Как раз в то время, когда цари атлантов были готовы снова выступить против Египта, огромная комета приблизилась к Земле, как это происходило каждый год. Однако теперь, начиная с 1240 г. до н. э., с ее приближением к планете Земля стали падать осколки метеоритов со все возрастающей интенсивностью, вызывая пожары, землетрясения, извержения вулканов. Последствия этого были катастрофическими для всей планеты. В XII веке до н. э. комета и смертельно опасный поток метеоритов оказались слишком близко к Земле. Пик разрушений приходится как раз на время, когда первую комету подтолкнула ближе к Земле другая комета, известная сегодня как комета Галлея. В первых числах ноября 1198 г. до н. э. один, а может быть, несколько крупных метеоритов или астероидов, упали в Атлантический океан и ударились о его дно. Удар вызвал катастрофическую цепочку последующих геологических событий, случившихся вдоль всей длины Срединно-атлантического хребта. Под действием сейсмических и вулканических сил пылающий остров Атлантида скрылся в пучине океана «за один день и ночь».
Большинство островитян погибло, но несколько человек из самой верхушки общества (верховных жрецов, военных, аристократов), у которых был доступ к кораблям, смогли выбраться из этого огненного ада и добраться до колоний погибшей атлантической империи. Некоторые из них приплыли в Америку, где они и их потомки попытались сохранить память о своей погибшей в волнах родине, возведя Змеиный курган (штат Огайо), а также учредив ставшую традиционной церемонию на берегах колумбийского кратерного озера Гуатавита.
Выживших атлантов не везде принимали с радостью как носителей более высокой культуры. Некоторые из них, вернувшись в восточную часть Средиземного моря, решили продолжить свои попытки захватить Египет. Потеряв все, что у них было по ту сторону Геркулесовых столпов, атланты и их ливийские союзники вторглись в долину Нила. Но силы Египта возглавлял Рамзес III, выдающийся египетский полководец. Умело используя речную систему дельты Нила, его воины нанесли сокрушительное поражение захватчикам. Разбитые силы атлантов были вытеснены в Палестину, и здесь они собрались, чтобы вновь напасть на Египет, уже с востока.
Однако и на этот раз они потерпели поражение от сил фараона. Конфедерация атлантических сил была окончательно разгромлена. «Люди моря» перестали существовать как народ. Последние две тысячи человек были взяты в плен торжествующими египтянами. Пленных допросили, о чем имеются документальные свидетельства. Те рассказали о своем неудачном вторжении, о гибели родного острова под натиском обрушившегося на него огня с неба и вод, все сметающих на своем пути.
Эти записи были нанесены на стены Храма Победы, Мединет Хабу, в Западных Фивах, и на сохранившиеся таблички из храма богини Нейт в Саисе, в дельте Нила. Именно здесь история об Атлантиде была переведена для Солона, великого афинского законодателя около 550 г. до н. э. Вернувшись в Грецию, он записал эту историю во всех деталях для поэмы, которую собирался написать. Солон умер прежде, чем смог осуществить свое намерение, однако его записи оказались у Платона. Платон в начале IV в. до н. э. записал эту историю в своих «Диалогах», на которые с тех пор и ссылаются как на главный источник сведений об Атлантиде.
Неизвестное, но, очевидно, весьма значительное количество документов, связанных с Атлантидой, долгое время сохранялось в греческих, ассирийских, карфагенских и египетских храмах. Огромное хранилище их существовало в Александрийской библиотеке. Когда эта и другие «языческие» библиотеки и храмы были сожжены в конце V в. н. э., большинство источников, посвященных Атлантиде, погибло безвозвратно. Христианские теологи объявили историю Атлантиды ересью, так как она, по их мнению, противоречила библейской истории о Великом Потопе. В течение следующих восьми веков Атлантида была почти полностью забыта.
Но с началом Ренессанса и эпохи географических открытий, когда начались плавания по Атлантическому океану, снова вспомнили об истории, рассказанной Платоном. Как указывает известный американский археолог Э. Вишоу, кое-кто из команды Колумба отправился в плавание только затем, чтобы найти все еще живущих где-нибудь потомков жителей погибшей Атлантиды. И они не были разочарованы, услышав множество американских вариантов легенды о Всемирном потопе. Однако только в конце XIX в. эти сказания были сопоставлены с аналогичными легендами и мифами других народов мира, а также с современными данными геологической науки в попытке предпринять первое серьезное исследование этого предмета как исторического феномена. Американский автор И. Доннелли стал основателем атлантологии, серьезно изучающей все, что относится к Атлантиде.