Особое место в Тибетской буддо-йогической литературе занимает эзотерическая система Калачакра — Колесо Времени, по другой версии перевода — Колесо Закона. С распространением этого учения в Индии и Тибете начинается новый период развития Северного буддизма Махаяны и Ваджраяны и, в частности, йогической практики. Однако, мы полагаем, что не следует полностью отждествлять древнее эзотерическое учение Калачакра и его тибетский вариант, тоже глубоко сокровенный, но возникший значительно позже и, вероятно, все же не всегда исчерпывающий эзотерическую квинтэссенцию архидревней Калачакры, как Учения Владык Мудрости.
Ю.Н. Рерих отмечал, что система Калачакра теснейшим образом связана с Шамбалой, таинственной Обителью Архатов и Махатм, откуда она была принесена в Индию во второй половине Х века, а чуть позже, в XI веке, и в Тибет [57, с.72]. По его мнению, авторство целого ряда трудов по Калачакре-мулатантре принадлежало различным Правителям Шамбалы [57, с.72]. Аналогичную мысль проводила и Е.И. Рерих: учение Калачакра «есть Великое Откровение, — писала она, — принесенное человечеству Владыками Пламени, или Сынами Разума (которые были и есть Владыки Шамбалы)…» [31, т.1, с.351]. Не исключено, что именно этой особенностью объясняется значение идей Калачакры для философии и практики духовной трансформации человека, то есть йоги.
Важную роль в развитии тибетской буддийской йоги в период с VIII по XV вв. сыграли индийские учителя тантрического буддизма Падма Самбхава, Атиша, Тилопа и Наропа; а также ученик Наропы, тибетский духовный подвижник, поэт и переводчик Миларепа; ученик Миларепы, основатель манашеского ордена Карджиут-па Гампо-па; ученик Атиши, основатель манашеского ордена Кадам-па Домтон; философ и реформатор Цзонг к’апа (Цзонхава).
В этот же период методы йоги в своей религиозной практике начинают использовать некоторые последователи ислама и христианства. Среди различных течений ислама, вероятно, самое сильное влияние йоги на себе испытал суфизм. Это неортодоксальное мистическое направление зарождается в недрах раннего ислама в VII–VIII веках как реакция на официальный ислам, лидеры которого политическим завоеваниям и материальному благополучию начинают уделять больше внимания, чем духовному совершенствованию. Подобно индийским йогам суфии не отвергали религиозный культ, но полагали, что ритуальные богослужения и обряды имеют весьма незначительную ценность по сравнению с личным внутренним опытом духовного преображения. Они уважали традицию духовного наставничества, использовали медитации с постоянным повторением имени Бога и других сакральных формул, аскетическую практику, специальные танцы и стремились к достижению внутреннего озарения и слияния с Богом. К числу известных средневековых последователей суфизма принадлежали Аль-Басри, Абу аль-Мухасиби, Абу Язид, Джунайд, Халладж. Чуть позже, в XII–XIII веках идеи суфизма поддержали такие крупные арабские мыслители как Газали, Сухраварди, Ибн аль-Араби.
Если суфизм можно считать определенной разновидностью йоги в лоне культурно-религиозной традиции ислама, то исихазм — почти то же самое в религиозной традиции восточного христианства. Понятие «исихазм» происходит от греческого «исихия», что означает безмолвие, «покой» или «отрешенность». Характерные элементы исихазма — строгий аскетизм и практика «умной молитвы» (в уме) — то есть многократное мысленное повторение определенной сакральной фразы. Историки полагают, что подобная практика в христианстве сложилась под влиянием древних египетских и синайских аскетов, которые жили в пустынях уединенно подобно индийским отшельникам и, вероятно, были знакомы с элементами йоги.