Но даже в израильской тюрьме, в инвалидной коляске Ясин продолжал руководить своей организацией, которая за короткий срок стала самой влиятельной и авторитетной в палестинском народе. Он поддерживал связь с оставшимися на свободе руководителями ХАМАС на Западном берегу и в секторе Газа. Сообщения шейха передавались тайно через посетителей, а писать письма парализованному узнику помогали сокамерники.
За время этого заключения популярность Ахмада Ясина неимоверно возросла не только среди палестинцев, не только среди арабов, но и во всем Исламском мире. Но его здоровье ухудшалось. После того, как во время допроса парализованный шейх был в очередной раз избит сионистами он лишился правого глаза, у него резко ухудшилось зрение левого глаза, он почти потерял слух. В тюрьме Ясин заработал хронический бронхит.
Израильские власти опасались того, что смерть в заключении такого пассионарного лидера как Ахмад Ясин усилит еще больше ненависть мусульман к сионистскому государству, придаст новый импульс интифаде — палестинскому народному восстанию.
Израильская контрразведка пыталась несколько раз "договориться" с парализованным заключенным. В обмен на свободу Ахмад Ясин должен был публично осудить вооруженную борьбу палестинского народа. В ответ шейх отвечал одно и тоже: "Если бы вы, в обмен на свободу, попросили меня дать обещание больше никогда не есть арбуз, то и тогда я отказался бы пойти на сделку с вами".
В октябре 1997 года Ахмад Ясин был освобожден в обмен на двух израильских агентов "Моссад", захваченных в Аммане после неудачной попытки покушения на руководителя политбюро ХАМАС Халеда Мишааля.
Вооруженная борьба палестинского народа расширялась, и шейх Ахмад Ясин стал великим, бескомпромиссным символом интифады. Незадолго до гибели Ахмада Ясина журналист спросил его: "Не отпугивает ли палестинских шахидов обещание израильского правительства использовать свинину для предотвращения взрывов в автобусах?"
— Они ничего не понимают в Исламе! — ответил шейх. — Если у мусульманина в его борьбе не будет иного выбора, он станет не только есть свинину, но и взрываться вместе с ней.
Израильский премьер-министр Шарон открыто призвал к убийству палестинского лидера. Первая попытка была предпринята в сентябре 2003 года, когда израильские истребители выпустили несколько ракет по его дому в Газе. Шейха слегка ранило. Через полгода 22 марта 2004 года оккупантам все же удалось убить Ахмада Ясина.
...В Священном Коране Всевышний говорит о погибших героях: "Нет, они не мертвые, а живые"...
Незадолго до своей гибели шейх Ахмад Ясин сказал: "Если меня убьют, появятся тысячи, подобные мне…Они (израильтяне) должны знать, что битва будет продолжаться ...".
...Ахмад Ясин был в госпитале. 21 марта поздно вечером, несмотря на протесты врачей, он неожиданно решил уехать. Шейх видел, что смерть быстро приближается к нему, и не хотел, чтобы с ним погибли десятки и сотни людей, находящихся в госпитале, когда евреи начнут бомбардировку.
Он заставил большую часть своей охраны оставить его, чтобы и их не подвергать смертельной опасности, и с небольшой группой сопровождения поехал в мечеть на утреннюю молитву. Закончив намаз, он, сосредоточенно прощаясь с этим миром, еще какое-то время молча просидел в своей инвалидной коляске. Через несколько минут после того, как он покинул мечеть, его машина была взорвана израильской ракетой.
Когда-то в детстве я случайно наткнулся на странные и совсем непонятные тогда слова Льва Толстого: "Счастлив человек, который знает день своей смерти".
Потом, гораздо позднее, я понял, что великий русский мыслитель мистически указывал о некой предельной ответственности личности за свою уникальную, неповторимую жизнь. Действительно, только уважая свою единственную смерть можно по настоящему ценить свою единственную жизнь. Повторений и дублей никогда здесь не бывает!
В марте 2004 года в одном из российских изданий появилась заметка, в которой были слова: "Убит шейх Ахмад Ясин — человек-легенда, живой символ Сопротивления, моджахед, даже в инвалидном кресле боровшийся с гнусным врагом, который захватил его Родину и пытается растоптать его народ. Он ушел из этой быстротечной жизни мучеником. Не надо скорбеть и плакать, ибо слезы и горести здесь не уместны. По шахидам не плачут… Жалкие людишки, одержимые страстью к накоплению, живущие от одной попытки полового сношения до другого, назвали Ахмада Ясина "террористом". Еще ранее таким же "террористом" для них был Нельсон Мандела, боровшийся с системой апартеида в Южной Африке. Так "террористом" становится каждый, кто не позволяет растоптать свою Веру, свой народ, человеческое достоинство… В 1942 году гитлеровцы, опираясь на Венские соглашения 1925 года, называли советских партизан "бандитами" и "террористами".