Через три дня после кровавых событий, 21 ноября 1978 года, агентство "Ассошиэйтед пресс" сообщило: "Дуглас Дэвидсон, служащий американского посольства, заявил, что трупы уже достаточно сильно разложились, и власти рассматривают возможность захоронить их в Джонстауне".
Когда американские власти отказались проводить патологоанатомические исследования, гайанская полиция организовала опознание трупов теми членами "Храма народов", которые уцелели (среди них был Тим Картер). Опознанных укладывали по семейному признаку, если это было возможно.
Ряд аутопсий был произведен доктором С. Лесли Муту, главным медицинским экспертом Гайаны. Хотя он находился в контакте с доктором Робертом Стайном, медицинским экспертом Чикаго, и просил помощи американских судебных патологов, такой помощи не последовало.
После того как трупы пролежали под лучами тропического солнца четыре дня, правительство Соединенных Штатов начало действовать. Сорок (из числа плохо сохранившихся) трупов были помещены в пластиковые мешки и доставлены на военных вертолетах из Джонстауна в Джорджтаун. Они находились в зоне ожидания аэропорта "Тимери" до тех пор, пока не были обеспечены военные транспортные самолеты для их доставки на военно-воздушную базу в Довере (штат Делавэр). Несмотря на тропический климат Джорджтауна, ни полковник Гордон, ни его подчиненные не сделали никаких попыток сохранить трупы при помощи заморозки или какого-либо другого способа. Многие из них были доставлены на авиабазу в Довере только через десять дней после кровавых событий. В течение этого времени американские специалисты не взяли ни одного образца тканей, не выполнили ни одной аутопсии и не сделали никаких попыток опознать трупы. Из всех баз Калифорнии военно-воздушная база в Довере была выбрана потому, что американские власти (как они сами заявили) хотели, чтобы убитые находились настолько далеко от родственников, насколько это было возможно, но зачем? Как сообщила 26 ноября "Нью-Йорк таймс", "в интервью патологи сказали, что бальзамирование трупов до аутопсии сильно затруднит процесс выяснения содержания цианистого калия и других токсинов". В том же номере "Нью-Йорк таймс" было написано: "Патологи, принимавшие участие в расследовании других несчастий такого масштаба, заявили, что в течение последующих лет могут возникнуть юридические проблемы в случаях, если причины не будут точно установлены".
После многодневных проволочек правительство США все же дало указание вскрыть тело Джонса и шести других членов "Храма народов". Вскрытия были выполнены военными патологами под руководством заместителя директора Института патологии при вооруженных силах — полковника Уильяма Коуэна и гражданского патологоанатома доктора Рудигера Брайтенекера, сотрудника Медицинского центра города Балтимор. В мартовском номере журнала "Лэб уорлд" за 1979 год — уважаемого издания, предназначенного для директоров лабораторий и судебных патологов США, — доктор Брайтенекер заявил, что "расследование должно было идти по двум основным направлениям: 1) опознание и 2) выяснение причин смерти и того, как она наступила". Брайтенекер подчеркнул также: "Значительную помощь при этом могло бы оказать выполнение следующих процедур, которых придерживаются все квалифицированные медицинские эксперты, ведущие расследование: опознания тел, отметки при помощи бирок положения тел и фиксации положения тел по семейному признаку. В данном случае, когда члены семей умирали вместе, мы бы сильно продвинулись в расследовании, опознав хотя бы одного члена семьи. Остальных опознать было бы уже легче. Быстрая заготовка и сохранение токсикологических образцов позволили бы скорее и точнее определить причины смерти".
В той же самой статье в журнале "Лэб уорлд" подполковник Бригэм Шулер, офицер по связям с общественностью при министерстве обороны, признал, что "образцы не были взяты".
Когда "Лэб уорлд" задал доктору Круку вопрос, почему он не взял образцы фрагментов тел, тот ответил: "У меня с собой не было даже карманного ножа, не говоря уже о специальном оборудовании и средствах для сохранения образцов тканей". Возможно, что доктор Крук действительно оказал правду, но… Надо вспомнить то обстоятельство, что в Джонстауне была прекрасно оборудована медицинская клиника, где было все необходимое, в том числе и рентгеновские установки, скальпели, медикаменты и т. д.
"Лэб уорлд" провел тщательное изучение различных медицинских просчетов в действиях американских властей в отношении убийства в Гайане. В соответствующей статье, автором которой был помощник редактора журнала Мэнли Уиттен, задавался вопрос: "Почему профессионал (д-р Крук), который совершил путешествие в сотни миль для медицинской помощи согражданам, не имел с собой оборудования для работы?" Уиттен сообщил, что, по словам полковника Гордона, "в Гайане даже не была упомянута необходимость сохранения токсикологических образцов".