Иоанн Павел II начал свой экуменический процесс во время «Года Искупления» (1983-1984гг.), в котором символически отмечалась Церковью 1950-я годовщина искупительной смерти Иисуса Христа.
Первые шаги папа сделал в отношении лютеран. Он написал письмо кардиналу Йоханнесу Виллебранту, президенту Секретариата христианского единства, в котором поздравлял его с 500-летием со дня рождения Мартина Лютера. 11 ноября Папа стал первым из понтификов, посетившим лютеранскую Церковь (в Риме), где принял участие в экуменической литургии мира и молился за всех присутствующих. Кроме этого в «Святой Год» Иоанн Павел II принял ряд попыток экуменического согласия с Восточным Христианством. 16 апреля 1983 года он принял у себя Гарегина Саркисяна из Киликии, Святейшего Католикоса Всех Армян. Месяц спустя, официальный визит нанёс Православный Патриарх Антиохи Игнатиус IV Хасим. Также в этот год в Ватикан прибыл Моран Мар Базилеус Мартома Матеус I, Катоколис Сирийской Православной Церкви в Индии. После папа встречался с митрополитом Мелитоном из Халкидона, представителем Вселенского Патриархата Димитроса, они вместе, уже традиционно отпраздновали день почитания святых Петра и Павла. 22 января 1984 года Иоанн Павел II предпринял свой первый официальный визит в общину цыган в римской Церкви Святой Риты.
Выступая в Женеве на Всемирном Совете Церквей (ВСЦ) в 1983 году кроме вопросов, связанных с внешней политиков, папа обсуждал роль общины в экуменическом движении и подчёркивал необходимость соблюдения религиозных свобод, которые не занимали достаточно значимого места в повестке дня ВСЦ. Папа настаивал, что христианские сообщества не должны поддерживать насилие как средство достижения социальных перемен. Оставшиеся дни визита в Швейцарии прошли очень трудно. Президент Швейцарской федерации протестантских церквей не мог достаточно поднять дух экуменической встречи. Он предполагал, что совместная молитва верующих будет бессмысленна без таинства Евхаристии. Кроме этого, наряду с Австрией и Германией, Швейцария сохраняла враждебность по отношению к папе.
13 апреля 1986 года впервые с апостольских времён Иоанн Павел II посетил синагогу (в Риме) и приветствовал иудеев. Папа обладал особой чувствительностью к боли, которую пришлось испытать евреям, к драме жизни еврейского народа в двадцатом веке. Данная встреча стала реальным, а не протокольным событием. Это событие ознаменовало конец одной и начала другой эпохи. Период раздумий над иудейско – католическими отношениями, начало которого было связано с работой Второго Ватиканского Собора, привёл ко многим важным переменам. «Nostra Aetate» – документ Второго Ватиканского Собора под названием «Декларация об отношениях Церкви с нехристианскими религиями», открыла новые взаимоотношения католицизма и иудаизма. Иоанн Павел II пытался закрепить достигнутое ранее и продвигаться дальше.
1985 год был назван Международным годом молодёжи, проходившим под эгидой ООН. Папа предпринял замечательную инициативу – организацию Всемирных дней молодежи, которые в дальнейшем стали привлекать миллионы молодых людей в паломничества в Европу, Латинскую Америку, Северную Америку и Азию. Идея Всемирного дня молодёжи окончательно оформилась во время молодёжной встречи в «Святой Год» в Риме в Вербное воскресение 1984 года. Предложение было с радостью поддержано. Вербное воскресение 1986 года – первый официальный Всемирный день молодёжи прошёл в Риме, праздновать его в дальнейшем полагалось в различных епархиях мира во главе с папой. С 1987 года встречи молодежи проводились один раз в два года на международном уровне. И ежегодно на поместном и епархиальном уровне. Так встречи состоялись в Буэнос – Айросе (1987г.), Сантьяго-де-Компостела (1989г.), в Ченстохове (1991г), Денвере (1993г.), на Филиппинах в Маниле (1995г., данная встреча собрала самое большое количество молодых людей – 5 мил. 500 тыс. человек), Париже (1997г.), Риме (2000г.), Торонто (2002г.). Юбилейная, двадцатая встреча молодёжи прошла уже после смерти Иоанна Павла II в Кёльне, в 2005 году.
Празднование Всемирного дня молодёжи ускорило ритм Католической Церкви. Одной из важных встреч Иоанна Павла II была встреча с молодыми мусульманами в Касабланке, Марокко, в августе 1985г. Это было беспрецедентное событие. Папа официально обратился к мусульманской аудитории по приглашению мусульманского лидера, произошло это в последний день паломничества папы в Африке. В ходе этой миссии понтифик также посетил Того, Берег Слоновой Кости, Камерун, Центральную Африканскую Республику, Заир и Кению, где принимал участие в Международном евхаристическом конгрессе, проходившем в Найроби. Остановка в Касабланке была сделана по личному приглашению Короля Марокко Хасана II, который пригласил папу ещё во время королевского визита в Ватикан. Иоанн Павел II принял это приглашение: этот визит стал первым и единственным официальным приглашением, заключённым между Святым Престолом и исламским государством. В письме Короля Хасана II говорилось, что Католическая Церковь в Марокко может проводить богослужения и осуществлять религиозное образование и что церкви и католические школы освобождаются от налогообложения. Католической Церкви предоставляется полный контроль над её внутренними делами в Марокко. Церковь могла получать финансовую помощь как внутри страны, так и из-за рубежа и управлять своими собственными финансовыми делами. Была разрешена также деятельность католических благотворительных объединений.
Иоанн Павел II в начале 1986 года посетил Индию. Папа много раз пересекал этот огромный субконтинент, начав с Дели и посетил Калькутту, ранчи, Шиллонг, Мадрас, Гоа, Мангалупу, Тричур, Кочин, Эрнакулам, Вераполи, Бомбей и т.д. В день прибытия в Индию понтифик посетил место кремирования Махатмы Ганди (1948г) и вознёс молитву заповедей блаженств. Христианская служба для бедных была постоянной темой проповедей Иоанна Павла II. Так он встретился с матерью Терезой, которая за долгие годы своей деятельности привела около пятидесяти тысяч больных индейцев, живших под открытым небом, в созданный ею «Дом чистого сердца». Дружба между Папой – поляком и монахиней родом из Албании была глубокой и проникновенной: они понимали друг друга без слов. Для папы мать Тереза была воплощенным «живым посланием» современному миру. Поражало то, что основанная Терезой община религиозных женщин, преданных своему трудному делу, процветала и расширялась, в то время как другие общины распадались. Иоанн Павел II решил, что данное свидетельство должно быть увидено в Риме. Позже папа создал в Ватикане приют «Dono di Maria» (Дар Марии), который был открыт 20 мая 1988 года. То, что благотворительная община матери Терезы успешно функционировала в Индии, где христиане составляли меньшинство религиозного населения, придало Католической Церкви значимость в индийском обществе. Мать Тереза и её сёстры воплощали два общих качества – сострадание и глубокое уважение к человеческому достоинству бедных. Они реализовали эти общие, универсальные христианские качества в своей конкретной, частной работе. Одной из ярких новаторских инициатив Иоанна Павла II был Всемирный день молитвы о мире с участием некатолических и нехристианских религиозных лидеров со всего мира. Противники в Курии по данной инициативе считали, что такая общая молитва означает синкретизм. Однако, для папы, собраться вместе для молитвы означало нечто иное. Комиссия по справедливости и миру выработала процедуру, согласно которой каждый участник мог молиться по – своему и затем соединиться с остальными. Также рассматривалась идея поста и паломничества. Всемирный день молитвы состоялся 27 октября 1986 года в Ассизи (Италия). Эта встреча имела огромный успех и в будущем проводилась ещё в 1999 и 2001 гг.
Второй Ватиканский Собор породил больше всего надежд на перспективу экуменического диалога между как католиками и англиканами. Эти надежды основывались на историческом предположении, что английская реформация фундаментально отличается от Реформации в остальной Европе. В противоположность разделению католиков с лютеранами и реформистскими христианами в континентальной Европе, полагали некоторые, не было трудностей в вероучении, разделявшем Церкви Рима и Англии теперь, в XXв., поскольку подобное разделение в XVIв. было скорее политическим, нежели религиозным. Эта точка зрения подтверждалась возникновением в XIXв. англо-католического движения, утверждавшего, что англиканство, как и римское католичество и восточное православие, были ветвями одной католической Церкви. Диалог англиканства с римским католичеством имел за собой большую историю, включая «Конференцию Малинеса» в Бельгии в 1920-х гг., возглавлявшуюся лордом Галифаксом и Примасом Бельгии, кардиналом Дезире Мерсьером. Память об этих первоначальных попытках восстановления единства привела к диалогу, формально установленному после Второго Ватиканского Собора под эгидой Англиканско-Римской католической международной комиссии (ARCIC).