Выпуск подлодок XXIII серии так и не удалось реализовать на верфях Черного моря, сборка на верфи в Линце в конце августа стала невозможной из-за угрозы наступления Красной Армии. А в районе побережья Средиземного моря наступление союзников и угроза их дальнейшего военного вторжения заставила бросить незаконченные подлодки на верфях Тулона, Генуи и Монфальконе. 6 сентября они были исключены из производственного плана.
Новая подлодка XXIII серии U 4709 после спуски со стапеля на верфи Германия, 8 февраля 1945 года.
Строительство подлодок XXIII серии для действий на Северном море продолжилось на верфях Германии. На 20 совещании по вооружению была принята сокращенная программа по выпуску 80 подлодок XXIII серии, в то время как командование кригсмарине требовало довести их выпуск до 185 штук. На следующем совещании, состоявшимся 4 октября 1944 года, Дениц потребовал продолжить выпуск подлодок XXIII серии. Он предложил начиная с апреля 1945 года выпускать ежемесячно 10 подлодок этого типа. Все они должны были выпускаться на верфи Германия. Дойче Верфт к тому времени была перегружена выполнением первоочередных программ (проект Ганза, постройка секций для подлодки Вальтера XXVI серии и др.) и поэтому заказ на постройку 67 подлодок XXIII серии в марте 1945 года был аннулирован. Однако налаженное производство секций для подлодки XXIII серии продолжалось здесь до конца войны. Оснащение секций приборами и оборудованием осуществлялось в задней части бокса № 2 бункера для подводных лодок в Киле.
Суммарный заказ на подлодки XXIII серии был увеличен до 260 штук. Большая часть заказа (140 подлодок) приходилась на Дойче верфт, еще 120 подлодок планировалось построить на верфи Германия. 23 ноября 1944 года Главный комитет по судостроению в имперском отделе вооружений решил весь заказ разместить на Дойче верфт, однако такое решение было следствием полного непонимания реальной ситуации и недостаточной информированности берлинского начальства.
20 декабря 1944 года на 26 совещании по вооружению с учетом ухудшения военного положения Германии был принят корректировочный план производства подлодок XXIII серии:
| Месяц: | 6 | 1 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | Всего в 1944 г. |
| Число п/л: | 1 | 4 | 5 | 6 | 6 | 6 | 10 | 39 |
Это составляло лишь 65% от программы заказов немецким верфям, принятой 3 июля того же года. Такое снижение было вызвано тем, что подлодки этого типа были новой продукцией для верфи Германия и требовалось время для организации их серийною производства на новом месте. Поэтому лишь две подлодки XXIII было собрано здесь к концу года из секций, изготовленных на Дойче верфт.
Продвижение войск союзников на Западном фронте резко усложнило проблемы снабжения металлоконструкциями, поэтому в конце 1944 года планы по выпуску были пересмотрены в сторону сокращения. Была принята срочная программа выпуска подлодок XXI и XXIII серий, исходящая из имеющегося в наличии материалов. И января 1945 года был составлен следующий план выпуска подлодок XXIII серии:
| Верфь/Месяц | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 1945 г. |
| Дойче Верфт | 11 | 6 | 2 | 2(4) | - | . | - | - | |
| Германия | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 7 | 10 | 10 | |
| Всего | 15 | 11 | 7 | 7 | 5 | 7 | 10 | 10 |
В целом заказ был снижен до 140 подлодок. В марте 1945 года для сборки секций, изготовленных на Дойче верке в Киле, был оборудован бункер Конрад. Прибывшие из Италии секции недостроенных подлодок должны были отправить на Дойче Верфт. 26 января 1945 года Гитлер приказал собрать и выпустить 70 подлодок из готовых секций. Уже 31 января должно быть готово 50 подлодок и 11 заложено на стапелях. Для остальных подлодок должны быть построены секции в разной степени готовности. Обновленный план требовал постройки секций для 74 подлодок XXIII серии.
1 февраля 1945 года Главный комитет по судостроению в имперском отделе вооружений дал заказ Дойче Верфт в Финкенвердере на выпуск 49 подлодок этого типа. Последняя подлодка U 2371 была заложена здесь на стапеле 19 января 1945 года. Эта верфь должна была еще выпускать готовые секции для верфи Германия. Здесь были изготовлены секции для 8 подлодок, предназначенных для сборки на верфи Германия. Это были подлодки U 4715 – U 4720. U 4722 и U 4723. Для подлодок U 4721, U 4724 и U 4725 секции должны были прибыть из Дойче Верк в Киле и Дойче верфт.