Однако у королевы все еще оставались влиятельные союзники. В Авиньоне, взволнованный известием о капитуляции и заключении Иоанны, Климент отправил эмиссаров в Париж, чтобы оказать давление на Людовика Анжуйского и заставить его выполнить свои обязательства по недавнему соглашению с Неаполем. К январю 1382 года французскому Папе удалось вырвать у герцога обещание, что армия будет собрана и готова отправиться в Италию к 1 мая. То, что на этот раз Людовик был настроен серьезно, стало ясно, когда герцог Анжуйский покинул свой пост регента в Париже и отправился в Авиньон на встречу с Папой, куда прибыл 22 февраля. В ходе этих переговоров был достигнут достаточный прогресс, чтобы на следующей неделе Климент официально присвоил Людовику титул герцога Калабрийского и направил усилия Церкви на сбор денег для оплаты армии, достаточной для победы над венграми.
Карл Дураццо с некоторой тревогой наблюдал за приготовлениями французов к нападению на Неаполь. Поэтому тюрьма в Ночере внезапно была признана недостаточно надежной на случай попытки освобождения королевы. 28 марта 1382 года новый король Неаполя приказал снова перевезти Иоанну, на этот раз в заброшенный замок Муро, расположенный в отдаленном горном районе Апеннин в Базиликате, недалеко от Венозы, примерно на полпути между Неаполем и Бари. Оттон также был переведен из столицы в укрепленный замок Альтамура, расположенный в Апулии, рядом с городом Бари.
С этим новым переводом положение Иоанны тревожно ухудшилось. В качестве надзирателя в замке Муро Карл назначил Паламедо Боццуто, неаполитанского капитана, который сыграл важную роль в открытии ворот Неаполя перед венграми. Паламедо был яростным сторонником Урбана, а его брат Лодовико, при Карле, вернул себе пост архиепископа Неаполитанского. За то что Иоанна оказывала поддержку Клименту, тюремщик относился к ней с презрением, и в какой-то момент сорвал с ее пальцев все кольца. Еда была скудной и некачественной, и даже этого, по прихоти мучителя, ее могли лишить в любой момент. Королева не видела никого, кроме Паламедо, своей фрейлины и трех слуг.
Однако время играло против венгров. Иоанна в своем заключении не могла этого знать, но помощь была уже на подходе. При поддержке Климента Людовик Анжуйский собрал внушительную армию и 13 июня 1382 года повел свои войска из Карпантра в сторону Италии. Хотя Флоренция, Болонья и Генуя остались верны Урбану и отказались поддержать вторжение, Людовику и Клименту удалось убедить графов Савойских и миланскую семью Висконти предоставить людей и оружие, в результате чего собралась огромная сила — около 60.000 человек (по оценке самого Людовика), самая большая армия, когда-либо пересекавшая Альпы, хотя более поздние хронисты считают, что эта цифра ближе к 15.000. Из-за расходов, которые включали наем солдат и поощрение итальянцев на дезертирство от Урбана, хронисты считали, что герцог Анжуйский вез с собой больше золота, чем можно было найти в хранилищах богатого города Милана. Теперь война была неизбежна, и перевес в людях и деньгах был на стороне союзников королевы, которую большинство Европы по-прежнему признавало законной королевой Неаполя.
Однако все это подписало ей смертный приговор. Без Иоанны законные притязания Карла на королевство были гораздо сильнее. Он был прямым потомком основателя династии, Карла Анжуйского, как и его жена Маргарита, племянница королевы. Подданные Иоанны с гораздо большей вероятностью признали бы, а фактически уже признали, Карла и Маргариту в качестве правителей, чем поддержали бы притязания французского принца. Однако если бы королева осталась жива и была бы освобождена из плена, она, несомненно, узаконила бы притязания герцога Анжуйского и, возможно, изменила бы отношение народа к Карлу, особенно если бы стало известно о плохом с ней обращении.
27 июля 1382 года, когда армия герцога Анжуйского двигалась через Италию, чтобы ее спасти, Иоанна I, королева Неаполя, Сицилии и Иерусалима и графиня Прованса, была тайно убита в замке Муро. Хотя Карл Дураццо в своем официальном заявлении утверждал, что ее смерть наступила по естественным причинам, другие документальные источники единодушно утверждают, что королева была убита. Поскольку убийство было совершено тайно, в отдаленном месте, рассказы о том, как она окончила свой жизненный путь, разнятся. Как и в случае с любым сенсационным событием, хронисты, возможно, были склонны к преувеличениям, а иногда и к откровенным фантазиям. Одни говорят, что ее отравили, другие — что она умерла от голода. Поскольку при этом присутствовали только Иоанна и ее убийцы, невозможно однозначно сказать, какой из этих разноречивых рассказов верен. Тем не менее, среди множества слухов можно выделить две версии, обладающие некоторой степенью достоверности.