Итак, Клеофонт был теперь первым человеком в Афинах; он смотрел на положение военных дел с тем оптимизмом, который всегда обнаруживали афинские радикалы. Под его влиянием были отвергнуты мирные предложения лакедемонян; не менее, впрочем, этому способствовало и то соображение, что совершенно безразлично, как выскажется по этому вопросу Афинское народное собрание и что настоящее решение зависит от воли флота, или, вернее, его начальника, Алкивиада. А Алкивиаду нужна была война как вернейшее средство возвыситься до того положения в государстве, которого жаждало его честолюбие; что ему было до того, в интересах ли Афин продолжать войну?
Таким образом, война продолжалась по-прежнему. Тотчас после прекращения переговоров царь Агис передвинулся со своей позиции при Декелее вниз, по направлению к Афинам. Однако он не решился принять сражение, которое Фрасилл предложил ему под стенами города; этот успех, конечно, возбудил в Афинах большое ликование. Следующей весною (409 г.) Фрасилл, во главе флота из 30 кораблей, с многочисленным десантом, отплыл для покорения Ионии. Войско высадилось в Нотионе, и соседний Колофон тотчас перешел на сторону афинян; затем Фрасилл обратил свое оружие против Эфеса. Но здесь его встретили сиракузцы и селинунтцы, которые после битвы при Кизике построили себе новые корабли и получили с родины подкрепление в 5 триер. Сатрап Тиссаферн также поспешил со своим войском на защиту находившегося в опасности города. Фрасилл потерпел тяжелое поражение, которое стоило ему четырехсот человек и заставило его отказаться от экспедиции против Ионии. После этого он направился к Геллеспонту и соединился там с Алкивиадом.
Последний до сих пор должен был ограничиваться незначительной борьбою с Фарнабазом; прибытие Фрасилла дало ему возможность перейти к решительным действиям. Весною 408 г. началась осада Калхедона; вылазка пелопоннесского гарнизона была отбита, и Фарнабазу, сделавшему в это самое время попытку подать помощь осажденным, не удалось прорвать линии аттических войск. Ввиду этого поражения сатрап согласился заключить договор, которым он обязался приостановить враждебные действия против Афин, проводить к царю афинское посольство и уплатить 20 талантов; афиняне со своей стороны признали независимость Калхедона, который, однако, должен был впредь платить свою прежнюю дань и внести недоимку, накопившуюся со времени его отложения. Затем Алкивиад перешел в Европу, завоевал Селимбрию и, после продолжительной осады, Византию. Теперь почти все прилегавшие к Геллеспонту области, за исключением Абидоса, опять были во власти афинян. В следующем году (407) Фрасибул вернул к покорности также Фасос и отложившиеся области на южном побережье Фракии, так что из областей, составлявших Афинскую державу в 413 г., в руках врага оставались еще только материковая часть Ионии, Хиос, Родос и Эвбея. Если Пилос перешел к лакедемонянам, а Нисея к мегарцам, то с этим можно было примириться ввиду упомянутых успехов.
Пока Алкивиад покорял прилегающие к Геллеспонту области, в Сицилии наступили события, заставившие сиракузцев отозвать свои корабли из Эгейского моря. Самым могущественным человеком в Сиракузах после победы над афинянами был Гермократ. Еще Гелийский мир (424 г.), положивший конец первой попытке афинян упрочиться в Сицилии, был в значительной степени делом его рук; спустя 10 лет он, до прибытия Гилиппа один, а затем — вместе с ним, руководил обороной Сиракуз, и ему главным образом принадлежала заслуга в том, что сиракузцы решились вступить в борьбу с неприятелем также и на море. Когда осадное войско афинян было уничтожено, он усердно хлопотал об отправлении сиракузской эскадры на греческий восток и сам стал во главе ее.