Иоанн вскоре нанес визит новому Папе. Он встречался с Пьером Роже еще в 1340 г., возвращаясь из Монпелье, когда тот был просто самым влиятельным кардиналом курии. Мы не знаем, о чем они тогда говорили. Не знаем мы и того, о чем они говорили в июле 1342 г. Нельзя утверждать, что в тот период Иоанн выдвинул кандидатуру своего сына в преемники Людовику Баварскому. Филипп VI был еще связан с императором договором о дружбе, заключенным в прошлом году, и вряд ли Иоанн захотел бы действовать вразрез с дипломатией французского короля. Видимо, Климент VI только обещал ему не прощать Людовика, не добившись значительных уступок Люксембургам, то есть, вероятно, не обеспечив решение вопроса о наследстве Генриха Каринтийского в пользу Иоанна-Генриха.
Авторитет Людовика Баварского в Германии сильно упал. Тирольское дело оттолкнуло от него многих князей, и вновь встал вопрос о лишении его императорского достоинства. Стали искать ему преемников; некоторые подумывали о другом баварце, племяннике Людовика, пфальцграфе Рудольфе. Похоже, какое-то время Иоанн Чешский не возражал против этого проекта, поскольку 31 августа 1342 г. он беседовал с пфальцграфом. Но тот, боясь своего дяди, в конце концов отклонил предложение выдвинуть свою кандидатуру в императоры.
Тогда Людовик Баварский понял: если он и дальше пойдет по избранному им пути, его положение может стать очень сложным. Он решил обратиться к Клименту VI. Рассчитывая на поддержку Филиппа Валуа, обещанную последним по Венсеннскому договору 1341 г., он надеялся, что Папа предложит ему условия примирения, разрешив сохранить корону. Это были иллюзии. Филипп VI вел с ним переговоры лишь по особой необходимости; он не слишком стремился поддерживать его в отношениях с Авиньоном. Что до Климента VI, тот был ничуть не склонен прощать Людовика Баварского, если этого не требует король Франции. Однако Папа не ответил резким отказом на обращение Людовика. В октябре 1342 г. начались переговоры, продолжавшиеся до начала 1343 г.
Чтобы иметь больше шансов на успех в общении с Климентом VI, Людовик Баварский попытался примириться с Иоанном Слепым. Не отказываясь от Тироля, он предложил Иоанну-Генриху компенсацию; прежде всего он попробовал улестить отца перспективой брака третьего сына Иоанна, Вацлава, с его дочерью, которая бы получила значительное приданое в двести сорок тысяч марок. У Иоанна была некоторая слабость к сыну Беатрисы, которому предстояло после его смерти возглавить графство Люксембург. Поэтому какое-то время казалось, что он вполне расположен, забыв дурные поступки Виттельсбаха, принять его предложение и повлиять на Климента VI, чтобы тот простил Людовика. Но на деле, то ли под давлением Карла и Иоанна-Генриха, то ли опасаясь вновь стать жертвой недобросовестности императора, Иоанн не оказал эффективного воздействия на Авиньон, и этот проект остался без последствий.
Напротив, Иоанн как будто подтолкнул Папу к разрыву с Людовиком. Двенадцатого апреля 1343 г. буллой «Prolixa rétro» Климент VI, перечислив претензии Римской Церкви к Людовику Баварскому, потребовал от него сложить с себя императорский сан в течение трех месяцев, пригрозив, что в противном случае курфюрстам будет предложено провести новые выборы.
Зиму 1342–1343 гг. Иоанн Слепой провел в своем графстве Люксембург. Этот приезд он использовал, чтобы в марте покончить с распрей из-за Вердена, до сих пор продолжавшейся между ним и Генрихом, графом Бара. Филипп Валуа, втянувшись в упорную борьбу с англичанами, был вынужден устраниться от охраны этого города, и граф Бара воспользовался этим, заменив королевскую охрану своей. Но Иоанн выразил протест. И 10 марта 1343 г. оба графа уладили этот старый спор, разделив поровну свои права, в том числе права собственности, на город и окружающую его территорию.
Немного позже, в начале июля, Иоанн Слепой очень близко сошелся со своим соседом, епископом Льежским. Граф Люксембург и Адольф де ла Марк заключили союз на сорок лет. Цель этого договора состояла в том, чтобы обеспечить взаимопомощь сторон и исключить возможность войны между ними, создав арбитражную комиссию из двенадцати членов, из которых половину должен был назначить граф, а другую — епископ.
Старый борец, каким был Иоанн, теперь, казалось, устал биться. Он искал мира. Он договаривался с соседями. Он не хотел, чтобы его сын Вацлав унаследовал имеете с графством Люксембург какие-то старые проблемы. В то же время он увеличивал доходы и военную мощь своего княжества, покупая слева и справа новых вассалов. Он по-прежнему проявлял расположение к своему милому Люксембургу.