О наличии такого большого количества диверсантов и шпионов среди немцев Поволжья никто из немцев, проживающих в районах Поволжья, советским властям не сообщал, следовательно, немецкое население районов Поволжья скрывает в своей среде врагов советского народа и советской власти.
В случае, если произойдут диверсионные акты, затеянные по указке из Германии немецкими диверсантами и шпионами в республике немцев Поволжья или в прилегающих районах, и случится кровопролитие, Советское правительство по законам военного времени будет вынуждено принять карательные меры почти против всего немецкого населения Поволжья.
Во избежание таких нежелательных явлений и для предупреждения серьезных кровопролитий Президиум Верховного Совета СССР признал необходимым переселить все немецкое население, проживающее в районах Поволжья, в другие районы с тем, чтобы переселяемые были наделены землей и чтобы им была оказана государственная помощь по устройству в новых районах.
Для расселения выделены изобилующие пахотной землей районы Новосибирской и Омской областей, Алтайского края, Казахстана и другие соседние местности.
В связи с этим Государственному Комитету Обороны предписано срочно произвести переселение всех немцев Поволжья и наделить переселяемых немцев Поволжья землей и угодьями в новых районах».
При приближении немецких войск в Чечне вспыхнуло противобольшевистское восстание, которое немцы активно поддержали оружием и инструкторами.
Карачаевцы, балкары и дезертиры из других кавказских народов сформировали Кавказский легион Вермахта.
Калмыцкая конница целыми подразделениями переходила на немецкую сторону.
Когда в середине 1943 года германская армия отступила с Кавказа на запад, часть горцев ушла с ней. Но для оставшихся наступили мрачные времена. Сталин решил наказать не предателей, а целые народы. 6 ноября 1943 года были высланы карачаевцы — 69 тысяч человек. В декабре калмыки — 93 тысячи. 23 февраля 1944 года — 496 тысяч чеченцев и ингушей. 8 марта — 33 тысячи балкарцев. Выселять предпочитали в праздники, когда больше людей собиралось по домам. Всего около 650 тысяч.
Спецакции по высылке проводились войсками НКВД при участии армейских частей. В частности, при выселении чеченцев и ингушей было задействовано 100 тысяч солдат внутренних войск и 19 тысяч оперативников НКВД. Выселяемые бросали на произвол судьбы дома, имущество, скот, покидая родные места без надежды на возвращение. Время сборов и размеры ручного багажа жестко лимитировались властями — 100 кг груза и 20 минут на сборы. Их погрузили в 177 эшелонов.
При депортациях войска НКВД привлекали в качестве помощников гражданских лиц из народов, которые не подлежали выселению. Осетины, русские, черкесы, дагестанцы выселяли своих соседей, забирали их имущество, и между народами пролегла трещина, не зажившая до сих пор.
29 февраля операция «Чечевица» была завершена. 7 марта 1944 года Чечено-Ингушская АССР была ликвидирована. На следующий день появился указ о награждении «за образцовое выполнение заданий правительства в условиях военного времени…». Руководители операции Аполлонов, Кобулов, Серов, Меркулов были награждены полководческими орденами Суворова I степени.
Сталинская депортация погубила значительную часть населения Чечни, в значительной степени способствовала проявлению ненависти чеченцев к русским и привела к их сепаратистским выступлениям в 1993–1994 годах.
Операция по депортации крымских татар началась 18 мая 1944 года. До войны в Крыму проживало 19 % татар от всего населения. Было выселено 191 044 человека — практически все татарское население — в Среднюю Азию, включая 9 тысяч солдат и офицеров, отозванных из действующей армии.
Сталин не простил крымским татарам то, что из их добровольцев на территории Крыма были созданы соединения СС, Татарский горно-егерский полк, Татарская горно-егерская бригада, Боевая группа «Крым» восточнотюркского соединения СС, 35-я полицейская гренадерская дивизия СС, вспомогательные батальоны «Чума» (полиция).
В марте 1942 года татарские подразделения СС сожгли греческую деревушку Лаки вместе с жителями (Крымская Хатынь).
Вслед за татарами из Крыма было выселено 15 тысяч греков, 12 тысяч болгар и 10 тысяч армян. В письмах руководителей НКВД Сталину эта акция мотивировалась следующим образом: «В период немецкой оккупации значительная часть болгарского населения активно участвовала в проведении мероприятий по заготовке хлеба и продуктов питания для германской армии…» «Значительная часть греков, особенно в приморских городах, с приходом оккупантов занялась торговлей и мелкой промышленностью…» «Армянские национальные комитеты… проводили работу по пропаганде «независимой Армении».