот порта в Махачкале, еще и пострадавшего от жуткого шторма, сократился в те годы до совсем смешных цифр. В 1997 году за год через порт прошло не больше пятидесяти тысяч тонн грузов, 34 тысячи тонн нефти. В порту, где в советские времена работали больше тысячи человек, осталось не больше трехсот рабочих, да и те — сплошь пенсионеры. Молодых кадров не могло быть в принципе. Сократились тогда и объемы нефтедобычи, которые и без того не были высокими. К 1992 году Дагестан поставлял России до шестисот тысяч тонн нефти в год, в те годы объемы добычи доходили до пятидесяти тысяч тонн в год, да и ту некуда было вывозить — Грозненский завод не работал из-за войны.
Казалось, дагестанцам можно было сложить скорбно руки и смириться с крахом, согласиться с разорением республики и превращением ее в средневековую территорию. Но дагестанцы не таковы, чтобы прекратить борьбу и отчаяться. В самые трудные, 1997 и 1998 годы, народы республики продолжали работать и пробивать себе место в будущем. Конечно, многие трудоспособные мужчины покинули в эти годы родину, отправившись на заработки в другие российские города. Тем не менее, многие остались в Дагестане, продолжали держаться возле предприятий, где хоть немного теплилась жизнь. Жизнь продолжалась в порту, там сменилось руководство. Новый молодой и энергичный начальник порта Абусупьян Хархаров приступил к фактической модернизации порта. Перестройка и переоборудование основных мощностей были спланированы за несколько лет до этого. Были приняты соответствующие проекты, но денег на их реализацию не было. Едва ли не первым добрым знаком перемен к лучшей жизни порта стало приобретение им собственных судов. Два сухогруза: "Али Алиев", названный в честь легендарного дагестанского борца, и "Дагестан", приписанные к Махачкале, теперь ходили в Астрахань и Иран.
На сегодняшний день уже завершена реконструкция гидротехнической части двух причалов для сухогрузной гавани. Практически заново отстроена эстакада нефтепирса, представляющая из себя 110 метров железобетонного полотна на основательных металлических конструкциях. Старое деревянное полотно эксплуатировалось с середины 30-х годов, и сегодня ее эксплуатация грозила катастрофой. Новый нефтепирс способен принимать десятитысячники — тяжелые нефтяные танкеры. Параллельно ведутся дноуглубительные работы, чтобы в порт могли заходить более крупные суда с большой осадкой.
Было отвоевано у моря несколько метров суши. На полосе берега между гаванями берег нарастили, чтоб расширить территорию для технических нужд. КРАЗами свозили для этого к берегу моря грунт, из которого и воздвигали этот рукотворный кусок тверди.
Масштабы стройки были так велики и неоглядны, что порт даже сформировал собственное строительное предприятие. Люди охотно идут работать в порт. Здесь всегда есть работа и она хорошо и вовремя оплачивается. Средний оклад в две-две с половиой тысячи рублей — это очень неплохо по меркам Махачкалы и тем более остальных дагестанских городов. Рабочие высокой квалификации, бывает, зарабатывают в порту и по десять тысяч. Вдобавок руководство порта постоянно заботится о рабочих и служащих. В порту начала действовать отличная столовая. Там все портовики могут хорошо перекусить комплексным обедом рублей за пять — остальное проплачивает порт.