О секретаре Сенявине, находившемся при навигаторах в Лондоне, Львов в своем рапорте доносил, что «…он теперь укрывается и дело свое покинул, хотят убить до смерти!… Хотя бы вы изволили прислать 50 000 фунтов, я чаю, мало будет на английских навигаторов».
Безусловно, нервы и здоровье князю Львову портила лишь небольшая «элитная» группа навигаторов, попавших из России в Лондон, с его соблазнами и роскошью. Большая же часть выпускников Навигацкой школы, по отзывам князя Львова, ответственно занималась своим делом, успешно овладевала практическими навыками на военных английских кораблях и получила прекрасные аттестации от морских капитанов, высоко оценивших знания и способности молодых русских моряков. Именно эта группа навигаторов впоследствии достигла высоких морских чинов и принесла отечеству и его флоту огромную пользу. Из их числа вышли сын учителя Петра Великого – Никиты Зотова (князя Папы) – контр-адмирал Конан Зотов, Николай Федорович Головин – адмирал и президент Адмиралтейств-коллегии, князь Михаил Михайлович Голицин – генерал-адмирал, Федор Иванович Соймонов – известный гидрограф и писатель, адмиралы Белосельский, Калмыков, Лопухин, Дмитриев-Мамонов, Шереметев и многие другие.
Князь Львов, писавший отчаянные донесения в Россию, сумел все же эффективно и четко выполнить возложенные на него обязанности по руководству морской практикой навигаторов. Его опыт и умение позволили обеспечить курсантам за границей необходимые условия обучения и проживания и благополучно завершить тяжелую морскую практику на иностранных военных кораблях. Впоследствии князь обратился к российскому императору с довольно обоснованным советом об экономической и деловой целесообразности проведения последующей морской практики навигаторов на отечественных военных кораблях под руководством опытных российских офицеров. Одобрив разумные доводы князя, Петр I все же признал их преждевременными. Это деловое предложение реализовали значительно позже, после успехов, достигнутых русским флотом в Северной войне.
В период своего основания Навигацкая школа в Москве находилась в ведении Оружейной палаты. Куратором первого военно-морского учебного заведения являлся тогда боярин Ф.А. Головин «с товарищи». После его смерти в 1706 году учебное заведение передали в ведение Приказа Морского флота и его руководителя генерал-адмирала графа Ф.М. Апраксина. В 1712 году «главный надзор» за школой осуществляла Адмиралтейская канцелярия Адмиралтейств-коллегии. После перевода Школы математических и навигацких наук в Морское ведомство ее стали опекать и контролировать люди, сведущие в делах флота.
Навигацкая школа за период своего 15–летнего существования, вынеся на себе всю тяжесть нового дела, стала своеобразной колыбелью российского флота, выпустив из своих стен первых отечественных морских офицеров и специалистов. Благодаря активной работе педагогов и воспитателей этого учебного заведения полностью отпала необходимость в найме на корабли Балтийского флота дорогостоящих иностранных моряков и специалистов. Создание Навигацкой школы, кроме того, позволило разрушить предрассудки и вековые убеждения о вреде заморской науки. Первая светская школа способствовала распространению в стране просвещения. Из нее вышли первые учителя грамоты и «цифири», заполнившие вакансии во вновь открытых губернских учебных заведениях.
Благодаря трудам подготовленных в стенах школы геодезистов Россия обрела свои географические карты. Их труды впоследствии легли в основу работы по составлению первого атласа Российской империи, изданного воспитанником Навигацкой школы, обер-секретарем Сената И.К. Кирилловым.
Безусловно, деятельность этого учебного заведения не исключала досадных ошибок и недостатков, но историческое значение Школы математических и навигацких наук на Сухаревке неоспоримо.
Кроме того, не следует забывать, что учебное заведение существовало в те темные времена, когда люди искренне верили в пса с рогами – антихриста, а про научные книги говорили и писали: «Если кто спросит – знаешь ли ты философию, ты ему скажи: греческих древностей не учил, красноречивых астрономов не читал, философии никогда в глаза не видел, учу же книги священного закона, которые могли бы мою грешную душу спасти перед Богом».
Необходимо также помнить, что первое военно-морское училище работало в Москве, преодолевая невежество и дремучую отсталость русских обывателей, когда знатные фамилии и боярские роды особенно отрицательно относились к его деятельности. В тесном семейном кругу за крепкими дубовыми воротами в те времена на все лады доставалось «немецкому барабанщику», царю Петру, задумавшему новое дело «для Бога мерзностное». Из уст в уста передавался в те времена по Москве вещий сон царицы Марфы про Петра-антихриста и утверждение сторожа при Сухаревой башне про «книгу черную», которую 12 духов стерегут, и про диковинный дым над домом графа Брюсова, и про трубы «диавольские», сквозь кои немецкие колдуны днем и ночью смотрят в небо. Вспоминали с сожалением о недавнем добром времени, когда самого боярина Матвеева не пожалели: не будь чернокнижником, не читай лечебников с аптекарскими знаками; не зря и «аглицкого иноверца» чуть на плаху не отправили за «долбицу», оказавшуюся таблицею логарифмов, а теперь?.. Бояре крестились набожно и молились усердно о спасении от надвигающейся гибели, от царства антихриста.