На фоне ультиматумов, выдвигаемых Эстонии и принятых её руководством, началось проведение мероприятий по усилению КБФ в Прибалтике. Военный совет КБФ перебазировался в Палдиски. 24 июля 1940 года была создана в Таллине Главная ВМБ, БалтВМБ упразднялась. Управление КБФ тремя эшелонами 15 и 16 июля было передислоцировано в Таллин. В дополнение к находящейся в районе полуострова Пакри 12-й ж/д батарее 180-мм орудий, к 1 августа переводилась 11-я ж/д батарея 356-мм орудий[70]. Из Ханко в Палдиски была передислоцирована 207-я офлр. Для создания ПВО ГлВМБ из Палдиски в Таллин переводились управление участка ПВО и 83-й озадн, на его место в Палдиски передислоцировался 62-й озадн. На острова севернее Таллина и полуостров Сууроп передислоцировался 61-й озадн[71]. Береговая оборона была разделена. Все части дислоцируемые на Моонзундских островах и острове Осмуссаар были включены в состав береговой обороны Балтийского района (БОБР). Комендант БОБР, генерал-майор береговой службы Кабанов, подчинялся ВС КБФ. В состав береговой обороны ГлВМБ вошли береговая артиллерия в районах Таллина и Палдиски. Управлене коменданта БО ГлВМБ находилось в Палдиски. В его подчинении был ОХР Палдиски, 153-я омср, 208-я отд. флотская рота и 6-я ождэр. Комендант БО ГлВМБ был назначен полковник И. А. Кустов. 10-я авбр была передана в подчинение командующего ВВС КБФ[72].
После вхождения Эстонской ССР в состав СССР, КБФ были переданы корабли бывшего эстонского флота. На основании приказа № 00208 от 19 августа 1940 года в состав КБФ были включены: миноносец «Сулев» (ОВР ГлВМБ), подводные лодки «Калев» и «Лембит» (2-я бр ПЛ), сторожевые корабли «Пиккер» (штаб КБФ, как посыльное судно), «Лайне» (СНиС КБФ), «Мардус» (тыл КБФ, как отопитель), минные заградители «Ристна» и «Суроп» (ОВР ГлВМБ), «Кери» и «Вайндло» (как тральщики ОВР ГлВМБ), гидрографические корабли «Секстант», «Мерепоэг» и «Лоод» (гидрографический отдел КБФ), ледокол «Ян Поска» (отдел связи КБФ, с переименованием в «Пернов»), вспомогательные суда «Сакала» и «Тахкона» (коменданту БОБР) и «Компас» (отдел связи КБФ, как кабельное судно), канонерские лодки «Тарту», «Ахти», «Илматар» и «Ванемуйне» (ВМУ им. Фрунзе)[73]. Приказанием начальник штаба КБФ № НШ/021с от 20 августа 1940 года кроме вышеуказанных кораблей в состав КБФ включались: сторожевые катера Кайтселийта — 16 ед.; катера службы связи — 11 ед.; ледоколы: «Тасуя», «Мерикару» и «Юри Вильмс»; рефрижераторное судно «Пеару»; транспортные суда: «Вирония» и «Вайндло»; плавкран 50 т; баржа «Пидула» и нефтеналивной танкер водоизмещением 400 т, а также все средства и суда гидрографического ограждения[74]. Фактически передача кораблей и перевод личного состава в соединения КБФ начались только во второй половине сентября и закончились в конце года.
Была создана комиссия по выбору мест для береговых батарей и перевооружения бывших эстонских батарей на островах Найссаар, Аэгна, полуостровов Сууропи и Виимси[75]. Бывший судоремонтный завод Рииги Садаматехатс (Государственные Портовые мастерские) в Таллине был передан КБФ[76]. Береговая артиллерия бывших эстонских ВМС была использована КБФ. Из батарей на острове Аэгна и полуострове Виимси был развернут 94-й адн БО. В его состав вошли 334-я (IV-305), 181-я (IV-152), 182-я (III-130) и 185-я (IV-152) батареи. Батареи на острове Найссаар и полуострове Сууропи вошли в состав 96-го адн БО: 183-я (IV-152), 184-я (IV-152), 187-я (IV-120) и 188-я (III-234) батареи[77].
Состав частей и соединений Главной военно-морской базы КБФ на 1 января 1941 года дан в приложении 2.
На основании постановления СНК СССР от 1 марта 1941 года № 381–171/с порт Таллин был объявлен закрытым портом. Иностранные пароходы могли войти в него только по специальному разрешению штаба КБФ[78]. Приказом командующего КБФ № 053 от 12 марта 1941 года в состав флота были зачислены строительные батальоны от Наркомстроя СССР: 43-й, 44-й, 45-й, 47-й и 48-й[79].
По перспективному плану[80] в период с 1941 по 1943 год планировалось построить и ввести в строй в составе Главной ВМБ КБФ батареи, береговой обороны и ПВО, представленные в таблице.
Таблица 1
№ п/п
Батареи
1941
1942
1943
1
305-мм башенная береговая батарея
2
2
180-мм башенная береговая батарея*
1
2
3
152-мм открытая береговая батарея
1
1
1
4
130-мм береговая батарея
1
5
85-мм зенитная батарея
3
6
6
76-мм зенитная батарея
1
6
6
7
37-мм зенитная батарея
3
14
* Планировалось построить в 1941 г. на о. М. Пакри и было начато строительство в 1941 г. на о. Найссаар.
Руководство ВМФ СССР планировало провести модернизацию бывших эстонских батарей. Еще 2 октября 1940 года Наркомом ВМФ был отдан приказ № 00248 о перевооружении и введении в строй некоторых бывших эстонских батарей к 1 мая 1941 года. По утвержденному наркомом титульному списку, во первом квартале 1941 года перевооружались батареи, на 100-мм орудия Б-34, на полуостровах Сууропи и Виимси, а во втором квартале на островах Аэгна и Найссаар. Этот список был получен 1-м особым строительным отделом только 1 марта, в указанные сроки выполнить его не смогли. Поэтому инженерный отдел КБФ установил следующие сроки сдачи батарей: на острове Найссаар, полуостровах Сууропи и Виимси к 20 июня, на острове Аэгна к 25 июня[81]. Реально батареи были введены в строй уже после начала войны. 188-я береговая батарея, имевшая на вооружении 234-мм орудия, была в марте 1941 года расформирована.
Достаточно мощной была противовоздушная оборона Главной базы КБФ. Она состояла из трех полков зенитной артиллерии. По сути это была целая дивизия (3-й, 4-й и 5-й зап). Кроме нее зенитное вооружение имели и корабли флота.
С мая 1941 года в район Таллина начали прибывать части 1-й особой бригады морской пехоты КБФ. История этой бригады следующая. В июле 1939 года на базе Кронштадского крепостного стрелкового полка была сформирована отдельная специальная стрелковая бригада КБФ[82]. В июне 1940 года она была переформирована в 1-ю обрмп. В ее составе было управление, пять отдельных батальонов и отдельная танковая рота[83]. Первоначально бригада подчинялась командиру КрВМБ и дислоцировалась: управление, 1-й и 5-й батальоны, танковая рота в Койвисто (Приморск), 2-й батальон на о. Паатио-Лайтсальми (ныне о. Большой Пограничный), 3-й батальон на о. Тиурин-Саари (ныне о. Западный Березовый), 4-й батальон на о. Суур-Саари (ныне о. Гогланд). Бригада насчитывала 4469 чел., 195 станковых пулеметов, 162 ручных пулемета, 16 минометов (из 45 положенных по штату), 16 45-мм орудий, 28 76-мм орудий, 12 танков Т-38. В дальнейшем 5-й батальон был расформирован. Из него были созданы отдельные роты морской пехоты для Пинской и Дунайской флотилий[84]. Наиболее были обеспечены артиллерией 1-й и 3-й батальоны. На 1 января 1941 года имелось 14 танков Т-38 и 14 танков Т-20. Боезапас для 76-мм орудий составлял 30 %[85].
Приказом командующего КБФ от 27 мая 1941 года для занятий в летнем периоде обучения началась передислокация бригады. На полуострове Сууропи сосредотачивались управление, 1-й и 2-й батальоны. В Приморске сосредотачивались 3-й батальон и танковая рота. На острове Гогланд оставался 4-й батальон. На зимний период обучения управление, 1-й и 2-й батальоны должны были вернуться в Приморск[86].