25 января 1943 г. штаб корпуса был преобразован в штаб инспектора русских воинских частей в Сербии. В этом отношении статус корпуса был приближен к статусу иностранных легионов Вермахта и СС, части которых в оперативном отношении были подчинены германскому командованию. Однако 1 августа того же года, по-видимому в связи с особым положением, которое Русский охранный корпус занимал в системе германских военных и полицейских структур на Балканах, прежние наименования должности командира корпуса и штаба корпуса были восстановлены.
Помимо включения корпуса в состав Вермахта и реорганизации, было решено провести его омоложение и зачислить в его ряды первоначально в качестве эксперимента до 300 советских военнопленных. 12 марта 1943 г. в корпус прибыло 297 бывших красноармейцев, из которых были сформированы две особые роты. В сентябре того же года начался набор добровольцев среди русского населения территорий, аннексированных в 1941 г. Румынией (Северной Буковины, Бессарабии и района Одессы). В результате успешно проведенной вербовочными комиссиями работы корпус получил к концу года 5-тысячное пополнение{1137}. Из этого контингента в каждом полку было сформировано по 2–3 учебные роты, а в дальнейшем на его основе с привлечением старых кадров началось формирование 4-го и 5-го полков (соответственно 15 декабря 1943 г. и 15 февраля 1944 г.). Часть личного состава учебных рот послужила для формирования 6 новых рот в старых полках — этот шаг был вызван сокращением численности полков в результате оттока из рядов корпуса части чинов из старой эмиграции, не выдерживавших тяжелых условий службы в качестве рядовых и унтер-офицеров.
К сентябрю 1944 г. Русский охранный корпус насчитывал 11 197 человек. Штаб корпуса включал отделения: оперативное, снабжения и разведывательное, адъютан-туру, интендантство, санитарную и ветеринарную службы, службы связи, автотранспортную и ПВО, а также коменданта штаба. При штабе корпуса находился батальон «Белград» в составе рот: запасной, караульной, транспортной и снабжения, а также две отдельные роты — связи и ветеринарная.
Каждый из пяти полков корпуса (1-й Казачий, 2-й, 3-й, 4-й и 5-й) включал три батальона и пять отдельных взводов: артиллерийский, противотанковый, саперный, конный и связи. Батальон имел три стрелковые роты (в каждой 170 чел.) и взвод тяжелого оружия (впоследствии в 4-м полку была сформирована артиллерийская рота, в 5-м — артиллерийская и противотанковая, а в каждом батальоне — рота тяжелого оружия). Численность 2-го, 3-го и 5-го полков по штату составляла 2183 чина, а 1-го и 4-го (за счет наличия в них духовых оркестров) — 2211{1138}. Стрелковые роты имели на вооружении 16 ручных пулеметов и 4 ротных миномета (50-мм), взводы тяжелого оружия — 4 станковых пулемета и столько же батальонных минометов (81-мм). Артиллерийские взводы полков были вооружены каждый двумя 75-мм орудиями, а противотанковые — двумя или тремя 37-мм пушками.
Германский персонал был представлен двумя офицерами связи при штабе корпуса, каждого полка и батальона и двумя унтер-офицерами — инструкторами в каждой роте. Кроме того, в руках германских военных чиновников и унтер-офицеров находились все хозяйственные учреждения подразделений корпуса. Однако в отличие от большинства восточных формирований Вермахта ни один немецкий офицер в Русском корпусе дисциплинарной власти не имел и командной должности не занимал. Непосредственно подчиненным германскому командованию был лишь командир корпуса.
Весь внутренний уклад жизни корпуса и обучение личного состава первое время строились по уставам Российской Императорской армии, однако в связи с изменением тактики ведения боя и появлением новых видов оружия вскоре пришлось перейти на уставы Красной Армии, как отвечавшие современному состоянию военного дела{1139}. С включением корпуса в состав Вермахта были введены немецкие уставы. Не получившая военного образования молодежь сводилась в отдельные юнкерские взводы и роты. Для подготовки командиров батальонов и рот существовали курсы командного состава, а также военно-училищные курсы, подготовившие за время войны пять выпусков лейтенантов. Для подготовки унтер-офицеров в полках создавались специальные учебные команды.
В течение первых трех лет своего существования подразделения Русского охранного корпуса (охранной группы) несли гарнизонную службу по городам, охраняли шахты, промышленные предприятия и линии железных дорог: штаб и батальон «Белград» дислоцировались в Белграде, 1-й полк — в Лознице и Крупне, 2-й полк — в Кралеве и долине р. Западная Морава, 3-й полк — в Пожаревце, Неготине, Петровце и Майданпеке, 4-й полк — в Алексинце, Боре, Добротиче и Лесковце, 5-й полк — в долине р. Ибр, частью на правом берегу р. Дрина от Вышеграда до Бани Ковылячи. В оперативном отношении корпус был подчинен командующему германскими войсками в Сербии генералу пехоты Г. Фельберу, а его отдельные подразделения — командирам соединений германских и болгарских оккупационных войск, ответственных за тот или иной район. Батальоны и роты были разбросаны иногда совершенно без учета их подчиненности вышестоящим штабам полков и батальонов и часто передавались из подчинения от одних начальников к другим.
В сентябре — октябре 1944 г. отдельные части корпуса (1-й и 3-й батальоны 2-го полка, 3-й батальон 3-го полка, 4-й полк, 2-й батальон 5-го полка, батальон «Белград») принимали участие в боях против войск советской 57-й армии. В результате понесенных потерь (1-й батальон 2-го полка и 3-й батальон 3-го полка были почти полностью уничтожены) указанные части, а также 1-й батальон 3-го полка к 22 декабря 1944 г. были сведены в новый 4-й полк (1-й, 2-й, 3-й батальоны, охранная рота, взводы связи, артиллерийский, противотанковый, конный, саперный). Потери в боях с партизанами заставили сократить 24 января число батальонов до двух.
Остальные подразделения 5-го (1-й и 3-й батальоны), 2-го (2-й батальон) и 4-го (3-й батальон) полков были сведены в Сводный полк (1-й, 2-й, 3-й батальоны). В состав полка некоторое время входил 1-й запасной батальон генерала А. Н. Черепова, сформированный на основе 2-го батальона 3-го полка. 3 марта 1945 г. Сводный полк был переименован в 5-й и переформирован в два батальона. 1-й Казачий полк, постоянно задействованный в обороне от партизанских формирований рубежа р. Дрина юго-западнее Белграда и первое время несший большие потери, чем остальные полки, был переформирован в два батальона еще 29 сентября 1944 г. В последние дни войны к полку присоединился запасной батальон генерала Черепова, с начала ноября 1944 г. действовавший обособленно.
Возникшие таким образом в ходе боевых действий новые полки были полноценными боевыми частями (еще 10 октября 1944 г. название «охранный корпус» было упразднено как более не соответствующее действительному положению вещей, и до 31 декабря соединение именовалось Русским корпусом в Сербии, а затем — Русским корпусом). Части корпуса были сведены в две группы — Северную (1-й Казачий полк и запасной батальон) и Южную (4-й и 5-й полки), которые активно использовались в оборонительных и наступательных операциях против партизан плечом к плечу с регулярными соединениями Вермахта и войск СС, обеспечивая беспрепятственный отход из Греции войск германской группы армий «Ф».
Капитуляция Германии застала Русский корпус в Словении. Сменивший умершего 30 апреля 1945 г. в Загребе от сердечного приступа генерала Б. А. Штейфона полковник А. И. Рогожин заявил, что никогда не сдаст оружия советским представителям или титовцам и будет пробиваться в Австрию к англичанам. В течение четырехдней части корпуса (всего около 4500 человек) по отдельности прорвались в Австрию и 12 мая в районе Клагенфурта капитулировали перед британскими войсками. В лагере Келлерберг, куда был переведен весь личный состав корпуса, был создан Союз чинов Русского корпуса, перешедший на беженское положение{1140}. Четыре года спустя большинство бывших солдат и офицеров корпуса перебралось в Аргентину и США. За весь период войны через Русский корпус прошло 17 090 человек, из которых 1132 погибли в боях{1141}. Из указанного общего числа чинов корпуса примерно 11,5 тыс. составляли эмигранты, а остальные были советскими гражданами.