Но именно это удаление из Сиракуз оказалось для него роковым. Победа над афинянами, которою Сиракузы были обязаны главным образом флоту, способствовала сильному подъему самосознания в низших классах; они стали требовать расширения своих политических прав. Поэтому демагог Диокл преобразовал сиракузскую конституцию в духе радикальной демократии и ввел, по афинскому образцу, выборы по жребию для замещения целого ряда государственных должностей. Новые правители видели в Гермократе своего опаснейшего противника, а уничтожение сиракузского флота при Кизике дало им желанный повод, чтобы устранить врага. Постановлением Народного собрания Гермократ был отставлен от должности и изгнан из Сиракуз, а во флот посланы новые стратеги. Смещенный военачальник не решился оказать сопротивление, потому что, если он и был уверен в своих офицерах, зато солдаты были, в громадном большинстве, убежденные демократы. Он отправился к Фарнабазу, с которым во время борьбы на Геллеспонте вступил в тесную дружбу; вскоре затем он присоединился к спартанскому посольству, которое летом 408 г. отправилось к персидскому царю.
Тем временем борьба между Сиракузами и западными союзниками Афин шла своим чередом. В Фуриях вскоре после катастрофы при Ассинаре вспыхнула революция, следствием которой было изгнание приверженцев Афин и отправление городом эскадры на помощь пелопоннесцам. Напротив, Катана успешно сопротивлялась неприятелю, поддерживаемая остатками афинской армии, тем более что Сиракузы были истощены продолжительною осадою и значительную часть своего флота отправили в Эгейское море. Труднее приходилось элимийцам, населявшим Сегесту и Эрике, в их борьбе с могущественным соседним городом Селинунтом. Доведенные до крайности своими противниками, они в конце концов принуждены были броситься в объятия карфагенян.
Карфаген после гимерийской катастрофы воздерживался от всякого вмешательства в сицилийские дела. Даже во время Аттической войны он оставался нейтральным, несмотря на то, что афиняне предлагали ему заключить союз; а гибель афинского флота в Сиракузской гавани, конечно, не могла побудить Карфаген к тому, чтобы он изменил политику, которой держался до тех пор. Но теперь более не оставалось выбора. Если бы Селинунту удалось покорить элимийцев, — финикийским городам в северо-западной части острова грозила бы близкая опасность, и тогда Карфагену все-таки пришлось бы вступить в борьбу с сицилийскими эллинами, да еще при более неблагоприятных обстоятельствах.
Поэтому летом 409 г. карфагеняне отправили на помощь Сегесте отряд войска, который нанес селинунтцам серьезное поражение; ближайшей весною двинулась главная армия, состоявшая из карфагенских граждан, ливийских подданных и иберийских наемников, под предводительством „царя" Ганнибала, внука того самого Гамилькара, который некогда в борьбе с Гелоном при Гимере проиграл сражение и был убит. Карфагеняне высадились у мыса Лилибей, немедленно двинулись на Селинунт и приступили к осаде его. Стены города в течение продолжительного мира пришли в ветхость и скоро пали под ударами неприятельских орудий, атака беспрерывно продолжалась, пока, наконец, на девятый день иберийцы не прорвались через брешь. Затем в городе началась страшная резня; варвары не щадили ни возраста, ни пола, и, по преданию, жертвой их ярости сделались 16000 человек. В плен было взято только 5000, которых победители отвезли в Африку и обратили в рабство; еще меньше было число тех, которым удалось спастись в соседний Акрагант. Город был разграблен, а стены его разрушены.
Катастрофа совершилась с такою ужасающей быстротою, что сиракузцы не успели своевременно явиться на выручку города. В ожидании войны с Карфагеном они заключили мир с Катаной и Наксосом и отозвали свой флот из Эгейского моря; при известии о высадке неприятеля они тотчас отправили под начальством Диокла 3000 гоплитов, которые дошли уже до Акраганта, когда Селинунт пал. Случай помериться с карфагенянами не заставил себя ждать.