Аналогичные перемены произошли и в других недавно полученных Генералитетом землях, за исключением Маастрихта и Овермааса, где в соответствии с указом Генеральных Штатов от 1632 г. было разрешено отправлять католическое богослужение, и где католическая Церковь осталась в неприкосновенности. Процесс замены одного вероучения другим ускорился в тех землях, где штатгальтер обладал особенным влиянием. Фредерик-Хендрик, как правило, благосклонно относился к католикам, проживавшим в его владениях; но Вильгельм II, славившийся своей распущенностью, и по образу жизни бывший кем угодно, но только не кальвинистом, в отличие от своего отца увидел в ортодоксальном кальвинизме ценную опору для своей власти. Вскоре после заключения мира принц поручил дросту Бреды «немедленно и без отлагательства убрать из церквей все алтари и папистское убранство» и назначить реформатских проповедников в баронию за пределами города{21}. До 1648 г. реформатские проповедники в Генералитетских землях не могли даже показаться за пределами стен городов, где стояли гарнизоны, поэтому, несмотря на подавляющее присутствие голландских войск с 1590-х гг. до 1625 г. и снова в 1637-1648 гг., Реформация в большей части баронии Бреда и сеньории Стенберген (см. карту 10) фактически началась только в 1648 г. То же самое с полным правом относится к местностям вокруг Хулста, Сас ван Гента и другим недавно аннексированным округам Статс-Фландрии. Вильгельм II также распространил Реформацию в своем графстве Линген, дав указание его дросту, Рутгеру ван Хэрсолте, изгнать католических священников (которым его отец разрешил остаться), освободить церкви от предметов культа и назначить реформатских проповедников{22}. Так как Линген — территория с преимущественно католическим населением — был зажат между двумя основными частями княжества-епископства Мюнстер, где Контрреформация в то время одержала полную победу, то перемены в Лингене внесли свою лепту в напряженность в отношениях между реформатами и католиками на всей восточной границе Республики, и между Республикой и князем-епископом{23}.
Но вскоре стало очевидным, что назначения реформатских проповедников, введения Государственной Библии и реформирования школ было недостаточно для того, чтобы заменить религию в области, где с конца XVI в. в результате наступления Контрреформации в Испанских Нидерландах вновь упорно насаждался католицизм. Появление внешних признаков Реформации в неукрепленных городках и деревнях в Генералитетских землях означало конец борьбы. Но оно же стало сигналом (для католических священников) к возвращению с территорий, находившихся под контролем католиков, и восстановлению прежней духовной власти над сельскими жителями и горожанами, а местному населению позволило извлечь из тайников спрятанные там изображения святых и восстановить свою религиозную культуру{24}. Сокращение численности гарнизонов и военных патрулей также поощряло такие тенденции.
Неудача протестантского дела в Генералитетских землях вызвала бурное возмущение в официальной Церкви по всем Соединенным Провинциям. Реформатские синоды считали, что Реформация в недавно вошедших в состав Республики областях будет успешной только в том случае, если Генеральные Штаты примут более радикальные меры, настаивая, что Республика не может пассивно наблюдать за тем, как католическая Церковь торжествует на этих обширных и стратегически важных территориях. В июне 1648 г. Генеральные Штаты издали указ, запрещавший католическим священникам доступ в Генералитетские земли{25}. Испания выразила свой протест против этого нарушения условий мирного договора, который гарантировал свободу передвижения между территориями обеих сторон. По мере того, как нажим со стороны синодов, требовавших более жестких мер, все возрастал, возникла ответная реакция среди голландских регентов, не одобрявших те методы, посредством которых синоды проводили свою политику в Генералитетских землях, их стремления к принуждению и тех негативных последствий, которые могли наступить из-за этого в отношениях с Испанией. Ключевой проблемой было предложение, поддержанное синодами, сместить католиков со всех муниципальных и административных постов в Генералитетских землях. Эта мера нашла поддержку у нескольких малых провинций, но натолкнулась на решительное сопротивление Штатов Голландии. Большинством голосов ассамблея отвергла такую инициативу, вопреки совету штатгальтера и представителей Лейдена и Харлема{26}.